小細(xì)胞肺癌中轉(zhuǎn)錄因子E2F1調(diào)控的靶基因(英文)
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【摘要】:本研究組前期研究結(jié)果表明,轉(zhuǎn)錄因子E2F1在大約95%的小細(xì)胞肺癌組織中表達(dá)上調(diào),而且與其浸潤、轉(zhuǎn)移密切相關(guān),但是E2F1在小細(xì)胞肺癌中調(diào)控的靶基因未見報(bào)道。本研究旨在探索E2F1在小細(xì)胞肺癌細(xì)胞株H1688中調(diào)控的靶基因。染色體免疫共沉淀聯(lián)合測序(chromatin immunoprecipitation sequencing,Ch IP-seq)結(jié)果顯示,在小細(xì)胞肺癌H1688細(xì)胞中,E2F1能夠調(diào)控5 326個(gè)靶基因的表達(dá),其中4 700個(gè)是結(jié)構(gòu)基因,626個(gè)基因編碼長鏈非編碼RNA。基因功能注釋(gene ontology,GO)和基因富集圖譜(enrichment map)分析顯示,E2F1調(diào)控的靶基因功能主要集中在3個(gè)方面:細(xì)胞周期調(diào)控、染色體和組蛋白修飾以及蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)。MEME4.7.0軟件分析顯示,E2F1通過結(jié)合6個(gè)序列調(diào)控相關(guān)靶基因和長鏈非編碼序列的表達(dá)。以上結(jié)果闡明了E2F1在小細(xì)胞肺癌中調(diào)控的靶基因,為進(jìn)一步研究E2F1在小細(xì)胞肺癌發(fā)生、發(fā)展、浸潤與轉(zhuǎn)移、復(fù)發(fā)和耐藥中的作用提供了實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
【作者單位】: 濱州醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室;
【基金】:supported by the National Natural Science Foundation of China(No.81302017) Natural Science Foundation of Shandong Province,China(No.ZR2013HL004)
【分類號】:R734.2
【正文快照】: This work was supported by the National Natural Science Foundation of China(No.81302017)and Natural Science Foundation ofShandong Province,China(No.ZR2013HL004).Transcription factor E2F1,a well-documented regulatorof cellular proliferation and apoptosis,
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