Allo-HSCT后早期TCR組庫(kù)特征與動(dòng)態(tài)演變規(guī)律的研究
發(fā)布時(shí)間:2024-10-02 22:44
目的:分析異基因造血干細(xì)胞移植(allo-HSCT)后T細(xì)胞免疫組庫(kù)的基本特征和動(dòng)態(tài)演變,在TCR免疫組庫(kù)水平理解移植后T細(xì)胞免疫重建的規(guī)律,分析其對(duì)移植后復(fù)發(fā)、Gv HD、病毒感染等主要并發(fā)癥產(chǎn)生的影響,探索其對(duì)臨床工作的指導(dǎo)作用和應(yīng)用前景。方法:入組進(jìn)行allo-HSCT的惡性血液病病人30例,分別對(duì)其移植物(d0)、移植后1個(gè)月(d28)和移植后2個(gè)月(d61)的外周血進(jìn)行高通量測(cè)序,得到的TCRβ鏈CDR3免疫組庫(kù)結(jié)合患者隨訪1年的臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行分析;诮M庫(kù)數(shù)據(jù)特征和研究目的,創(chuàng)造性地設(shè)計(jì)T細(xì)胞響應(yīng)指數(shù)(TCRI),分析其特性后將其運(yùn)用到數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析中。結(jié)果:1.allo-HSCT后TCR免疫組庫(kù)的反Simpson多樣性指數(shù)不斷下降(僅d0和d61之間p=0.01),克隆性指數(shù)不斷上升(p=0.001),非復(fù)發(fā)組d28克隆性指數(shù)顯著高于復(fù)發(fā)組(p=0.018),急性Gv HD組和無(wú)急性Gv HD組、CMV激活組和無(wú)CMV激活組之間均無(wú)顯著差異。2.半相合移植組的TCRI在第一個(gè)月(TCRI200ab)、第二個(gè)月(TCRI200bc)和前兩個(gè)月(TCRI200ac)均顯著高于非半...
【文章頁(yè)數(shù)】:109 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
縮略語(yǔ)表
摘要
Abstract
前言
第一章 研究背景
1.1 造血干細(xì)胞移植
1.1.1 造血干細(xì)胞移植的發(fā)展過(guò)程
1.1.2 造血干細(xì)胞移植的分類
1.1.3 造血干細(xì)胞移植的過(guò)程
1.1.4 造血干細(xì)胞采集物的成分
1.1.5 造血干細(xì)胞移植后的主要并發(fā)癥
1.2 移植后免疫重建
1.2.1 allo-HSCT后免疫細(xì)胞數(shù)量和功能重建
1.2.2 allo-HSCT后患者T細(xì)胞來(lái)源和重建
1.2.3 allo-HSCT后抗原提呈與識(shí)別
1.3 TCR免疫組庫(kù)
1.3.1 TCR
1.3.2 T細(xì)胞免疫組庫(kù)
1.3.3 下一代測(cè)序技術(shù)
1.3.4 相關(guān)研究進(jìn)展
1.4 本研究的主要目的和研究思路
第二章 實(shí)驗(yàn)與數(shù)據(jù)可靠性分析
2.1 實(shí)驗(yàn)流程和倫理申報(bào)
2.1.1 實(shí)驗(yàn)流程圖
2.1.2 倫理申報(bào)
2.1.3 臨床試驗(yàn)注冊(cè)
2.2 提取單個(gè)核細(xì)胞RNA
2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.3 實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)
2.3 免疫組庫(kù)高通量測(cè)序
2.3.1 測(cè)序的流程
2.3.2 TCR免疫組庫(kù)高通量測(cè)序
2.4 測(cè)序數(shù)據(jù)規(guī)律分析
2.4.1 測(cè)序數(shù)據(jù)重復(fù)性
2.4.2 測(cè)序數(shù)據(jù)代表性
2.4.3 測(cè)序數(shù)據(jù)偏倚
第三章 新指數(shù)的設(shè)計(jì)與特點(diǎn)
3.1 新指數(shù)的設(shè)計(jì)
3.1.1 本研究的指導(dǎo)思想
3.1.2 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
3.1.3 新指數(shù)的設(shè)計(jì)過(guò)程
3.2 新指數(shù)的特點(diǎn)
3.2.1 新指數(shù)的特征
3.2.2 新指數(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)
3.2.3 應(yīng)用新指數(shù)的注意事項(xiàng)
3.3 新指數(shù)與常用指數(shù)對(duì)比
3.3.1 分析免疫組庫(kù)的常用指數(shù)
3.3.2 新指數(shù)與傳統(tǒng)常用指數(shù)對(duì)比
第四章 結(jié)果分析與討論
4.1 移植后早期TCR組庫(kù)特征
4.1.1 統(tǒng)計(jì)分析方法
4.1.2 患者的臨床數(shù)據(jù)
4.1.3 患者的測(cè)序數(shù)據(jù)
