本文關(guān)鍵詞：民豬FoxN1基因的克隆及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：試驗(yàn)旨在對(duì)民豬FoxN1基因的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行初步探索。利用常規(guī)PCR技術(shù)對(duì)民豬FoxN1基因進(jìn)行克隆,利用生物信息學(xué)手段對(duì)所獲得FoxN1基因完整編碼區(qū)序列進(jìn)行分析,對(duì)民豬和大白豬的FoxN1基因序列進(jìn)行比對(duì),并構(gòu)建分子進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果顯示,民豬FoxN1基因完整編碼區(qū)長(zhǎng)1 941bp,編碼646個(gè)氨基酸,分子質(zhì)量為68.64ku,理論等電點(diǎn)為5.81。FoxN1蛋白位于細(xì)胞核內(nèi),不存在信號(hào)肽,不是分泌性蛋白,不存在跨膜區(qū),在第269—347氨基酸處有1個(gè)叉頭結(jié)構(gòu)域,該蛋白在不同的物種間有高度的保守性�？寺“l(fā)現(xiàn)了3種轉(zhuǎn)錄剪切變異體,與變異體1相比,變異體2在第124—387核苷酸位置處發(fā)生缺失,變異體3在581—582處發(fā)生GCA插入。民豬與大白豬的FoxN1基因序列相比,存在4個(gè)突變位點(diǎn),其中3個(gè)是同義突變,1個(gè)是錯(cuò)義突變,導(dǎo)致第108位的氨基酸發(fā)生了改變。由分子進(jìn)化樹(shù)得知,民豬與偶蹄目動(dòng)物親緣關(guān)系較近。上述結(jié)果表明FoxN1基因結(jié)構(gòu)復(fù)雜,對(duì)其生物信息特性的探究將為進(jìn)一步揭示民豬FoxN1基因的功能提供依據(jù)。
【作者單位】： 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧研究所;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31301955) 黑龍江省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(C201312) 國(guó)家生豬產(chǎn)業(yè)體系崗位科學(xué)家(CARS-36)
【分類號(hào)】：S828
【正文快照】： Forkhead轉(zhuǎn)錄因子家族是一組翼狀螺旋/叉頭型轉(zhuǎn)錄因子家族,包含一個(gè)特有的Forkhead DNA結(jié)合域。在人類已發(fā)現(xiàn)20多種Forkhead基因,其在胚胎發(fā)育特別是在內(nèi)胚層發(fā)育、內(nèi)胚層來(lái)源的器官形成中發(fā)揮關(guān)鍵性的調(diào)控作用。叉頭蛋白N1(Forkhead box protein N1,FoxN1)是Forkhead轉(zhuǎn)錄因子

【相似文獻(xiàn)】

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4 董云峰;蘭西加快民豬產(chǎn)業(yè)化進(jìn)程[N];綏化日?qǐng)?bào);2013年

5 董云峰 彭飛;蘭西做活民豬產(chǎn)業(yè)大文章[N];綏化日?qǐng)?bào);2013年

6 董云峰;黑龍江蘭西扶持“民豬”產(chǎn)業(yè)打出組合拳[N];中國(guó)畜牧獸醫(yī)報(bào);2013年

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本文編號(hào)：1166023