生物信息學(xué)高性能教學(xué)平臺(tái)的建立與實(shí)踐
本文關(guān)鍵詞:生物信息學(xué)高性能教學(xué)平臺(tái)的建立與實(shí)踐,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:隨著生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的高速積累和增長(zhǎng),生物信息學(xué)成為生命科學(xué)研究型人才必須掌握的重要技能。從高性能計(jì)算和生物信息學(xué)的關(guān)系入手,簡(jiǎn)述了生物信息學(xué)教學(xué)中采用高性能計(jì)算設(shè)備的必要性。根據(jù)農(nóng)業(yè)院校的具體情況,在生物信息學(xué)教學(xué)中建立了高性能計(jì)算平臺(tái),幫助學(xué)生熟悉相關(guān)并行計(jì)算環(huán)境,更好地理解生物信息學(xué)重要的理論和算法。在課程安排上,理論課、實(shí)驗(yàn)課以及課程設(shè)計(jì)的內(nèi)容圍繞生物信息學(xué)案例展開;贛oodle教學(xué)系統(tǒng)進(jìn)行在線課程管理,培養(yǎng)學(xué)生的自主學(xué)習(xí)能力和團(tuán)隊(duì)協(xié)作意識(shí),提高了學(xué)生運(yùn)用高性能計(jì)算解決實(shí)際生物信息學(xué)問題的能力。
【作者單位】: 江蘇理工學(xué)院電氣信息工程學(xué)院生物信息與醫(yī)藥工程研究所;華南農(nóng)業(yè)大學(xué)信息學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 高性能計(jì)算 案例教學(xué) 生物信息
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31200990) 全國教育信息技術(shù)研究“十二五”規(guī)劃2012年度專項(xiàng)課題(126230657) 廣東省優(yōu)秀青年教師培育計(jì)劃項(xiàng)目(Yq2013027) 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)信息學(xué)院教育教學(xué)改革與研究項(xiàng)目(INFJG1009)
【分類號(hào)】:Q811.4-4;G642.4
【正文快照】: 究項(xiàng)目(INFJG1009)0引言進(jìn)入21世紀(jì),生物學(xué)研究的重點(diǎn)和潛在的研究熱點(diǎn)已經(jīng)由20世紀(jì)的實(shí)驗(yàn)分析和數(shù)據(jù)積累,轉(zhuǎn)移到數(shù)據(jù)分析及其指導(dǎo)下的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證上來。隨著生物學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的高速積累和增長(zhǎng),生命科學(xué)的研究步入了大數(shù)據(jù)時(shí)代,計(jì)算分析方法以及網(wǎng)絡(luò)技術(shù)成為生命科學(xué)研究人員必備的
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前7條
1 王益軍;;農(nóng)學(xué)專業(yè)生物信息學(xué)課程教學(xué)改革探析[J];現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技;2010年05期
2 孫建青;;網(wǎng)格技術(shù)及其對(duì)現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育的影響[J];中國遠(yuǎn)程教育;2006年03期
3 常珊;孔韌;李春華;陳慰祖;王存新;;基于MPI的分子對(duì)接并行算法[J];計(jì)算物理;2008年02期
4 張予倩;周健;翁紅明;韓靜;;Rocks高性能計(jì)算集群的建立和管理[J];實(shí)驗(yàn)室研究與探索;2006年04期
5 李斌;李義兵;何紅波;;生物信息學(xué)中的分布式計(jì)算[J];生物信息學(xué);2006年04期
6 劉宏生;鄭方亮;艾海新;朱春玉;朱俊豐;于晶晶;王加友;;強(qiáng)化生物信息學(xué)實(shí)踐教學(xué)的探索與成果[J];生物信息學(xué);2010年04期
7 秦健;杜曉輝;馬紅亮;;Moodle學(xué)習(xí)管理平臺(tái)交互性的實(shí)證分析[J];中國電化教育;2011年02期
【共引文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 張玉娟;;師范院校生物信息學(xué)教學(xué)的現(xiàn)狀分析[J];成才之路;2012年01期
2 張玉娟;;淺談生物信息學(xué)教學(xué)中的幾點(diǎn)建議[J];中國科教創(chuàng)新導(dǎo)刊;2012年04期
