背景:食管癌是中國發(fā)病率最高的5大腫瘤以及腫瘤相關(guān)死亡原因之一,在中國食管癌的主要病理類型是食管鱗狀細(xì)胞癌。環(huán)狀RNA是一類由前體mRNA通過反向剪切形成的,近年來發(fā)現(xiàn)的在真核生物中廣泛表達(dá)的特殊的環(huán)形內(nèi)源性RNA。與經(jīng)典的線性的RNA不同,環(huán)狀RNA形成不具有典型的5’帽子和3’多聚腺苷酸尾巴的頭尾相接的共價閉環(huán)結(jié)構(gòu),因此不易受RNA酶消化,比線性RNA更為穩(wěn)定。得益于高通量測序技術(shù)的發(fā)展,環(huán)狀RNA陸續(xù)在各物種、細(xì)胞及臨床樣本中被鑒定出來。然而,在食管鱗狀細(xì)胞癌中,尚缺乏基于高通量測序的環(huán)狀RNA表達(dá)譜分析;同時關(guān)于環(huán)狀RNA在食管鱗狀細(xì)胞癌中調(diào)控功能的研究依然缺乏充分認(rèn)識,有待進(jìn)一步的深入研究。因此,本研究期望通過高通量測序的方法探索食管鱗狀細(xì)胞癌中環(huán)狀RNA的表達(dá)譜并對其腫瘤生物學(xué)功能進(jìn)行初步探討。方法:收集食管鱗狀細(xì)胞癌患者癌及癌旁組織樣本提取總RNA。通過去除rRNA、線性RNA的方法構(gòu)建環(huán)狀RNA測序cDNA文庫。采用RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序方法檢測環(huán)狀RNA的表達(dá)。測序結(jié)果使用CIRI及BAW預(yù)測潛在環(huán)狀RNA。差異表達(dá)環(huán)狀RNA進(jìn)行聚類、GO和KEGG分析。CircF...

【文章頁數(shù)】：144 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
    1、食管癌的流行病學(xué)及危害
    2、circRNA生物學(xué)過程及其功能
第二章 食管鱗癌組織circRNA測序及分析
    1 引言
    2 材料和方法
    3 結(jié)果
    4 討論
    5 小結(jié)
第三章 circFNDC3B在食管鱗癌組織中的表達(dá)
    1 引言
    2 材料和方法
    3 結(jié)果
    4 討論
    5 小結(jié)
第四章 circFNDC3B對食管鱗癌細(xì)胞生物學(xué)功能的影響
    1 引言
    2 材料和方法
    3 結(jié)果
    4 討論
    5 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間成果
附錄
    參考文獻(xiàn)
英文縮略詞表
致謝



本文編號：3850470