本文關(guān)鍵詞：機(jī)器學(xué)習(xí)方法在基因功能注釋中的應(yīng)用

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【摘要】：目前,基于計(jì)算機(jī)數(shù)學(xué)方法對(duì)基因的功能注釋已成為熱點(diǎn)及挑戰(zhàn),其中以機(jī)器學(xué)習(xí)方法應(yīng)用最為廣泛。生物信息學(xué)家不斷提出有效、快速、準(zhǔn)確的機(jī)器學(xué)習(xí)方法用于基因功能的注釋,極大促進(jìn)了生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展。本文就關(guān)于機(jī)器學(xué)習(xí)方法在基因功能注釋的應(yīng)用與進(jìn)展作一綜述。主要介紹幾種常用的方法,包括支持向量機(jī)、k近鄰算法、決策樹(shù)、隨機(jī)森林、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、馬爾科夫隨機(jī)場(chǎng)、logistic回歸、聚類(lèi)算法和貝葉斯分類(lèi)器,并對(duì)目前機(jī)器學(xué)習(xí)方法應(yīng)用于基因功能注釋時(shí)如何選擇數(shù)據(jù)源、如何改進(jìn)算法以及如何提高預(yù)測(cè)性能上進(jìn)行討論。
【作者單位】： 寧波大學(xué)醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 功能注釋 機(jī)器學(xué)習(xí)法 功能預(yù)測(cè) 基因
【基金】：浙江省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.LQ13C060002) 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81172771;No.31301084) 寧波大學(xué)學(xué)科項(xiàng)目(No.XKL14D2097和No.XYL14023);寧波大學(xué)王寬誠(chéng)教育基金項(xiàng)目~~
【分類(lèi)號(hào)】：Q811.4
【正文快照】： 浙江省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.LQ13C060002),國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81172771,No.31301084),寧波大學(xué)學(xué)科項(xiàng)目(No.XKL14D2097和No.XYL14023)和寧波大學(xué)王寬誠(chéng)教育基金項(xiàng)目*聯(lián)系人Tel:0574-87609602;E-mail:liaoqi@nbu.edu.cn;Tel:0574-87600921;E-mail:shenqijun@nbu.edu.cnRe

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