本文關(guān)鍵詞：金屬基質(zhì)蛋白酶家族的基因表達(dá)譜及其相關(guān)蛋白互作網(wǎng)絡(luò)參與胃癌發(fā)生機(jī)制的作用研究

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【摘要】：胃癌是世界上最常見的惡性腫瘤之一,其發(fā)生率位居全球第四,死亡率位居全球第二。胃癌的發(fā)生、發(fā)展是一個(gè)復(fù)雜的、涉及多基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)失衡導(dǎo)致的細(xì)胞異常代謝的結(jié)果。金屬基質(zhì)蛋白酶(Matrix metalloproteinase,MMPs)是一類內(nèi)源性蛋白水解酶,能特異地降解基底膜和細(xì)胞外基質(zhì)成分,參與血管生成,細(xì)胞的增殖及凋亡等生物學(xué)過程,對細(xì)胞的遷移和侵襲具有重要的調(diào)控作用。已有研究表明,MMPs與胃癌,肺癌,乳腺癌等惡性腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)。雖然MMPs與癌癥的相關(guān)性已經(jīng)得到公認(rèn),但是對于了解癌癥的發(fā)生機(jī)制仍然有限。因此,通過建立胃癌中MMPs的蛋白互作網(wǎng)絡(luò),系統(tǒng)而全面的分析基因間的調(diào)控關(guān)系將對闡釋胃癌的分子病理機(jī)制具有重要意義。本研究通過基因芯片技術(shù)高通量的分析10對胃癌組織和癌旁正常組織的差異表達(dá)基因,分別使用Matlab軟件和David數(shù)據(jù)庫對差異表達(dá)基因進(jìn)行聚類分析和生物功能及pathway富集分析。使用實(shí)時(shí)定量PCR(Real Time-PCR,RT-PCR)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證MMPs家族在胃癌中的mRNA表達(dá)水平,基于BioGRID數(shù)據(jù)庫和STRING數(shù)據(jù)庫預(yù)測MMPs家族的相互作用蛋白。結(jié)合數(shù)據(jù)庫預(yù)測的MMPs互作蛋白及芯片篩選的胃癌差異表達(dá)譜,構(gòu)建胃癌中MMPs家族相關(guān)蛋白互作網(wǎng)絡(luò),并分析網(wǎng)絡(luò)中關(guān)鍵基因的生物功能及pathway�；蛐酒Y(jié)果顯示,共有1666個(gè)基因在胃癌組織中出現(xiàn)顯著差異表達(dá),其中1540基因出現(xiàn)表達(dá)上調(diào),126個(gè)基因表現(xiàn)為表達(dá)下調(diào)。表達(dá)上調(diào)的基因主要涉及肽鏈內(nèi)切酶活化、蛋白酶活化、金屬肽鏈內(nèi)切酶活化、細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)構(gòu)等細(xì)胞信號傳導(dǎo)途徑。表達(dá)下調(diào)的基因主要涉及消化作用、離子轉(zhuǎn)運(yùn)、金屬離子運(yùn)輸、氧化還原、胃酸分泌等細(xì)胞信號傳導(dǎo)途徑。RT-PCR實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí)胃癌組織中的MMP家族的基因表達(dá)水平顯著高于正常胃粘膜組織,且其表達(dá)水平與基因芯片結(jié)果相一致�；贐ioGRID數(shù)據(jù)庫及STRING數(shù)據(jù)庫預(yù)測的MMP家族互作基因以及基因芯片篩選到的胃癌中出現(xiàn)差異表達(dá)的基因,構(gòu)建出胃癌中MMP家族相關(guān)的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò),其中18個(gè)基因在胃癌中與MMP家族密切作用,主要涉及細(xì)胞外基質(zhì)分解及細(xì)胞外基質(zhì)受體互作等pathway,且與腫瘤浸潤和轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。綜上所述,MMP家族在胃癌組織中出現(xiàn)顯著高表達(dá),通過構(gòu)建胃癌中MMP家族相關(guān)的蛋白互作網(wǎng)絡(luò),揭示MMP家族在胃癌中主要參與腫瘤細(xì)胞的細(xì)胞外基質(zhì)的分解等細(xì)胞信號傳導(dǎo)途徑,隨著MMP家族與胃癌關(guān)系的深入研究,將有助于探索腫瘤的發(fā)病機(jī)制和為腫瘤治療提供新靶點(diǎn)。
【關(guān)鍵詞】：金屬基質(zhì)蛋白酶 胃癌 蛋白互作 基因芯片
【學(xué)位授予單位】：吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R735.2
【目錄】：

• 中文摘要4-6
• Abstract6-9
• 英文縮寫詞表9-10
• 第1章 緒論10-20
• 1.1 胃癌流行病學(xué)調(diào)查10-11
• 1.1.1 胃癌的發(fā)病及流行情況10
• 1.1.2 胃癌的侵襲和轉(zhuǎn)移10-11
• 1.1.3 腫瘤細(xì)胞侵襲和轉(zhuǎn)移的機(jī)制11
• 1.1.4 胃癌的治療方法11
• 1.2 MMPS家族與胃癌的關(guān)系11-14
• 1.2.1 MMPs的結(jié)構(gòu)、分類與功能11-12
• 1.2.2 MMPs家族成員與胃癌的關(guān)系12-14
• 1.3 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)與胃癌14-20
• 1.3.1 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)概述14-16
• 1.3.2 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)特征16
• 1.3.3 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建方法16-18
• 1.3.4 胃癌的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)18-19
• 1.3.5 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的意義19-20
• 第2章 實(shí)驗(yàn)研究20-44
• 2.1 基因表達(dá)譜芯片篩選胃癌的差異表達(dá)基因20-34
• 2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料20-22
• 2.1.2 實(shí)驗(yàn)方法22-26
• 2.1.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果26-34
• 2.2 MMP家族在胃癌中表達(dá)分析及相關(guān)蛋白互作網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建34-44
• 2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料34-35
• 2.2.2 實(shí)驗(yàn)方法35-38
• 2.2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果38-44
• 第3章 討論44-48
• 第4章 結(jié)論48-49
• 參考文獻(xiàn)49-54
• 作者簡介及在學(xué)期間所取得的科研成果54

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

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本文編號：533684