綿羊Wnt10b基因克隆及生物信息學(xué)分析
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【摘要】:Wnt10b是Wnt家族中重要成員之一,綿羊Wnt10b基因尚屬未知。本研究利用RT-PCR和RACE技術(shù)克隆了綿羊Wnt10b基因的全序列,并對該基因進(jìn)行了比較全面的生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:綿羊Wnt10b基因序列全長2321 bp,包括1116 bp的編碼區(qū)序列,編碼391個氨基酸;其可變剪接體Wnt10b-AS由于CDS序列部分缺失編碼166個氨基酸。同源性分析發(fā)現(xiàn),綿羊Wnt10b基因核苷酸和氨基酸序列與其它哺乳動物同源性較高。氨基酸序列分析發(fā)現(xiàn)該蛋白為親水性不穩(wěn)定蛋白,相對分子量為43.0254 k Da。預(yù)測含有6個磷酸化位點,5個豆蔻;稽c,二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲和α螺旋為主。生物信息學(xué)分析表明Wnt10b及Wnt10-AS均為分泌型跨膜蛋白,主要存在細(xì)胞外基質(zhì)中,通過與細(xì)胞膜上受體結(jié)合,調(diào)控下游靶基因的表達(dá)。Wnt10b-AS由于缺失多個翻譯后修飾位點,可能通過與主轉(zhuǎn)錄本不同的作用機(jī)制發(fā)揮生物學(xué)功能。本研究為進(jìn)一步探討Wnt10b基因在綿羊毛囊生長發(fā)育中的功能和作用機(jī)制奠定了信息學(xué)基礎(chǔ)。
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院動物遺傳資源與分子育種實驗室;
【關(guān)鍵詞】: Wntb 綿羊 生物信息學(xué)分析
【基金】:國家轉(zhuǎn)基因重大專項"高產(chǎn)超細(xì)毛轉(zhuǎn)基因羊新品種培育"(2014ZX08008-001,2013ZX08008-001)
【分類號】:S826.2
【正文快照】: 20世紀(jì)90年代初,世界羊毛產(chǎn)量顯著萎縮。與此同時,世界各國開始注重對細(xì)毛羊和超細(xì)毛羊品種的選育。我國從19世紀(jì)初開始引入美利奴綿羊,終于在1985年育成“中國美利奴”,實現(xiàn)了我國細(xì)毛羊品種質(zhì)的飛躍。我國是世界羊毛生產(chǎn)大國,由于對毛用羊優(yōu)良品種改良和選育工作缺乏持續(xù)性,
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,本文編號:1115281
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