蓮瓣蘭花朵轉(zhuǎn)錄組及MADS基因家族挖掘
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【摘要】:蓮瓣蘭是我國(guó)珍貴的蘭花野生資源,具有很高的觀賞價(jià)值,然而其相關(guān)的分子生物學(xué)研究尚屬空白。為揭示蓮瓣蘭花朵形成的分子機(jī)制,應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)蓮瓣蘭花朵進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析。原始數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)生物信息學(xué)分析后,共獲得57 011條Unigene;所獲得的Unigene與Nr,Swiss-prot,COG和KEGG等數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行搜索比對(duì)后,發(fā)現(xiàn)Unigene的注釋總量為24 049條,約32 962條Unigene沒(méi)獲得注釋,這些沒(méi)獲得注釋Unigene基因可被認(rèn)為是蓮瓣蘭新的轉(zhuǎn)錄本和特異基因。36條CDS基因被注釋為MADS-box基因,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)后并對(duì)31條MADS-box基因進(jìn)行了聚類,其中23條為與花型發(fā)育相關(guān)的ABCDE類基因,8條為與開(kāi)花時(shí)間相關(guān)的MADS基因,同時(shí)發(fā)現(xiàn)PI、AP3和AGL6基因表達(dá)量較高,該試驗(yàn)為研究蘭屬的花發(fā)育以及開(kāi)花機(jī)理的研究提供一定的理論依據(jù)。
【作者單位】: 云南農(nóng)業(yè)大學(xué);云南省建水縣農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣所;云南省會(huì)澤縣種子管理站;
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【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31460528)資助
【分類號(hào)】:S682.31
【正文快照】: *通訊作者,hefengmei918@126.comFloral Transcriptome Sequencing and Characteristic Analysis of CymbidiumtortisepalumXiao Jingyi1Zhu Yongping1Jiang Zhou1Jia Rong1Wu Linxian1Yu Kun2Xu Yufeng3ZhangYinghua1He Fengmei1*1 Yunnan Agricultural University,Kunming,6
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1100391
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