滇金絲猴糞便微生物GH10家族木聚糖酶基因多樣性
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【摘要】:【目的】分析滇金絲猴糞便微生物中GH10家族木聚糖酶的基因多樣性。【方法】以野生和半圈養(yǎng)滇金絲猴糞便微生物宏基因組DNA為模板,用GH10木聚糖酶簡(jiǎn)并引物擴(kuò)增木聚糖酶基因片段,利用p MD19-T載體構(gòu)建細(xì)菌克隆文庫(kù)并進(jìn)行分析。【結(jié)果】從野生和半圈養(yǎng)滇金絲猴糞便微生物克隆文庫(kù)中分別獲得26、28條GH10木聚糖酶基因片段,與Gen Bank中木聚糖酶序列一致性分別介于58%-95%、63%-81%之間。比對(duì)分析表明,兩種環(huán)境中的GH10木聚糖酶均來(lái)自厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)和未培養(yǎng)細(xì)菌。野生滇金絲猴糞便微生物的GH10木聚糖酶基因來(lái)源于Uncultured bacterium和Butyrivibrio、Bacteroides、Ruminococcus、Sphingobacterium、Chryseobacterium、Clostridium、Bacillus 7個(gè)屬;而半圈養(yǎng)滇金絲猴糞便微生物的GH10木聚糖酶基因來(lái)源于Uncultured bacterium和Clostridium、Paludibacter、Sphingobacterium、Ruminococcus、Roseburia、Chryseobacterium 6個(gè)屬,其中兩種環(huán)境都存在來(lái)源于Ruminococcus、Clostridium、Chryseobacterium、Sphingobacterium的GH10木聚糖酶!窘Y(jié)論】滇金絲猴糞便微生物中含有豐富的GH10木聚糖酶基因,且野生和半圈養(yǎng)兩種不同環(huán)境中GH10木聚糖酶基因的微生物來(lái)源存在一定差異。該研究豐富了動(dòng)物胃腸道中GH10木聚糖酶基因多樣性,并為新型木聚糖酶的開(kāi)發(fā)和滇金絲猴胃腸道微生物資源的利用奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】: 云南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;生物能源持續(xù)開(kāi)發(fā)利用教育部工程研究中心;云南省生物質(zhì)能與環(huán)境生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;云南師范大學(xué)酶工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 未培養(yǎng) 滇金絲猴 糞便微生物 木聚糖酶 多樣性
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.31160229,31360268)~~
【分類(lèi)號(hào)】:Q936
【正文快照】: 木聚糖是植物細(xì)胞壁中半纖維素的主要組成成分,其完全水解需要多種酶的協(xié)同作用。內(nèi)切-1,4-β-D-木聚糖酶俗稱(chēng)木聚糖酶,它隨機(jī)切割木聚糖主鏈后生成木糖,是木聚糖降解過(guò)程中發(fā)揮主要作用、具廣泛應(yīng)用價(jià)值的一類(lèi)酶[1]。研究表明木聚糖酶分布于GH5、7、8、10、11、43等家族中,GH
【相似文獻(xiàn)】
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9 本報(bào)記者 崔仁t槨±鉅,
本文編號(hào):1100368
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