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LncRNA HOTAIR調(diào)控通路遺傳變異與肝癌易感性關(guān)聯(lián)研究

發(fā)布時間:2024-04-18 02:18
  目的:原發(fā)性肝癌(Primary liver cancer,PLC),簡稱肝癌,是全球最常見的惡性腫瘤之一,近年來我國新發(fā)肝癌人數(shù)約占全球肝癌新發(fā)總數(shù)的一半,并且肝癌患者預(yù)后差,生存率低,導(dǎo)致肝癌死亡率和發(fā)病率幾近相同。最新研究表明肝癌在廣東省惡性腫瘤新發(fā)病和死亡譜中分別排第4和第2順位,其不斷增加的發(fā)病率和死亡率給廣東省帶來沉重的疾病負(fù)擔(dān),是嚴(yán)重威脅居民健康和生命的惡性腫瘤。肝癌被認(rèn)為是環(huán)境暴露與遺傳因素共同作用的結(jié)果,HOX轉(zhuǎn)錄反義RNA(HOX transcript antisense RNA,HOTAIR)作為研究最多最熱門的LncRNA之一,在人類惡性腫瘤中上調(diào),與癌癥的發(fā)生和轉(zhuǎn)移呈正相關(guān)。HOTAIR具有復(fù)雜的生物學(xué)功能,基因遺傳變異可以影響自身結(jié)構(gòu)改變,影響轉(zhuǎn)錄和表達(dá),從而干擾下游靶基因的功能,與下游靶基因的遺傳變異共同促進(jìn)肝癌發(fā)生發(fā)展。因此,本研究結(jié)合分子流行病學(xué)、分子生物學(xué)和生物信息學(xué)方法,探討LncRNA HOTAIR調(diào)控通路遺傳變異的單獨(dú)作用,遺傳變異-環(huán)境、遺傳變異間交互和中介效應(yīng)對肝癌發(fā)生的影響,并進(jìn)一步探究HOTAIR調(diào)控通路遺傳變異單獨(dú)作用和遺傳變異-環(huán)境...

【文章頁數(shù)】:98 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1.1技術(shù)路線圖

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廣東藥科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文6圖1.1技術(shù)路線圖


圖2.1TaqMan檢測原理

圖2.1TaqMan檢測原理

廣東藥科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文14圖2.1TaqMan檢測原理(3)TaqMan基因分型步驟a.DNA稀釋與轉(zhuǎn)移:根據(jù)DNA測定的濃度,加入DNAElutionBuffer稀釋DNA濃度到5-10ng/1。根據(jù)96孔板排版,將DNA稀釋液轉(zhuǎn)移至96孔板(已滅菌),用鋁膜紙(13c....


圖2.2四向分解關(guān)系圖

圖2.2四向分解關(guān)系圖

廣東藥科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文17函數(shù)進(jìn)行估計,決定由該子數(shù)據(jù)集樹模型的拓展形狀,使用貝葉斯先驗(yàn)分類概率和交叉驗(yàn)證來估計錯分概率,從而對樹進(jìn)行剪修得到最終模型。對于有交互作用的變量,進(jìn)一步應(yīng)用四向分解法細(xì)分基因或環(huán)境對肝癌發(fā)生的中介效應(yīng)。設(shè)A表示感興趣的暴露,Y表示目標(biāo)結(jié)局,如果....


圖3.2顯性模型下HOTAIRrs3816153與環(huán)境交互作用對肝癌發(fā)生的影響

圖3.2顯性模型下HOTAIRrs3816153與環(huán)境交互作用對肝癌發(fā)生的影響

廣東藥科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文26圖3.1顯性模型下HOTAIRrs12427129與環(huán)境交互作用對肝癌發(fā)生的影響注釋:調(diào)整OR(95%CI)/P值:由多因素Logistic回歸模型計算,調(diào)整年齡、性別、吸煙、飲酒、癌癥家族史和慢性HBV感染;P*=Pmul:相乘交互的P值;P*....



本文編號:3957274

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