目的采用同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)分析-生物信息學(xué)-質(zhì)譜多反應(yīng)檢測(multiple reaction monitoring,MRM)技術(shù)的聯(lián)合策略,篩選并驗(yàn)證低級(jí)別膀胱尿路上皮癌(low grade bladder urothelial carcinoma,LBUC)的特異性尿液差異蛋白;應(yīng)用Meta分析整合其他科研小組獲得的BUC尿液差異蛋白,構(gòu)建BUC尿液差異蛋白數(shù)據(jù)集;確定單一候選差異蛋白用于LBUC判別模型的應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)并驗(yàn)證。方法分別收集健康志愿者和經(jīng)病理檢測確診為LBUC患者的術(shù)前尿液標(biāo)本,按比例混合后獲得對(duì)照組(N組)和LBUC組(L組)的混合尿液標(biāo)本各兩例,采用i TRAQ技術(shù)對(duì)各組尿液標(biāo)本進(jìn)行蛋白質(zhì)組標(biāo)志物定量表達(dá)譜分析,找出兩組間的尿液差異蛋白;經(jīng)基因本體論(Gene Ontology,GO)分析和蛋白Pathway分析,挑選出與BUC發(fā)生發(fā)展、浸潤轉(zhuǎn)移相關(guān)的差異蛋白。應(yīng)用MRM技術(shù)在N組和L組尿液(每組各5例獨(dú)立標(biāo)本)中驗(yàn)證上述蛋白,最終獲得可信的...

【文章頁數(shù)】：82 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1LBUC組與健康對(duì)照組比較的尿液差異蛋白火山圖

-10-獨(dú)特的肽段，約82%肽段由7～16個(gè)氨基酸組成，70%左右的蛋白分子量在10～70kD，其中大于100kD的蛋白占約20%，74%的蛋白質(zhì)序列覆蓋率大于5%。這些結(jié)果表明，數(shù)據(jù)符合進(jìn)一步分析的要求。L1/N1、L1/N2、L2/N1、L2/N2被設(shè)置為比較組。以表達(dá)差異大....

圖2LBUC尿液差異蛋白的GO富集分析

-15-1.2.2LBUC尿液差異蛋白的生物信息學(xué)分析1）LBUC尿液差異蛋白的GO功能富集分析生物信息學(xué)分析的GO富集分析將所有LBUC尿液差異蛋白分為三大類，即生物過程、細(xì)胞組分和分子功能，大部分尿液差異蛋白均參與了上述，如表4、表5和表6顯示了差異蛋白顯著富集（P<0.05....

圖3LBUC尿液差異蛋白的KEGG通路富集分析

-16-圖3LBUC尿液差異蛋白的KEGG通路富集分析

圖4尿蛋白A1AT診斷膀胱癌的SROC曲線

-48-PAI1的Spearman相關(guān)系數(shù)是0.900，P=0.037，存在閾值效應(yīng)，不宜直接進(jìn)行合并。ANG的Spearman相關(guān)系數(shù)是0.657，P=0.156，不存在閾值效應(yīng)，可直接進(jìn)行合并。APOA1的Spearman相關(guān)系數(shù)是0.300，P=0.624不存在閾值效應(yīng)，可....

本文編號(hào)：3917087