EGFR敏感突變肺腺癌患者縱膈淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的檢測與分析
發(fā)布時(shí)間:2017-08-03 21:26
本文關(guān)鍵詞:EGFR敏感突變肺腺癌患者縱膈淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)基因的檢測與分析
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【摘要】:目的本研究采用轉(zhuǎn)錄組測序和生物信息學(xué)分析等方法,以期篩選出肺腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)基因。方法分別檢測伴和不伴縱膈淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的EGFR敏感突變肺腺癌臨床標(biāo)本轉(zhuǎn)錄組表達(dá)譜,篩選出差異表達(dá)基因(DEGs);對這些DEGs進(jìn)行相關(guān)生物信息分析,探索這些基因在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移進(jìn)程中可能發(fā)揮的作用。q-PCR法驗(yàn)證高表達(dá)基因在PC9細(xì)胞株(EGFR敏感突變細(xì)胞株)中的表達(dá)情況。結(jié)果共檢測了10例肺腺癌標(biāo)本的轉(zhuǎn)錄組表達(dá)譜,通過差異基因表達(dá)分析篩選出169個(gè)DEGs,其中,68個(gè)在肺腺癌樣本中表達(dá)上調(diào)、101個(gè)基因表達(dá)下調(diào)。q-PCR結(jié)果顯示:高表達(dá)基因在PC-9細(xì)胞中,ZNF572、BRPF3、MMACHC等7個(gè)基因的表達(dá)量為中豐度,SMOC1、A1BG、BARX1等9個(gè)基因?yàn)榈拓S度,其余均為高豐度。結(jié)論 TFF3及DUSP6等多個(gè)差異表達(dá)基因可能涉及肺腺癌縱膈淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移進(jìn)程。
【作者單位】: 第三軍醫(yī)大學(xué)大坪醫(yī)院野戰(zhàn)外科研究所腫瘤中心;第三軍醫(yī)大學(xué)大坪醫(yī)院野戰(zhàn)外科研究所泌尿外科;
【關(guān)鍵詞】: 肺腺癌 淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移 轉(zhuǎn)錄組測序 差異表達(dá)基因
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81272499)
【分類號】:R734.2
【正文快照】: 肺癌病死率在中國和世界上多數(shù)國家已居癌癥之首,其最常見病理類型為非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC),約占所有肺癌的80%~85%[1]。肺癌治療策略的優(yōu)化依靠準(zhǔn)確的病理分期。目前IASLC(International Association for the Study ofLung Cancer)病理分期[2]包括:
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 高子夜;莊亮;陳元;;吉非替尼對肺癌細(xì)胞株HCC827和H358放射敏感性的影響及其機(jī)制研究[J];中國肺癌雜志;2012年06期
2 喬子君;馬文麗;鄭文嶺;;肥胖患者性別差異的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)分析[J];基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床;2015年06期
【共引文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 曹U,
本文編號:616419
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