本文關(guān)鍵詞：探索乳腺癌細(xì)胞系中曲妥珠單抗耐藥相關(guān)的生物標(biāo)志物，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：乳腺癌在全球女性人群的發(fā)病率和死亡率和其他惡性腫瘤相比均居首位,二十世紀(jì)80年代以來(lái)乳腺癌的死亡率逐年穩(wěn)步下降得益于早期診斷和治療手段的進(jìn)步。其中,針對(duì)EGFR家族蛋白HER2的曲妥珠單抗(Trastuzumab),有著里程碑式的意義。然而隨著曲妥珠單抗應(yīng)用的普及,對(duì)曲妥珠單抗耐藥的處理也越發(fā)棘手。人們希望可以找到一些生物學(xué)標(biāo)記物來(lái)預(yù)測(cè)曲妥珠單抗治療是否會(huì)成功。目前研究的一系列曲妥珠單抗耐藥相關(guān)的生物標(biāo)志物大多都從曲妥珠單抗的作用機(jī)理角度出發(fā),但經(jīng)過(guò)臨床驗(yàn)證的并不多。本實(shí)驗(yàn)研究希望通過(guò)公共數(shù)據(jù)庫(kù)中的臨床資料,結(jié)合自己構(gòu)建的曲妥珠單抗耐藥模型,探索更有效地篩查曲妥珠單抗耐藥相關(guān)生物學(xué)標(biāo)記物的可能性。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)對(duì)耐藥細(xì)胞株的高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,結(jié)合TCGA表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫(kù)的共表達(dá)聚類(lèi)分析,得到一系列潛在的有功能差異表達(dá)基因,并從中成功地發(fā)現(xiàn)KLK10可作為曲妥珠單抗耐藥相關(guān)的生物標(biāo)志物,并進(jìn)一步驗(yàn)證了KLK10可能逆轉(zhuǎn)曲妥珠單抗耐藥的潛在靶點(diǎn)。因此,本研究結(jié)果為尋找有效的曲妥珠單抗耐藥預(yù)測(cè)標(biāo)記物和治療靶點(diǎn)提供了新的思路和線(xiàn)索。
【關(guān)鍵詞】：曲妥珠單抗耐藥 生物標(biāo)志物 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 共表達(dá)分析 KLK10
【學(xué)位授予單位】：浙江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：R737.9
【目錄】：