3 錢葉雄;朱國萍;聶劉旺;闞顯照;;生物信息學(xué)課程“教、學(xué)、研”一體化創(chuàng)新教學(xué)模式探討[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年06期
4 單好民;;構(gòu)建基于Moodle教學(xué)平臺(tái)的混合式教學(xué)模式的實(shí)踐[J];湖南郵電職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)報(bào);2014年04期
5 周敏;;基于Globus和SGE的校園網(wǎng)格作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)研究[J];湖北廣播電視大學(xué)學(xué)報(bào);2008年12期
6 陳江鳴;;開放教育學(xué)生信息獲取障礙的分析及其解決策略研究[J];湖北廣播電視大學(xué)學(xué)報(bào);2010年02期
7 閆生忠;陳亞芍;尹世偉;;基于Web的網(wǎng)絡(luò)計(jì)算機(jī)技術(shù)在高校化學(xué)科研與教學(xué)中的應(yīng)用[J];計(jì)算機(jī)與應(yīng)用化學(xué);2008年11期
8 周萬枝;;現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育課程資源建設(shè)現(xiàn)狀分析[J];北京交通管理干部學(xué)院學(xué)報(bào);2007年01期
9 李安華;;網(wǎng)格技術(shù)及其對(duì)現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育的影響[J];中國現(xiàn)代教育裝備;2007年07期
10 張繁;王松;;并行計(jì)算在生物信息學(xué)中的應(yīng)用[J];科技信息(科學(xué)教研);2007年36期
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 徐琛彥;基于的分子對(duì)接加速技術(shù)研究GPU[D];國防科學(xué)技術(shù)大學(xué);2010年
2 彭?xiàng)罱?網(wǎng)絡(luò)課程現(xiàn)存問題的探究及對(duì)策研究[D];華中科技大學(xué);2011年
3 劉福泉;基于GT4的校園計(jì)算網(wǎng)格研究[D];中南大學(xué);2007年
4 陳嵩;應(yīng)用于空間數(shù)據(jù)庫的服務(wù)器集群技術(shù)研究[D];福建師范大學(xué);2007年
5 關(guān)勝;基于模型的高性能計(jì)算集群建模與合成[D];汕頭大學(xué);2008年
6 胡始昌;基于Map/Reduce的分布式搜索模型研究[D];廈門大學(xué);2014年
7 王太武;大腸桿菌噬菌體LSB-1裂解酶基因gp17的表達(dá)、抗菌效應(yīng)分析及優(yōu)化設(shè)計(jì)預(yù)測(cè)[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2014年
8 陳倩;基于Web的集群管理與監(jiān)護(hù)系統(tǒng)的設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)[D];西安電子科技大學(xué);2014年
9 王延福;Moodle平臺(tái)在高中信息技術(shù)課中的混合式學(xué)習(xí)應(yīng)用研究[D];河南大學(xué);2014年
10 楊兆明;基于Moodle平臺(tái)的《計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)》課程教學(xué)實(shí)踐研究[D];云南師范大學(xué);2013年
【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 廖志文;魯劍巍;李小坤;鄭保國;;農(nóng)業(yè)大學(xué)研究型教學(xué)模式的實(shí)踐探索[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2009年27期
2 尚建新;解月光;王偉;;虛擬學(xué)習(xí)社區(qū)中學(xué)習(xí)者交互因素研究[J];電化教育研究;2010年08期
3 王霄寧;基于社會(huì)網(wǎng)絡(luò)分析的產(chǎn)業(yè)集群建模及實(shí)證檢驗(yàn)[J];系統(tǒng)工程;2005年03期
4 向太和;;我國現(xiàn)有《生物信息學(xué)》教材和網(wǎng)絡(luò)資源的分析[J];杭州師范學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2006年06期
5 陶嫦立;劉順會(huì);;生物技術(shù)專業(yè)生物信息學(xué)雙語教學(xué)實(shí)踐與探討[J];四川教育學(xué)院學(xué)報(bào);2008年05期
6 冉景盛;姚啟倫;;生物信息學(xué)創(chuàng)新教學(xué)模式初探[J];生物學(xué)通報(bào);2009年01期
