目的:頭頸部鱗狀細胞癌(HNSCC)是世界上第六大常見癌癥,每年新發(fā)病例超過65萬。盡管最近在分子病理學方面的進展和靶向治療顯著改善了HNSCC患者的預后,但是沒有特定的生物標志物或類似的有效靶向分子療法可用于篩查和治療HNSCC。最近,已經(jīng)報道了在各種癌癥(包括HNSCC)中mRNA表達的臨床意義的重要性。PLAU(uPA)是一種絲氨酸蛋白酶。PLAU作為參與細胞外基質(zhì)降解的主要蛋白水解酶之一,已被證明在發(fā)育和腫瘤發(fā)生過程中在組織重塑和遷移中發(fā)揮關鍵作用�；诋斍癏NSCC的基因組方法,迫切需要研究預后生物標志物和治療選擇。我們通過癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫,深入分析PLAU在頭頸鱗癌組織中的差異性表達,并認為PLAU mRNA可作為頭頸鱗癌生物標記物。方法:利用癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫下載頭頸鱗癌相關數(shù)據(jù)集,分析腫瘤組織與正常組織之間PLAU的表達差異;應用在線數(shù)據(jù)庫UCSC Xena分析PLAU mRNA表達水平與頭頸鱗癌患者預后的關系;通過在線免疫組織化學數(shù)據(jù)庫觀察頭頸鱗癌組織中PLAU蛋白的表達水平;PLAU在頭頸鱗癌的功能可用基因集富集的方法�；诰W(wǎng)絡藥理學預...

【文章頁數(shù)】：39 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1.PLAU在HNSCC患者中癌和癌旁的差異表達A．HNSCC癌組織與癌旁組織中，PLAU基因差異表達結果；B.對比正常細胞HEPM與頭鱗頸癌FaDu細胞中，PLAU基因表達情況，顯示在FaDu細胞中PLAU呈現(xiàn)高表達；C.對比正常

中國醫(yī)科大學碩士學位論文73結果3.1HNSCC患者中PLAU的表達情況在HNSCC患者的564個樣本中，520例癌組織與44例癌旁組織相比，我們發(fā)現(xiàn)PLAU的表達在癌組織中明顯上調(diào)(p<0.0001,圖1A)。WesternBlot結果顯示也證實這一觀點(p<0.001,圖1B....

圖2.PLAU在HNSC表達高低與患者生存的關系

中國醫(yī)科大學碩士學位論文83.2高PLAU表達可能是HNSCC患者的獨立預測因子我們隨后評估PLAU了對HNSCC的重要性;在TCGAHNSCC隊列中驗證了PLAU表達與OS的表達之間的關系。TCGA-HNSCC中的OS曲線的對數(shù)秩檢驗表明，與5年（圖2A），10年（圖2B）和1....

圖3.頭頸部癌變正常和癌組織口腔上皮中PLAU的免疫組織化學染色A,C.人類蛋白質(zhì)質(zhì)譜顯示，HNSCC患者癌組織中的PLAU稱強陽性（棕色）；B,D.人類蛋白質(zhì)質(zhì)譜顯示，正�？谇徽衬そM織中的PLAU染色無反應

中國醫(yī)科大學碩士學位論文93.3PLAU蛋白在HNSCC中表達情況通過HPA（人類蛋白質(zhì)圖譜）中的數(shù)據(jù)挖掘，PLAU主要在細胞質(zhì)中表達，左側的兩個圖顯示PLAU（棕色）的強烈陽性，而右側作為對照組織的正�？谇火つそM織幾乎沒有反應。在左側，HNSCC樣品中PLAU的強烈細胞質(zhì)陽性（....

圖4.鑒定PLAU相關的信號傳導途徑，基因集富集分析（GSEA）的富集圖

中國醫(yī)科大學碩士學位論文103.4GSEA標識PLAU相關的信號傳導途徑為了鑒定PLAU可能影響腫瘤發(fā)展的潛在相關機制，通過PLAU表達以中值分為高低兩組然后根據(jù)標準化富集評分（NES）選擇與腫瘤生物學過程相關的顯著富集途徑（圖4和表1），從圖4中可看出，高表達PLAU在TCGA....

本文編號：3951555