2504例漢族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨等位基因多態(tài)性研究
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【摘要】:目的分析2 504例漢族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨等位基因多態(tài)性及分布特征。方法采用基于Illumina Miseq二代測(cè)序技術(shù),對(duì)岳陽(yáng)地區(qū)2 504例漢族造血干細(xì)胞捐獻(xiàn)志愿者的HLA-A、B、C、DRB1和DQB1基因進(jìn)行高分辨分型,采用Py Pop軟件計(jì)算等位基因頻率、單體型頻率核對(duì)連鎖不平衡參數(shù)。結(jié)果 HLA-Ⅰ類基因中,A、B和C基因座分別檢出55、117和67個(gè)等位基因,其中頻率0.05常見(jiàn)等位基因?yàn)锳*11:01:01:01、A*24:02:01:01、A*02:07:01、A*02:01:01:01、A*33:03:01,B*40:01:02、B*58:01:01、B*15:02:01、B*13:01:01、B*46:01:01、C*03:03:01、C*03:02:02:01、C*08:01:01、C*03:04:01:02、C*07:02:01:01、C*01:02:01;HLA-Ⅱ類基因中,共檢出50個(gè)DRB1和26個(gè)DQB1等位基因,頻率0.05常見(jiàn)等位基因見(jiàn)于DRB1*11:01:01、DRB1*08:03:02、DRB1*12:02:01、DRB1*15:01、DRB1*09:01:02,DQB1*03:01:01、DQB1*03:02:01、DQB1*03:03:02、DQB1*05:02:01、DQB1*06:01:01。HLA-A、B、C、DRB1和DQB1位點(diǎn)基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05)。任意2個(gè)HLA基因間均具有強(qiáng)的連鎖不平衡,其中頻率≥0.01有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的單體型有196條。結(jié)論獲得了岳陽(yáng)地區(qū)漢族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1高分辨等位基因頻率數(shù)據(jù),為人類學(xué)、移植配型、疾病相關(guān)性等研究提供了參考數(shù)據(jù)。
【作者單位】: 岳陽(yáng)市中心血站;
【關(guān)鍵詞】: HLA抗原 HLA高分辨等位基因 基因頻率 多態(tài)性
【分類號(hào)】:R394
【正文快照】: 人類白細(xì)胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因系統(tǒng)根據(jù)編碼分子的分布與功能不同,分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3大類,HLA-A、B、C屬于Ⅰ類基因,HLA-DRB1、DQB1屬于Ⅱ類基因。HLA-A、B、DRB1基因是早期研究的與造血干細(xì)胞移植密切相關(guān)的3個(gè)功能基因,隨著非血緣造血干細(xì)胞移植的增加,HLA
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本文編號(hào):1100439
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