目的:頭頸部鱗狀細(xì)胞癌(HNSCC)是世界上第六大常見癌癥,每年新發(fā)病例超過65萬。盡管最近在分子病理學(xué)方面的進(jìn)展和靶向治療顯著改善了HNSCC患者的預(yù)后,但是沒有特定的生物標(biāo)志物或類似的有效靶向分子療法可用于篩查和治療HNSCC。最近,已經(jīng)報(bào)道了在各種癌癥(包括HNSCC)中mRNA表達(dá)的臨床意義的重要性。PLAU(uPA)是一種絲氨酸蛋白酶。PLAU作為參與細(xì)胞外基質(zhì)降解的主要蛋白水解酶之一,已被證明在發(fā)育和腫瘤發(fā)生過程中在組織重塑和遷移中發(fā)揮關(guān)鍵作用�；诋�(dāng)前HNSCC的基因組方法,迫切需要研究預(yù)后生物標(biāo)志物和治療選擇。我們通過癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫,深入分析PLAU在頭頸鱗癌組織中的差異性表達(dá),并認(rèn)為PLAU mRNA可作為頭頸鱗癌生物標(biāo)記物。方法:利用癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫下載頭頸鱗癌相關(guān)數(shù)據(jù)集,分析腫瘤組織與正常組織之間PLAU的表達(dá)差異;應(yīng)用在線數(shù)據(jù)庫UCSC Xena分析PLAU mRNA表達(dá)水平與頭頸鱗癌患者預(yù)后的關(guān)系;通過在線免疫組織化學(xué)數(shù)據(jù)庫觀察頭頸鱗癌組織中PLAU蛋白的表達(dá)水平;PLAU在頭頸鱗癌的功能可用基因集富集的方法。基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)...

【文章頁數(shù)】：39 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1.PLAU在HNSCC患者中癌和癌旁的差異表達(dá)A．HNSCC癌組織與癌旁組織中，PLAU基因差異表達(dá)結(jié)果；B.對比正常細(xì)胞HEPM與頭鱗頸癌FaDu細(xì)胞中，PLAU基因表達(dá)情況，顯示在FaDu細(xì)胞中PLAU呈現(xiàn)高表達(dá)；C.對比正常

中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文73結(jié)果3.1HNSCC患者中PLAU的表達(dá)情況在HNSCC患者的564個(gè)樣本中，520例癌組織與44例癌旁組織相比，我們發(fā)現(xiàn)PLAU的表達(dá)在癌組織中明顯上調(diào)(p<0.0001,圖1A)。WesternBlot結(jié)果顯示也證實(shí)這一觀點(diǎn)(p<0.001,圖1B....

圖2.PLAU在HNSC表達(dá)高低與患者生存的關(guān)系

中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文83.2高PLAU表達(dá)可能是HNSCC患者的獨(dú)立預(yù)測因子我們隨后評估PLAU了對HNSCC的重要性;在TCGAHNSCC隊(duì)列中驗(yàn)證了PLAU表達(dá)與OS的表達(dá)之間的關(guān)系。TCGA-HNSCC中的OS曲線的對數(shù)秩檢驗(yàn)表明，與5年（圖2A），10年（圖2B）和1....

圖3.頭頸部癌變正常和癌組織口腔上皮中PLAU的免疫組織化學(xué)染色A,C.人類蛋白質(zhì)質(zhì)譜顯示，HNSCC患者癌組織中的PLAU稱強(qiáng)陽性（棕色）；B,D.人類蛋白質(zhì)質(zhì)譜顯示，正�？谇徽衬そM織中的PLAU染色無反應(yīng)

中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文93.3PLAU蛋白在HNSCC中表達(dá)情況通過HPA（人類蛋白質(zhì)圖譜）中的數(shù)據(jù)挖掘，PLAU主要在細(xì)胞質(zhì)中表達(dá)，左側(cè)的兩個(gè)圖顯示PLAU（棕色）的強(qiáng)烈陽性，而右側(cè)作為對照組織的正常口腔黏膜組織幾乎沒有反應(yīng)。在左側(cè)，HNSCC樣品中PLAU的強(qiáng)烈細(xì)胞質(zhì)陽性（....

圖4.鑒定PLAU相關(guān)的信號傳導(dǎo)途徑，基因集富集分析（GSEA）的富集圖

中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文103.4GSEA標(biāo)識PLAU相關(guān)的信號傳導(dǎo)途徑為了鑒定PLAU可能影響腫瘤發(fā)展的潛在相關(guān)機(jī)制，通過PLAU表達(dá)以中值分為高低兩組然后根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化富集評分（NES）選擇與腫瘤生物學(xué)過程相關(guān)的顯著富集途徑（圖4和表1），從圖4中可看出，高表達(dá)PLAU在TCGA....

本文編號：3951555