中粒咖啡萜類(lèi)合成酶基因家族的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-11-07 20:07
本文關(guān)鍵詞:中?Х容祁(lèi)合成酶基因家族的生物信息學(xué)分析
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【摘要】:萜類(lèi)化合物具有重要的生理、生態(tài)作用和藥用價(jià)值,萜類(lèi)合成酶(TPS)是合成萜類(lèi)化合物的關(guān)鍵酶。通過(guò)整合中?Х(Coffee canephora)的基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)方法,鑒定出43個(gè)萜類(lèi)合成酶全長(zhǎng)基因,并對(duì)這些基因的分子進(jìn)化、結(jié)構(gòu)、復(fù)制、表達(dá)及功能分化的機(jī)理進(jìn)行了探究。結(jié)果表明,中粒咖啡萜類(lèi)合成酶基因可以分為5個(gè)亞家族(a、b、c、e/f、g),不同亞家族的基因結(jié)構(gòu)差異很大;串聯(lián)復(fù)制是基因家族擴(kuò)增的主要原因;表達(dá)分析結(jié)果表明,萜類(lèi)合成酶基因在不同組織中的表達(dá)差異明顯;中?Х容祁(lèi)合成酶基因啟動(dòng)子區(qū)的順式調(diào)控元件可能與基因的功能分化相關(guān);不同亞家族之間的功能差異主要由亞家族特異的氨基酸決定。
【作者單位】: 陜西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(No.31370329) 中央高校基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)(No.GK201403004)
【分類(lèi)號(hào)】:Q943.2
【正文快照】: 程甜,魏強(qiáng),李廣林(2016).中?Х容祁(lèi)合成酶基因家族的生物信息學(xué)分析.植物學(xué)報(bào)51,235 250.萜類(lèi)化合物(terpenoid)是植物代謝產(chǎn)物中種類(lèi)最多、結(jié)構(gòu)最為復(fù)雜的天然產(chǎn)物,根據(jù)組成萜類(lèi)化合物的異戊二烯(isoprene,C5)單元數(shù)的不同,萜類(lèi)化合物可分為單萜(monoterpene,C10)、倍半
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1 黃燕;王一凡;蘭芹英;;咖啡屬不同品種脫水耐性的研究[A];第二屆全國(guó)種子科學(xué)與技術(shù)學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要集[C];2011年
,本文編號(hào):1153911
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