本文關鍵詞：沙冬青AmCIP基因結構及其內(nèi)含子生物信息學分析

  更多相關文章： 沙冬青 脫水素基因AmCIP 外顯子 內(nèi)含子 生物信息學分析

【摘要】：旨在分析沙冬青Am CIP基因DNA序列結構特性及功能。以沙冬青Am CIP基因的c DNA序列設計引物,采用PCR擴增其DNA序列,并利用生物信息學方法分析基因的結構。序列分析表明,沙冬青Am CIP基因DNA序列長1 548 bp,包含2個外顯子和1個內(nèi)含子,Gen Bank登錄號KU744005。在該基因的ORF內(nèi)存在一個78 bp的內(nèi)含子序列,同時內(nèi)含子序列中含有參與厭氧誘導的類增強子元件(GC-motif)和光響應元件(TCCC-motif),3'-UTR區(qū)域含有多個參與光響應、脅迫響應和激素響應等相關的順式作用元件,而5'-UTR區(qū)域只含有赤霉素響應元件(GARE-motif),這些元件可能對Am CIP基因轉錄表達起調(diào)控作用。此外,該基因具有較高的A+T堿基含量(64.7%),Am CIP的內(nèi)含子不具有GT-AG規(guī)則的保守序列,即內(nèi)含子5'堿基是GT,3'堿基是TG,推測Am CIP的m RNA具有獨特的剪切機制。
【作者單位】： 北京林業(yè)大學生物科學與技術學院林木育種國家工程實驗室教育部林木花卉遺傳育種重點實驗室;
【關鍵詞】： 沙冬青 脫水素基因AmCIP 外顯子 內(nèi)含子 生物信息學分析
【基金】：國家自然科學基金項目(31270737) 高等學校學科創(chuàng)新引智計劃資助項目(B13007) 長江學者和創(chuàng)新團隊發(fā)展計劃資助項目(IRT13047) 北京市自然科學基金項目(6112016)
【分類號】：Q943.2
【正文快照】： 胚胎發(fā)育晚期豐富蛋白(Late embryonic abund-ant,簡稱LEA)與種子抵抗脫水有關,它伴隨種子的成熟過程產(chǎn)生,大量積累于種子成熟后期特定階段,在種子萌發(fā)后很快消失[1]。研究發(fā)現(xiàn),LEA蛋白在種子干旱中積累,以及在干旱、低溫、高溫或鹽脅迫等逆境導致的缺水情況下,在植物組織或生

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本文編號：1087252