兒童腺樣體肥大組織中EB病毒插入人染色體基因定位研究
發(fā)布時(shí)間:2017-10-29 18:01
本文關(guān)鍵詞:兒童腺樣體肥大組織中EB病毒插入人染色體基因定位研究
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【摘要】:目的探討EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染導(dǎo)致兒童腺樣體淋巴組織病理性增生肥大的作用途徑,以及兒童腺樣體肥大中EBV在人染色體基因上的作用位點(diǎn)。方法本研究采用下一代基因測(cè)序(Next-Generation Sequencing,NGS)技術(shù)對(duì)16例兒童腺樣體肥大標(biāo)本(11例EBV感染陽(yáng)性,5例EBV感染陰性)進(jìn)行基因測(cè)序檢測(cè),應(yīng)用生物信息學(xué)技術(shù)對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行綜合分析,尋找高表達(dá)的基因位點(diǎn)。結(jié)果在11例EBV(+)標(biāo)本中,EBV序列原始數(shù)據(jù)達(dá)141.37MB reads,每個(gè)樣本中病毒序列原始數(shù)據(jù)總長(zhǎng)為52082bp,平均每個(gè)樣本測(cè)得149個(gè)整合位點(diǎn)(supported reads"g1)及75個(gè)整合位點(diǎn)(supported reads"g2),樣本中測(cè)得的reads數(shù)在制備的病毒序列reads總數(shù)上的覆蓋率達(dá)到30.31%,其中高表達(dá)的基因位點(diǎn)有5個(gè),分別為MORF4L2、BTN2A2、SORT1、VAT1和PLB1。5例EBV(-)樣本中未檢測(cè)出與EBV相關(guān)的基因位點(diǎn)。結(jié)論EBV感染兒童腺樣體后通過整合的方式作用于宿主染色體基因促進(jìn)淋巴細(xì)胞增生。本研究共發(fā)現(xiàn)整合位點(diǎn)5個(gè),這些整合位點(diǎn)通過影響脂質(zhì)代謝、B淋巴細(xì)胞增生、激活自身免疫應(yīng)答、上調(diào)鄰近蛋白質(zhì)表達(dá)等方式造成兒童腺樣體組織的增生肥大。
【關(guān)鍵詞】:腺樣體肥大 EBV 下一代基因測(cè)序 整合位點(diǎn)
【學(xué)位授予單位】:寧夏醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R766
【目錄】:
- 摘要4-5
- ABSTRACT5-8
- 前言8-10
- 材料與方法10-14
- 結(jié)果14-17
- 結(jié)果相關(guān)圖片及資料17-20
- 討論20-24
- 結(jié)論24-25
- 參考文獻(xiàn)25-30
- 綜述30-37
- 綜述參考文獻(xiàn)34-37
- 致謝37-38
- 攻讀碩士期間發(fā)表論文38-39
- 個(gè)人簡(jiǎn)歷39
本文編號(hào):1114034
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