miRNA對(duì)肺癌的調(diào)控和易感性研究
本文關(guān)鍵詞:miRNA對(duì)肺癌的調(diào)控和易感性研究
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【摘要】:肺癌是常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,在我國(guó)其發(fā)病率和死亡率都居于首位,嚴(yán)重影響人類健康和社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展。尋找有效的作用靶點(diǎn)和可靠的生物標(biāo)志物,為肺癌的預(yù)防、早期診斷和針對(duì)性治療提供依據(jù),是亟待解決的重大公共衛(wèi)生問(wèn)題。mircoRNA是一類高度保守的短鏈非編碼RNA,通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)的方式識(shí)別靶mRNA,調(diào)控基因表達(dá),參與細(xì)胞生長(zhǎng)、分化、周期、凋亡等多個(gè)生物學(xué)過(guò)程。既往研究表明miRNA與腫瘤關(guān)系密切,在腫瘤發(fā)生過(guò)程中起到類似于癌基因或抑癌基因的作用,但是目前尚有大量的miRNA生物學(xué)功能和調(diào)控機(jī)制不明確。miRNA SNP與腫瘤易感性的關(guān)系也逐漸引起人們的重視,當(dāng)SNP發(fā)生在miRNA上時(shí),可能影響miRNA的生物學(xué)功能,進(jìn)而影響腫瘤的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。本研究在生物信息學(xué)分析的基礎(chǔ)上,探討miR-202和miR-1908對(duì)肺癌細(xì)胞的生物學(xué)功能及靶基因調(diào)控作用,分析miR-202和miR-1908在肺癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的作用以及分子機(jī)制。另外,我們采用病例-對(duì)照研究,探究miR-202rs12355840、miR-1908 rs174561、miR-608 rs4919510、miR-548j rs4822739的基因多態(tài)性與肺癌易感性的關(guān)系,并通過(guò)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)分析miR-202 rs12355840、 miR-1908 rs174561對(duì)mir-202和mir-1908表達(dá)量的影響。研究結(jié)果為肺癌的預(yù)防、早期診斷及治療提供生物標(biāo)志物和作用靶點(diǎn)。一、miRNA對(duì)肺癌的調(diào)控研究目的探討miR-202和miR-1908對(duì)肺癌細(xì)胞A549的生物學(xué)功能和靶基因調(diào)控。方法應(yīng)用DIANA-TOOLs及KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)miR-202和miR-1908進(jìn)行生物信息學(xué)分析,探討其可能參與的信號(hào)通路和潛在靶基因。通過(guò)慢病毒轉(zhuǎn)染,上調(diào)和下調(diào)A549細(xì)胞中miR-202和miR-1908的表達(dá),應(yīng)用MTT和流式細(xì)胞技術(shù)分別檢測(cè)miR-202和miR-1908對(duì)A549細(xì)胞增殖、細(xì)胞周期和凋亡的影響。應(yīng)用RT-qPCR和Western blot技術(shù)分別檢測(cè)miR-202和miR-1908對(duì)其預(yù)測(cè)靶基因PIK3CA和PP5的mRNA和蛋白表達(dá)水平的調(diào)控。結(jié)果生物信息學(xué)分析顯示,miR-202參與的信號(hào)通路主要集中在Non-small cell lung cancer等腫瘤相關(guān)通路,并可能通過(guò)對(duì)PIK3CA的靶向調(diào)控發(fā)揮其作用。miR-1908主要參與MAPK signaling pathway等相關(guān)通路的調(diào)控,PP5為其重要潛在靶基因。生物學(xué)功能研究表明,與陰性對(duì)照組相比,上調(diào)miR-202的表達(dá)能夠抑制A549細(xì)胞增殖,引起細(xì)胞周期G1/S期阻滯,對(duì)細(xì)胞凋亡無(wú)明顯影響。上調(diào)的miR-1908的表達(dá)可引起細(xì)胞G2期阻滯,S期減少,對(duì)細(xì)胞增殖和凋亡無(wú)明顯影響。