編碼RNA CRIP1在急性髓系白血病中的表達(dá)水平及其臨床意義研究
發(fā)布時(shí)間:2023-09-17 16:58
目的CRIP1在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中扮演著重要作用,其在實(shí)體瘤中的研究越來越多,但是在急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)中卻鮮有報(bào)道。本研究的目的是評(píng)估CRIP1在AML中的表達(dá)水平、臨床意義以及可能參與的調(diào)控機(jī)制。方法采用實(shí)時(shí)定量PCR(Real-time quantitative PCR,RQ-PCR)檢測(cè)138例AML患者和38例正常對(duì)照中CRIP1表達(dá)的水平。收集患者臨床數(shù)據(jù),評(píng)估其臨床意義。通過甲基化特異性PCR(Methylation‐specific PCR,MSP)和亞硫酸氫鹽測(cè)序PCR(bisulfite sequencing PCR,BSP)檢測(cè)AML中CRIP1基因啟動(dòng)子的甲基化態(tài)勢(shì)。評(píng)估CRIP1在AML中的表達(dá)水平與其甲基化的相關(guān)性。收集公共數(shù)據(jù)庫資料,進(jìn)一步分析來自癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因表達(dá)綜合庫(Gene Expression Omnibus,GEO)的五個(gè)公開可用的AML數(shù)據(jù)集,進(jìn)一步驗(yàn)證我們的結(jié)果。通過網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫預(yù)測(cè)可能調(diào)控CRIP1在AML中表達(dá)水平的micro...
【文章頁數(shù)】:73 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.1 急性髓系白血病
1.2 編碼RNA
1.3 CRIP1 基因
第二章 研究目的、設(shè)計(jì)方案、研究意義
2.1 研究目的
2.2 設(shè)計(jì)方案
2.3 研究意義
第三章 材料和方法
3.1 材料
3.1.1 研究對(duì)象
3.1.2 所需試劑
3.1.3 所用儀器
3.1.4 引物
3.2 研究方法
3.2.1 BMMNCs提取
3.2.2 總RNA提取
3.2.3 DNA提取
3.2.4 逆轉(zhuǎn)錄
3.2.5 亞硫酸氫鹽修飾基因組DNA
3.2.6 RQ-PCR檢測(cè)CRIP1、miR-299-5P、miR-3173-5P的表達(dá)水平
3.2.7 RQ-MSP檢測(cè)CRIP1 甲基化水平
3.2.8 BSP檢測(cè)CRIP1 甲基化密度
3.2.9 純化回收PCR產(chǎn)物
3.2.10 構(gòu)建重組載體
3.2.11 轉(zhuǎn)化重組質(zhì)粒
3.2.12 質(zhì)粒提取、鑒定及測(cè)序
3.2.13 建立陽性模板
3.2.14 細(xì)胞遺傳學(xué)檢查
3.2.15 基因突變檢測(cè)
3.2.16 公共數(shù)據(jù)庫分析
3.2.17 統(tǒng)計(jì)分析
第四章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.1 CRIP1在AML中的表達(dá)水平及其臨床意義
4.1.1 CRIP1在AML中表達(dá)水平上調(diào)
4.1.2 CRIP1 表達(dá)水平與AML患者臨床參數(shù)的相關(guān)性
4.1.3 CRIP1 表達(dá)水平與AML患者預(yù)后的相關(guān)性
4.1.4 CRIP1 表達(dá)水平對(duì)AML患者化療反應(yīng)的影響
4.2 CRIP1在AML中的甲基化態(tài)勢(shì)及其與表達(dá)水平的相關(guān)性
4.3 microRNA在 AML中的臨床意義及其與CRIP1 的相關(guān)性
4.3.1 microRNA篩選
4.3.2 miR-299-5p和 miR-3173-5p在 AML中的臨床意義
4.3.3 miR-299-5p和 miR-3173-5p在 AML中表達(dá)水平及與CRIP1 相關(guān)性
第五章 討論
第六章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
碩士期間發(fā)表論文、獲獎(jiǎng)情況及科研成果
本文編號(hào):3847835
【文章頁數(shù)】:73 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.1 急性髓系白血病
1.2 編碼RNA
1.3 CRIP1 基因
第二章 研究目的、設(shè)計(jì)方案、研究意義
2.1 研究目的
2.2 設(shè)計(jì)方案
2.3 研究意義
第三章 材料和方法
3.1 材料
3.1.1 研究對(duì)象
3.1.2 所需試劑
3.1.3 所用儀器
3.1.4 引物
3.2 研究方法
3.2.1 BMMNCs提取
3.2.2 總RNA提取
3.2.3 DNA提取
3.2.4 逆轉(zhuǎn)錄
3.2.5 亞硫酸氫鹽修飾基因組DNA
3.2.6 RQ-PCR檢測(cè)CRIP1、miR-299-5P、miR-3173-5P的表達(dá)水平
3.2.7 RQ-MSP檢測(cè)CRIP1 甲基化水平
3.2.8 BSP檢測(cè)CRIP1 甲基化密度
3.2.9 純化回收PCR產(chǎn)物
3.2.10 構(gòu)建重組載體
3.2.11 轉(zhuǎn)化重組質(zhì)粒
3.2.12 質(zhì)粒提取、鑒定及測(cè)序
3.2.13 建立陽性模板
3.2.14 細(xì)胞遺傳學(xué)檢查
3.2.15 基因突變檢測(cè)
3.2.16 公共數(shù)據(jù)庫分析
3.2.17 統(tǒng)計(jì)分析
第四章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.1 CRIP1在AML中的表達(dá)水平及其臨床意義
4.1.1 CRIP1在AML中表達(dá)水平上調(diào)
4.1.2 CRIP1 表達(dá)水平與AML患者臨床參數(shù)的相關(guān)性
4.1.3 CRIP1 表達(dá)水平與AML患者預(yù)后的相關(guān)性
4.1.4 CRIP1 表達(dá)水平對(duì)AML患者化療反應(yīng)的影響
4.2 CRIP1在AML中的甲基化態(tài)勢(shì)及其與表達(dá)水平的相關(guān)性
4.3 microRNA在 AML中的臨床意義及其與CRIP1 的相關(guān)性
4.3.1 microRNA篩選
4.3.2 miR-299-5p和 miR-3173-5p在 AML中的臨床意義
4.3.3 miR-299-5p和 miR-3173-5p在 AML中表達(dá)水平及與CRIP1 相關(guān)性
第五章 討論
第六章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
碩士期間發(fā)表論文、獲獎(jiǎng)情況及科研成果
本文編號(hào):3847835
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