7 張淑梅;保佳;王睿;;免費(fèi)數(shù)學(xué)師范生學(xué)習(xí)動(dòng)力影響因素的定量分析[J];數(shù)學(xué)教育學(xué)報(bào);2009年06期
8 周蔚;倪曉燕;;我國現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育雙向交互現(xiàn)狀的分析研究[J];現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育研究;2006年05期
9 何素貞,李書平,吳晨旭;高性能計(jì)算集群系統(tǒng)的設(shè)計(jì)和實(shí)現(xiàn)[J];廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2004年06期
10 李遠(yuǎn)航;王子平;;社會(huì)學(xué)視角下的虛擬學(xué)習(xí)社區(qū)中社會(huì)性交互研究[J];現(xiàn)代教育技術(shù);2009年09期
【相似文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 ;生物信息學(xué)與基因電腦克隆[J];中國獸醫(yī)學(xué)報(bào);2000年01期
2 陳成;生物信息學(xué)的現(xiàn)狀與未來[J];生物技術(shù)通報(bào);2000年02期
3 龐洪泉 ,樊龍江;有關(guān)生物信息學(xué)的幾點(diǎn)誤解[J];生物技術(shù)通報(bào);2002年02期
4 蔣寶榮,吳文德;寄生蟲生物信息學(xué)研究[J];廣西大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2003年S1期
5 ;生物信息學(xué)[J];現(xiàn)代臨床醫(yī)學(xué)生物工程學(xué)雜志;2003年05期
6 ;生物信息學(xué)[J];天津科技;2004年06期
7 彭濤 ,王林;2004年青年生物信息學(xué)家論壇[J];國外醫(yī)學(xué).藥學(xué)分冊(cè);2005年03期
8 ;《生物信息學(xué)導(dǎo)論》出版[J];遺傳學(xué)報(bào);2005年01期
9 鐘揚(yáng);王莉;李作峰;;我國生物信息學(xué)教育的發(fā)展與挑戰(zhàn)[J];計(jì)算機(jī)教育;2006年09期
10 賀思敏;陳文光;許東;羅靜初;吳曉桃;;生物信息學(xué)[J];計(jì)算機(jī)教育;2006年09期
中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 唐一源;沈鈞賢;徐志敏;;生物信息學(xué)與神經(jīng)信息學(xué)數(shù)據(jù)庫的整合[A];第九次全國生物物理大會(huì)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2002年
2 高亞梅;韓毅強(qiáng);余麗蕓;;生物信息學(xué)本科教學(xué)研究初探[A];高教科研2006(中冊(cè):教學(xué)改革)[C];2006年
3 楊劍;;生物信息學(xué)在新發(fā)再發(fā)傳染病研究中的應(yīng)用[A];新發(fā)和再發(fā)傳染病防治熱點(diǎn)研討會(huì)論文集[C];2011年
4 潘潔;;生物信息學(xué)對(duì)中藥現(xiàn)代化的作用[A];2006第六屆中國藥學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2006年
5 葛劍徽;李成;謝迅雷;;生物信息學(xué)發(fā)展現(xiàn)狀與前景展望[A];2008年中華臨床醫(yī)學(xué)工程及數(shù)字醫(yī)學(xué)大會(huì)暨中華醫(yī)學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)工程學(xué)分會(huì)第九次學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2008年
6 劉湘軍;;生物信息學(xué)的研究現(xiàn)狀[A];第九次全國生物物理大會(huì)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2002年
7 孫金立;李路路;王棟;;生物信息學(xué)多媒體教學(xué)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)框架[A];圖書館改革與發(fā)展——陜西省社會(huì)科學(xué)信息學(xué)會(huì)第六次學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2003年
8 陸文聰;鈕冰;;基于數(shù)據(jù)挖掘的生物信息學(xué)研究進(jìn)展[A];中國化學(xué)會(huì)第27屆學(xué)術(shù)年會(huì)第15分會(huì)場(chǎng)摘要集[C];2010年
