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以SARS-CoV-2為中心的PBL方案在線上生物化學教學中的應用

發(fā)布時間:2021-08-06 05:21
  "生物化學"在生命科學教育中處于基礎和核心的位置,教學的信息量大、難度高。教師們一直在努力探討和提高"生物化學"的教學效果。目前,在疫情影響下,理論課程轉(zhuǎn)入線上教學,對這門課程的教學帶來了新的挑戰(zhàn)和契機。生物化學的本質(zhì)是在分子層面上描述生命活動,因此,我們選用SARS-CoV-2這一相對簡單的生命形式為線索,按照"結構生物化學"的教學進展,從蛋白質(zhì)、核酸到酶、受體再到疫苗和藥物發(fā)展步步推進,設計并踐行了五步走的PBL(practice-based learning)的教學方案,并把教學的效果分享出來,與教學同行一起探討和提高。 

【文章來源】:生命的化學. 2020,40(08)CSCD

【文章頁數(shù)】:6 頁

【部分圖文】:

以SARS-CoV-2為中心的PBL方案在線上生物化學教學中的應用


結構絲帶模型、親疏水性分布和氨基酸序列與二維結構的對應模式圖圖1SARS-CoV-2的NSP15蛋白的晶體結構[3]SARS-CoV-2蛋白NSP15(一種內(nèi)切核糖核酸酶)

課件,基因組,信息,病毒


示為一位同學課件的截圖,其中展示了SARS-CoV-2蛋白NSP15——一種核糖核酸內(nèi)切酶的蛋白性質(zhì)參數(shù)、結構絲帶模型、親疏水性分布和氨基酸序列與二維結構的對應模式圖。通過對這些知識點的印證和軟件工具的掌握,同學們?yōu)榻Y構生物化學的理解和深入學習打下了堅實的基矗1.22分析病毒的基因組,分析其傳播和復制的方式在學習了核苷酸、核酸結構與功能關系和核酸的研究方法之后,給出第二個研討題目。涉及的知識點包括正鏈RNA的序列和結構信息、預測的核酸二級結構和可能對應的功能以及病毒入侵和復制過程。圖2顯示了一位同學搜索到的病毒基因組信息。同學們檢索和分析信息的能力在這里得到了突出的體現(xiàn),他們檢索了正鏈RNA病毒基因組的序列信息,從分子層面分析了病毒通過融合(fusion)、內(nèi)吞(endocytosis)的方式進入細胞,以及之后的翻譯(translation)、蛋白切割(proteolysis)、RNA復制(RNAreplication)、包裝(packaging)和釋放(virionreleasing)的全過程,并對病毒人傳人的過程進行了分析。他們不但從核酸序列分析和研究方法的學習中,尋找了RT-PCR引物與核酸雜交的探針序列,給出了病毒診斷試劑的分子基礎,還通過鄰近病毒種屬核酸序列的對比,推測病毒演化的源頭。這部分的研討已經(jīng)大大超出了課程所要求掌握的知識范疇,延伸到了分子生物學、分子診斷、分子進化、公共衛(wèi)生管理等學科。1.31.3選擇分析病毒中的某一種酶的構效關系、催化機制和調(diào)節(jié)機制,并探討以之作為藥物靶點發(fā)展藥物的可能性和可行性這是在學習了酶學部分之后,給出的第三個研討題目。在酶學、尤其是酶動力學的學習中,同學們了解了7大類酶所催化的反應、它們進行催化的6大類分子機制,以及

二維圖,代謝產(chǎn)物,效應,效應物


略,被視為疫情控制的終極希望。首先同學們需要對免疫學,尤其是其中的主動免疫、被動免疫等和疫苗相關的部分有一個自學和了解的過程,然后集中到目前針對的疫苗抗原發(fā)展對象——刺突蛋白抗原的篩選和有效性檢查。這里還需要結合對糖類,尤其是糖綴合物的學習,了解病毒變異速度以及刺突蛋白糖基化多樣性這兩個疫苗研發(fā)的重要難點的考察和對策思考,并結合不同類型疫苗和佐劑配伍方案[13]。這分別從三維和二維角度進行了瑞德西韋代謝產(chǎn)物效應分子和2019-nCoV(也就是SARS-CoV-2)的nsp12聚合酶對接模擬,兩圖中部的綠色部分為瑞德西韋效應物圖3瑞德西韋(Remdesivir)代謝產(chǎn)物效應分子與新型冠狀病毒聚合酶的預期結合形式[7]

【參考文獻】:
期刊論文
[1]新型冠狀病毒肺炎的治療藥物及疫苗研究進展[J]. 寧文靜,劉雪,羅文新.  廈門大學學報(自然科學版). 2020(03)
[2]生物化學教學實用技巧和策略[J]. 楊榮武.  中國生物化學與分子生物學報. 2020(02)



本文編號:3325150

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