• 致謝4-5
• 摘要5-6
• Abstract6-8
• 縮寫(xiě)、術(shù)語(yǔ)表8-12
• 1. 引言12-15
• 1.1. 實(shí)驗(yàn)背景與實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>12-14
• 1.2. 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)14-15
• 1.2.1. 構(gòu)建曲妥珠單抗耐藥細(xì)胞模型14
• 1.2.2. 表達(dá)譜分析14
• 1.2.3. 共表達(dá)分析14-15
• 2. 實(shí)驗(yàn)材料與方法15-29
• 2.1. 構(gòu)建曲妥珠單抗耐藥細(xì)胞模型15-19
• 2.1.1. 曲妥珠單抗耐藥細(xì)胞模型構(gòu)建15-16
• 2.1.2. 曲妥珠單抗耐藥細(xì)胞模型的評(píng)估16-19
• 2.1.2.1. 光學(xué)顯微鏡觀察16
• 2.1.2.2. 細(xì)胞增殖活性測(cè)定16-17
• 2.1.2.3. 細(xì)胞凋亡率測(cè)定17-18
• 2.1.2.4. 細(xì)胞周期測(cè)定18-19
• 2.2. 表達(dá)譜分析19-24
• 2.2.1. 全轉(zhuǎn)錄組基因測(cè)序19-20
• 2.2.2. 表達(dá)譜數(shù)據(jù)與已知基因組的比對(duì)20-21
• 2.2.3. 基因注釋和差異表達(dá)分析21-24
• 2.2.3.1. 獲取經(jīng)過(guò)注釋的差異表達(dá)數(shù)據(jù)21
• 2.2.3.2. 測(cè)序和差異表達(dá)分析準(zhǔn)確性驗(yàn)證21-23
• 2.2.3.3. 代表性功能基因分析23-24
• 2.3. 共表達(dá)分析24-29
• 2.3.1. TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的共表達(dá)分析24-25
• 2.3.1.1. 下載和整理TCGA數(shù)據(jù)24
• 2.3.1.2. 選取數(shù)據(jù)集進(jìn)行共表達(dá)聚類(lèi)24-25
• 2.3.2. 共表達(dá)分析結(jié)合耐藥細(xì)胞表達(dá)譜分析25
• 2.3.3. 探索個(gè)別基因作為生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)的可能性25-29
• 2.3.3.1. 差異表達(dá)驗(yàn)證25-26
• 2.3.3.2. siRNA干擾表達(dá)下細(xì)胞增殖活性測(cè)定26
• 2.3.3.3. siRNA干擾表達(dá)下細(xì)胞周期改變測(cè)定26-27
• 2.3.3.4. 通過(guò)細(xì)胞周期相關(guān)標(biāo)記分子測(cè)定siRNA干擾表達(dá)下曲妥珠單抗抑制率改變27-28
• 2.3.3.5. TCGA生存分析28-29
• 3. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論29-46
• 3.1. 構(gòu)建曲妥珠單抗耐藥細(xì)胞模型29-33
• 3.1.1. 曲妥珠單抗耐藥細(xì)胞模型構(gòu)建29
• 3.1.2. 曲妥珠單抗耐藥細(xì)胞模型的評(píng)估29-32
• 3.1.2.1. 光學(xué)顯微鏡觀察29-30
• 3.1.2.2. 細(xì)胞增殖活性測(cè)定30-31
• 3.1.2.3. 細(xì)胞凋亡率測(cè)定31-32
• 3.1.2.4. 細(xì)胞周期測(cè)定32
• 3.1.3. 討論32-33
• 3.2. 表達(dá)譜分析33-38
• 3.2.1. 全轉(zhuǎn)錄組基因測(cè)序33
• 3.2.2. 表達(dá)譜數(shù)據(jù)分析33-38
• 3.2.2.1. 表達(dá)譜數(shù)據(jù)與已知基因組的比對(duì)33-34
• 3.2.2.2. 基因注釋和差異表達(dá)分析34-36
• 3.2.2.3. 代表性功能基因分析36-38
• 3.2.3. 討論38
• 3.3. 共表達(dá)分析38-46
• 3.3.1. TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的共表達(dá)分析38-39
• 3.3.1.1. 下載和整理TCGA數(shù)據(jù)38-39
• 3.3.1.2. 選取數(shù)據(jù)集進(jìn)行共表達(dá)聚類(lèi)39
• 3.3.2. 共表達(dá)分析結(jié)合耐藥細(xì)胞表達(dá)譜分析39-40
• 3.3.3. 探索個(gè)別基因作為生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)的可能性40-44
• 3.3.3.1. 差異表達(dá)驗(yàn)證40-41
• 3.3.3.2. siRNA干擾表達(dá)下細(xì)胞增殖活性測(cè)定41-42
• 3.3.3.3. siRNA干擾表達(dá)下細(xì)胞周期改變測(cè)定42-43
• 3.3.3.4. 通過(guò)細(xì)胞周期相關(guān)標(biāo)記分子測(cè)定siRNA干擾表達(dá)下曲妥珠單抗抑制率改變43-44
• 3.3.3.5. TCGA生存分析44
• 3.3.4. 討論44-46
• 結(jié)論46-47
• 參考文獻(xiàn)47-53
• 綜述53-61
• 參考文獻(xiàn)57-61
• 作者簡(jiǎn)介61

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 ;Expression and functional characterization of platelet-derived growth factor receptor-like gene[J];World Journal of Gastroenterology;2010年12期

  本文關(guān)鍵詞：探索乳腺癌細(xì)胞系中曲妥珠單抗耐藥相關(guān)的生物標(biāo)志物，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

，

本文編號(hào)：469555