4.1.4 移植后TCR免疫組庫(kù)多樣性和克隆性變化趨勢(shì)
4.1.5 討論
4.2 TCR組庫(kù)動(dòng)態(tài)變化與移植后主要并發(fā)癥
4.2.1 移植后TCR組庫(kù)中的主要克隆
4.2.2 移植后免疫組庫(kù)不平行擴(kuò)增與臨床并發(fā)癥的關(guān)系
4.2.3 VDJ片段使用率及氨基酸組成與臨床并發(fā)癥
4.2.4 討論
4.3 GvL相關(guān)克隆共性分析
4.3.1 GvL相關(guān)克隆的共性分析
4.3.2 患者間共享特異性的GvL相關(guān)克隆特征
4.3.3 討論
第五章 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
作者在學(xué)期間取得的學(xué)術(shù)成果
主要簡(jiǎn)歷
致謝
本文編號(hào):4006445
【文章頁(yè)數(shù)】:109 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
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摘要
Abstract
前言
第一章 研究背景
1.1 造血干細(xì)胞移植
1.1.1 造血干細(xì)胞移植的發(fā)展過(guò)程
1.1.2 造血干細(xì)胞移植的分類
1.1.3 造血干細(xì)胞移植的過(guò)程
1.1.4 造血干細(xì)胞采集物的成分
1.1.5 造血干細(xì)胞移植后的主要并發(fā)癥
1.2 移植后免疫重建
1.2.1 allo-HSCT后免疫細(xì)胞數(shù)量和功能重建
1.2.2 allo-HSCT后患者T細(xì)胞來(lái)源和重建
1.2.3 allo-HSCT后抗原提呈與識(shí)別
1.3 TCR免疫組庫(kù)
1.3.1 TCR
1.3.2 T細(xì)胞免疫組庫(kù)
1.3.3 下一代測(cè)序技術(shù)
1.3.4 相關(guān)研究進(jìn)展
1.4 本研究的主要目的和研究思路
第二章 實(shí)驗(yàn)與數(shù)據(jù)可靠性分析
2.1 實(shí)驗(yàn)流程和倫理申報(bào)
2.1.1 實(shí)驗(yàn)流程圖
2.1.2 倫理申報(bào)
2.1.3 臨床試驗(yàn)注冊(cè)
2.2 提取單個(gè)核細(xì)胞RNA
2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.3 實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)
2.3 免疫組庫(kù)高通量測(cè)序
2.3.1 測(cè)序的流程
2.3.2 TCR免疫組庫(kù)高通量測(cè)序
2.4 測(cè)序數(shù)據(jù)規(guī)律分析
2.4.1 測(cè)序數(shù)據(jù)重復(fù)性
2.4.2 測(cè)序數(shù)據(jù)代表性
2.4.3 測(cè)序數(shù)據(jù)偏倚
第三章 新指數(shù)的設(shè)計(jì)與特點(diǎn)
3.1 新指數(shù)的設(shè)計(jì)
3.1.1 本研究的指導(dǎo)思想
3.1.2 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
3.1.3 新指數(shù)的設(shè)計(jì)過(guò)程
3.2 新指數(shù)的特點(diǎn)
3.2.1 新指數(shù)的特征
3.2.2 新指數(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)
3.2.3 應(yīng)用新指數(shù)的注意事項(xiàng)
3.3 新指數(shù)與常用指數(shù)對(duì)比
3.3.1 分析免疫組庫(kù)的常用指數(shù)
3.3.2 新指數(shù)與傳統(tǒng)常用指數(shù)對(duì)比
第四章 結(jié)果分析與討論
4.1 移植后早期TCR組庫(kù)特征
4.1.1 統(tǒng)計(jì)分析方法
4.1.2 患者的臨床數(shù)據(jù)
4.1.3 患者的測(cè)序數(shù)據(jù)
4.1.4 移植后TCR免疫組庫(kù)多樣性和克隆性變化趨勢(shì)
4.1.5 討論
4.2 TCR組庫(kù)動(dòng)態(tài)變化與移植后主要并發(fā)癥
4.2.1 移植后TCR組庫(kù)中的主要克隆
4.2.2 移植后免疫組庫(kù)不平行擴(kuò)增與臨床并發(fā)癥的關(guān)系
4.2.3 VDJ片段使用率及氨基酸組成與臨床并發(fā)癥
4.2.4 討論
4.3 GvL相關(guān)克隆共性分析
4.3.1 GvL相關(guān)克隆的共性分析
4.3.2 患者間共享特異性的GvL相關(guān)克隆特征
4.3.3 討論
第五章 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
作者在學(xué)期間取得的學(xué)術(shù)成果
主要簡(jiǎn)歷
致謝
本文編號(hào):4006445
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