本文關(guān)鍵詞：徐霞客文化背景下初中環(huán)境教育校本課程開發(fā)與教學(xué)實踐，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】產(chǎn)志賀毒素大腸桿菌(Shigatoxin-producingEscherichiacoli,STEC)O157:H7是一類重要的人畜共患病病原,可引起人水樣腹瀉、出血性腸炎以及溶血性尿毒綜合征等。單核苷酸多態(tài)性(Singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)分析是近年來用于揭示0157：H7群體基因組水平多樣性、流行病學(xué)關(guān)系以及詳細(xì)了解0157：H7演化過程的一種基因分型方法。我們對于中國0157：H7菌株之間以及中國菌株與其他國家菌株之間的遺傳關(guān)系所知甚少。本研究采用了Manning等人以及Clawson等人建立的SNPs分型體系,共計64個SNP位點,將中國325株STECO157:H7菌株分為5個SNP基因型(SG-1～SG-5)。最常見的基因型為SG-5型(79.69%)及SG-1型(14.46%)。從患者分離的菌株集中在SG-1型及SG-5型,僅一株存在于SG-3型中。47株SG-1型菌株,通過Xuzhou21基因組特異SNPs位點可分為兩個亞型(SG-1.1和SG-1.2)。SG-1.1型菌株是導(dǎo)致1999蘇皖疫情相關(guān)菌株。1999年HUS/HC從患者分離的菌株集中在SG-1.1。根據(jù)MLST分型結(jié)果,136株中國STECO157:H7菌株分為4個ST型別：ST23、ST24、ST96和ST97。MLST分型結(jié)果與SNP分型結(jié)果有較好的一致性且SNP分型能力較強(qiáng)。ST24型菌株包括SG-2及SG-3兩個基因型,同時,ST23型菌株包括SG-4和SG-5基因型。ST96和ST97屬于相同的基因型SG-1，SG-1.1亞型菌株為ST96型,SG-1.2亞型菌株為ST97型。中國STECO157:H7菌株有5個基因型,且在Manning等人劃分的Clade以及Clawson等人區(qū)分的分支中,均顯示較遠(yuǎn)的遺傳關(guān)系,表明這些基因型菌株在我國是平行傳播的。我們對5個SG型別的36株菌進(jìn)行重測序,做基因組間SNP分析,結(jié)果顯示,36株0157：H7菌株共計有2486個SNPs,其中包括同義突變位點809個和非同義突變位點1195個,基因間的SNP位點475個,終止突變位點7個�；谌蚪MSNP位點的分型結(jié)果,SG-5菌株呈分散狀態(tài)。另外,SG-2、SG-3的3株菌為ST24型菌株,呈現(xiàn)出較分散的3個分支,提示SG-2、SG-3存在較大差異�？赏ㄟ^這些SNPs位點區(qū)分出SG-1型菌株中和1999年蘇皖疫情相關(guān)的SG-1.1型菌株。
【作者】孟瓊；
【導(dǎo)師】徐建國；
【作者基本信息】中國疾病預(yù)防控制中心，病原生物學(xué)，，2014，博士
【關(guān)鍵詞】O157:H7；單核苷酸多態(tài)性；暴發(fā)菌株；SNP基因型；

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