本文關(guān)鍵詞：基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的胃癌代謝組學(xué)研究

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【摘要】：目的： 應(yīng)用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(LC-MS)對胃癌患者和健康人的血液和尿液標(biāo)本分別進(jìn)行檢測，找出胃癌患者和健康人群之間具有差異的代謝產(chǎn)物，從而尋找與胃癌相關(guān)的生物標(biāo)志物。 方法： 1、樣本處理：采用高速離心(14000rpm,5min)等對血液、尿液樣本進(jìn)行處理，取上清供高效液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀檢測分析。 2、LC-MS分析：采用高效液相色譜飛行時間質(zhì)譜聯(lián)用儀（HPLC-TOFMS）對樣本進(jìn)行檢測，得到胃癌患者和健康人血液、尿液的代謝圖譜和相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。 3、數(shù)據(jù)處理：采用主成分分析(principal component analysis，PCA)、t檢驗、偏最小二乘判別分析(partial least square-discriminant analysis,PLS-DA)、分層聚類分析（hierarchical cluster analysis, HCA）等統(tǒng)計方法對得到的實驗數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，分析胃癌患者和健康人之間的代謝圖譜差異，找到兩者間有意義的差異代謝產(chǎn)物，并且驗證這些代謝產(chǎn)物對胃癌組與健康人的判別能力。 結(jié)果： 1、在血液樣本的研究中，PCA得分圖的結(jié)果顯示胃癌患者和健康人可以很好的區(qū)分開來，通過t檢驗、聚類分析、偏最小二乘判別分析等方法篩選出具有差異的代謝產(chǎn)物，將篩選出的代謝產(chǎn)物在HMDB數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行結(jié)構(gòu)鑒定，正負(fù)離子模式下一共找出21種差異代謝產(chǎn)物。最后繪制ROC曲線，找出14種重要差異代謝產(chǎn)物，結(jié)果顯示這些重要差異代謝產(chǎn)物對胃癌患者與健康人的區(qū)分有很好的靈敏度。 2、在尿液樣本的研究中，PCA得分圖的結(jié)果顯示胃癌患者和健康人可以很好的區(qū)分開來，，通過t檢驗、聚類分析、偏最小二乘判別分析等方法篩選出具有差異的代謝產(chǎn)物，將篩選出的代謝產(chǎn)物在HMDB數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行結(jié)構(gòu)鑒定，正負(fù)離子模式下一共找出27種差異代謝產(chǎn)物。最后繪制ROC曲線，找出3種重要差異代謝產(chǎn)物，結(jié)果顯示這些重要差異代謝產(chǎn)物對胃癌患者與健康人的區(qū)分有很好的靈敏度。 結(jié)論： 通過對胃癌患者和健康人的血液、尿液分別進(jìn)行液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的分析，得到血液中21種差異代謝產(chǎn)物，其中14種重要差異代謝產(chǎn)物，尿液中27種差異代謝產(chǎn)物，其中有3種重要差異代謝產(chǎn)物，可以很好的將胃癌與健康人進(jìn)行區(qū)分，可能為潛在的生物標(biāo)志物。血、尿中均發(fā)現(xiàn)Quinone以及Acetyl-N-formyl-5-methoxykynure-namine，可能為胃癌特異的代謝產(chǎn)物。
【關(guān)鍵詞】：胃癌 代謝組學(xué) 生物標(biāo)志物 液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù) 主成分分析
【學(xué)位授予單位】：吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R735.2
【目錄】：

• 中文摘要4-6
• Abstract6-10
• 英文縮略詞10-11
• 引言11-13
• 第1章 綜述13-20
• 1.1 分析技術(shù)13-15
• 1.1.1 核磁共振（NMR）13-14
• 1.1.2 質(zhì)譜（MS）14-15
• 1.2 數(shù)據(jù)處理方法15-16
• 1.2.1 非監(jiān)督方法16
• 1.2.2 有監(jiān)督方法16
• 1.3 在臨床中的應(yīng)用16-18
• 1.3.1 腫瘤的早期診斷16-17
• 1.3.2 評估療效17-18
• 1.3.3 在其他疾病中的應(yīng)用18
• 1.4 展望18-20
• 第2章 基于液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)胃癌血液代謝組學(xué)研究20-38
• 2.1 引言20
• 2.2 實驗部分20-24
• 2.2.1 實驗流程圖20
• 2.2.2 實驗材料、試劑與儀器20-21
• 2.2.3 樣本來源21-22
• 2.2.4 樣本處理22
• 2.2.5 分析條件22-23
• 2.2.6 數(shù)據(jù)處理方法23-24
• 2.3 實驗結(jié)果24-36
• 2.3.1 LC-MS 總離子流圖24-26
• 2.3.2 數(shù)據(jù)分析結(jié)果26-36
• 2.4 小結(jié)與討論36-38
• 第3章 基于液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)胃癌尿液代謝組學(xué)研究38-57
• 3.1 引言38
• 3.2 實驗部分38-43
• 3.2.1 實驗流程圖38-39
• 3.2.2 實驗材料、試劑與儀器39
• 3.2.3 樣本來源39-40
• 3.2.4 樣本處理40
• 3.2.5 分析條件40-41
• 3.2.6 數(shù)據(jù)處理方法41-43
• 3.3 實驗結(jié)果43-55
• 3.3.1 尿液 LC-MS 總離子流圖43-44
• 3.3.2 數(shù)據(jù)分析結(jié)果44-55
• 3.3.3 血、尿中共同的差異代謝產(chǎn)物55
• 3.4 小結(jié)與討論55-57
• 第4章 總結(jié)與展望57-58
• 4.1 總結(jié)57
• 4.2 展望57-58
• 參考文獻(xiàn)58-65
• 作者簡介及在學(xué)期間所取得的科研成果65-66
• 致謝66

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 周紅光;陳海彬;俞曉憶;王瑞平;吳勉華;;代謝組學(xué)在惡性腫瘤早期診斷中的應(yīng)用[J];吉林大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版);2013年01期

本文編號：781730