靶基因研究結(jié)果顯示,與陰性對(duì)照組相比,PIK3CA蛋白的表達(dá)量與miR-202呈負(fù)相關(guān),但其mRNA的表達(dá)無(wú)顯著性改變。與陰性對(duì)照組相比,PP5蛋白的表達(dá)量與miR-1908呈正相關(guān),其:mRNA的表達(dá)也無(wú)顯著性改變。結(jié)論miR-202可能通過(guò)對(duì)PIK3CA的負(fù)向調(diào)控影響A549細(xì)胞增殖和細(xì)胞周期,miR-1908可能通過(guò)對(duì)PP5的正向調(diào)控影響A549細(xì)胞周期。二、miRNA基因多態(tài)性與肺癌易感性研究目的探討miR-202、miR-1908、miR-608、miR-548j基因多態(tài)性對(duì)肺癌易感性的影響。方法通過(guò)病例-對(duì)照研究,收集了223例肺癌病例和224例對(duì)照的流行病學(xué)資料和血樣,采用LDR法對(duì)miR-202 rs12355840、miR-1908 rs174561、miR-608 rs4919510、miR-548j rs4822739的基因型分布進(jìn)行檢測(cè),進(jìn)一步按病理類型和吸煙情況進(jìn)行分層分析,探討miRNA SNP對(duì)肺癌易感性的影響。通過(guò)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染,應(yīng)用RT-qPCR技術(shù)分析miR-202和-miR-1908基因多態(tài)性對(duì)其miRNA表達(dá)的影響。結(jié)果人群研究結(jié)果顯示,miR-202 rs12355840、miR-1908 rs174561、miR-608 rs4919510、miR-548j rs4822739的基因型在病例組和對(duì)照組的分布無(wú)顯著性差異,按病理類型和吸煙分層后,也未發(fā)現(xiàn)四種miRNA SNP對(duì)肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在影響。RT-qPCR結(jié)果表明,不同等位基因轉(zhuǎn)染組之間miRNA表達(dá)無(wú)顯著性差異。結(jié)論未發(fā)現(xiàn)miR-202、miR-1908、miR-608、miR-548j基因多態(tài)性與肺癌易感性存在關(guān)聯(lián),miR-202和miR-1908基因突變對(duì)miRNA表達(dá)無(wú)顯著性影響。
【關(guān)鍵詞】:肺癌 miRNA 調(diào)控 易感性
【學(xué)位授予單位】:東南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R734.2
【目錄】:
- 中文摘要5-7
- ABSTRACT7-10
- 縮略詞表10-11
- 前言11-14
- 技術(shù)路線14-15
- 第一章 miRNA對(duì)肺癌的調(diào)控研究15-45
- 第一節(jié) miRNA KEGG信號(hào)通路分析和靶基因預(yù)測(cè)16-23
- 1 材料與方法16-17
- 2 結(jié)果17-21
- 3. 討論21-22
- 4. 結(jié)論22-23
- 第二節(jié) miR-202和miR-1908的生物學(xué)功能研究23-37
- 1 材料與方法23-31
- 2. 結(jié)果31-35
- 3. 討論35-36
- 4. 結(jié)論36-37
- 第三節(jié) miR-202和miR-1908的靶基因調(diào)控研究37-45
- 1. 材料與方法37-41
- 2. 結(jié)果41-43
- 3. 討論43-44
- 4. 結(jié)論44-45
- 第二章 miRNA基因多態(tài)性與肺癌易感性研究45-66
- 第一節(jié) miRNA基因多態(tài)性與肺癌易感性的病例對(duì)照研究46-60
- 1. 材料與方法46-50
- 2. 結(jié)果50-57
- 3. 討論57-59
- 4. 結(jié)論59-60
- 第二節(jié) miRNA等位基因?qū)iRNA表達(dá)的影響60-66
- 1. 材料與方法60-62
- 2. 結(jié)果62-64
- 3. 討論64-65
- 4. 結(jié)論65-66
- 總結(jié)66-67
- 參考文獻(xiàn)67-75
- 綜述75-81
- 參考文獻(xiàn)79-81
- 作者簡(jiǎn)介81-82
- 攻讀碩士期間發(fā)表文章情況82-83
- 致謝83-84
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9 江s,
本文編號(hào):756604
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