9 康曉東;;生物信息學(xué)及其研究對(duì)象[A];2003年全國醫(yī)學(xué)影像技術(shù)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2003年
10 呂暉;;生物信息學(xué)與個(gè)體化醫(yī)學(xué)[A];第九屆全國遺傳病診斷與產(chǎn)前診斷學(xué)術(shù)交流會(huì)暨產(chǎn)前診斷和醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)新技術(shù)研討會(huì)論文集[C];2014年
中國重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 劉義;生物信息學(xué)產(chǎn)業(yè)浮出水面[N];中國高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)導(dǎo)報(bào);2000年
2 張雅麗;加強(qiáng)交流 立足中國生物信息學(xué)最新進(jìn)展[N];科技日?qǐng)?bào);2000年
3 本報(bào)記者 白毅;生物信息學(xué)院士談[N];中國醫(yī)藥報(bào);2002年
4 劉麗麗;高性能計(jì)算為生物信息學(xué)加速[N];計(jì)算機(jī)世界;2007年
5 中科院生物學(xué)部 張春霆;對(duì)生物信息學(xué)的展望[N];北京科技報(bào);2000年
6 魏中文;生物信息學(xué)是開啟后基因組時(shí)代的“金鑰匙”[N];北京科技報(bào);2002年
7 記者 王雪飛;我國科學(xué)家向政府建議——加強(qiáng)生物信息學(xué)學(xué)科建設(shè)[N];健康報(bào);2000年
8 白毅;加強(qiáng)生物信息學(xué)建設(shè)推動(dòng)人類基因組研究[N];中國醫(yī)藥報(bào);2002年
9 王雪飛 吳黎;中國生物信息學(xué)研究快速發(fā)展[N];健康報(bào);2002年
10 春曉;國外生物信息學(xué)的發(fā)展與現(xiàn)狀[N];中國醫(yī)藥報(bào);2002年
中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前5條
1 喬立安;基于網(wǎng)格的生物信息學(xué)計(jì)算流程系統(tǒng)的研究[D];清華大學(xué);2005年
2 賴煦卉;基于生物信息學(xué)的抗結(jié)核藥物靶點(diǎn)的篩選與驗(yàn)證[D];復(fù)旦大學(xué);2008年
3 張成崗;基于本地和WEB的生物信息學(xué)綜合分析體系的建立及部分新基因的初步實(shí)驗(yàn)研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2000年
4 朱英杰;藥用植物基因資源的生物信息學(xué)研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2014年
5 王嫻;蛋白殘基可溶性預(yù)測(cè)及基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析方法研究[D];中國科學(xué)技術(shù)大學(xué);2007年
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 張書欣;生物信息學(xué)若干問題研究報(bào)告[D];吉林大學(xué);2012年
2 劉維;生物信息學(xué)中的并行處理[D];揚(yáng)州大學(xué);2007年
3 張景祥;關(guān)于生物信息學(xué)的幾個(gè)問題[D];江南大學(xué);2008年
4 雷國慶;面向生物信息學(xué)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)領(lǐng)域的算法加速器設(shè)計(jì)[D];國防科學(xué)技術(shù)大學(xué);2010年
5 劉丙強(qiáng);生物信息學(xué)中的若干組合問題[D];山東大學(xué);2006年
6 周萍;生物信息學(xué)多序列比對(duì)及種系生成樹的幾種技術(shù)和算法研究[D];電子科技大學(xué);2007年
7 湯思捷;蛋白質(zhì)可溶性預(yù)測(cè)的生物信息學(xué)模型及應(yīng)用[D];蘇州大學(xué);2014年
8 黃金;聚類和分類技術(shù)在生物信息學(xué)中的應(yīng)用[D];黑龍江大學(xué);2005年
9 朱賢芳;生物序列的比對(duì)算法比較研究[D];南京理工大學(xué);2005年
10 陳肯;生物信息學(xué)中多標(biāo)號(hào)不平衡分類問題的研究[D];上海交通大學(xué);2007年
本文關(guān)鍵詞:生物信息學(xué)高性能教學(xué)平臺(tái)的建立與實(shí)踐,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):491098
本文鏈接:http://sikaile.net/jiaoyulunwen/shifanjiaoyulunwen/491098.html