綿羊GDF9基因mRNA、DNA和調(diào)控區(qū)序列克隆及其在11個(gè)品種中遺傳多態(tài)性檢測(cè)
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【摘要】:本研究旨在克隆綿羊生長(zhǎng)分化因子9(Growth differentiation factor 9,GDF9)基因mRNA、DNA和調(diào)控區(qū)全序列,并檢測(cè)其在11個(gè)綿羊品種中的遺傳多態(tài)性,探究GDF9基因與綿羊多羔性狀的關(guān)系。首先應(yīng)用RACE和PCR技術(shù)克隆GDF9基因全長(zhǎng)序列,其次利用SNaPshot分型技術(shù)檢測(cè)11個(gè)綿羊品種GDF9基因遺傳多態(tài)性。結(jié)果顯示,克隆獲得GDF9基因mRNA全長(zhǎng)1 852bp(GenBank序列號(hào):KR063137),編碼區(qū)兩側(cè)翼分別具有5′-UTR58bp(1~58nt)和3′-UTR 432bp(1 421~1 852nt)。進(jìn)一步克隆獲得長(zhǎng)為2 898bp的DNA序列和2 304bp的調(diào)控區(qū)序列,分析發(fā)現(xiàn)調(diào)控區(qū)序列比數(shù)據(jù)庫(kù)序列(NC_019462.1)多兩個(gè)長(zhǎng)片段。序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)了已知突變G260A(G1)和調(diào)控區(qū)新突變-2078CG。分型結(jié)果顯示,11個(gè)綿羊品種均不含F(xiàn)ecGE、FecGH、FecGT、FecGF、FecGV突變,而G260A和-2078CG廣泛存在于除草原型藏羊外的各綿羊品種中,G260A表現(xiàn)3種基因型(AA、BB和AB),首次在小尾寒羊和山谷型藏羊中檢測(cè)到BB型突變純合子。-2078CG也存在3種基因型,基因型結(jié)果表明該位點(diǎn)與G260A完全連鎖。關(guān)聯(lián)分析結(jié)果顯示,小尾寒羊AB型產(chǎn)羔數(shù)顯著高于AA型(P0.05)。本研究完善了綿羊GDF9mRNA、DNA和調(diào)控區(qū)全長(zhǎng)序列,為進(jìn)一步研究GDF9基因功能奠定了基礎(chǔ)。同時(shí)在不同綿羊品種中發(fā)現(xiàn)了G260A和-2078CG突變,其中G260A作為潛在的有效遺傳標(biāo)記可用于提高綿羊的產(chǎn)羔數(shù)。
【作者單位】: 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所農(nóng)業(yè)部畜禽遺傳資源與種質(zhì)創(chuàng)新重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程(ASTIP-IAS13) 國(guó)家肉羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(xiàng)(CARS-39) 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31472078) 國(guó)家轉(zhuǎn)基因科技重大專項(xiàng)(2016ZX08009-003-006,2016ZX08010-005-003) 內(nèi)蒙古自治區(qū)戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)發(fā)展專項(xiàng)資金計(jì)劃
【分類號(hào)】:S826
【正文快照】: 產(chǎn)羔數(shù)是綿羊最重要的繁殖性狀。作為轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β超家族的一員,GDF9(Growth differentia-tion factor 9)通過(guò)旁分泌方式對(duì)卵泡的生長(zhǎng)和分化起著重要作用[1-6],并在提高綿羊產(chǎn)羔數(shù)中扮演著重要角色。綿羊GDF9基因位于5號(hào)染色體[7],其包含2個(gè)外顯子和1個(gè)內(nèi)含子,編碼456個(gè)氨基
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1154123
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