機器學習方法在基因功能注釋中的應用
發(fā)布時間:2017-10-29 15:17
本文關鍵詞:機器學習方法在基因功能注釋中的應用
【摘要】:目前,基于計算機數學方法對基因的功能注釋已成為熱點及挑戰(zhàn),其中以機器學習方法應用最為廣泛。生物信息學家不斷提出有效、快速、準確的機器學習方法用于基因功能的注釋,極大促進了生物醫(yī)學的發(fā)展。本文就關于機器學習方法在基因功能注釋的應用與進展作一綜述。主要介紹幾種常用的方法,包括支持向量機、k近鄰算法、決策樹、隨機森林、神經網絡、馬爾科夫隨機場、logistic回歸、聚類算法和貝葉斯分類器,并對目前機器學習方法應用于基因功能注釋時如何選擇數據源、如何改進算法以及如何提高預測性能上進行討論。
【作者單位】: 寧波大學醫(yī)學院;
【關鍵詞】: 功能注釋 機器學習法 功能預測 基因
【基金】:浙江省自然科學基金項目(No.LQ13C060002) 國家自然科學基金項目(No.81172771;No.31301084) 寧波大學學科項目(No.XKL14D2097和No.XYL14023);寧波大學王寬誠教育基金項目~~
【分類號】:Q811.4
【正文快照】: 浙江省自然科學基金項目(No.LQ13C060002),國家自然科學基金項目(No.81172771,No.31301084),寧波大學學科項目(No.XKL14D2097和No.XYL14023)和寧波大學王寬誠教育基金項目*聯系人Tel:0574-87609602;E-mail:liaoqi@nbu.edu.cn;Tel:0574-87600921;E-mail:shenqijun@nbu.edu.cnRe
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,本文編號:1113526
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