ILs基因SNPs與胃癌易感性關(guān)聯(lián)及生物信息學(xué)功能研究
發(fā)布時(shí)間:2023-03-04 17:47
胃癌是發(fā)病率及致死率極高的一種惡性腫瘤,影響全世界人群的健康。中國(guó)作為全球胃癌高發(fā)區(qū)之一,每年因胃癌所致的健康及經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)極大。多數(shù)胃癌早期不易發(fā)現(xiàn),嚴(yán)重影響胃癌病人的治療及預(yù)后,給病人帶來(lái)極大的生理及精神痛苦。因此,研究胃癌的易感性是十分必要的。單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是一類重要的突變,很多基因的SNPs與胃癌易感性相關(guān),可以作為胃癌易感性相關(guān)的生物標(biāo)志物。炎癥影響胃癌的發(fā)生、發(fā)展,而白細(xì)胞介素(白介素),是一類炎癥相關(guān)的重要細(xì)胞因子。研究表明白介素(Interleukin,IL)基因的SNPs對(duì)胃癌的易感性也會(huì)產(chǎn)生影響。雖然已經(jīng)發(fā)現(xiàn)多種ILs基因的SNPs與胃癌易感性相關(guān),但現(xiàn)有的關(guān)于ILs基因SNPs與胃癌易感性的研究結(jié)果間仍存在爭(zhēng)議。目的通過(guò)meta分析的方法找出與胃癌易感性有關(guān)的ILs基因單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn),并對(duì)篩選出的SNPs在河南省漢族人群樣本中進(jìn)行實(shí)驗(yàn),驗(yàn)證其與胃癌易感性的關(guān)系,最后通過(guò)生物信息學(xué)等方法初步探索與胃癌易感性相關(guān)位點(diǎn)突變對(duì)生物學(xué)功能可能產(chǎn)生的影響。方法(1)基于meta分析的方法定量評(píng)價(jià)ILs基因...
【文章頁(yè)數(shù)】:90 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 前言
2 材料與方法
2.1 ILs基因SNPs與胃癌易感性關(guān)聯(lián)研究的meta分析
2.1.1 文獻(xiàn)檢索與收集
2.1.2 文獻(xiàn)納入
2.1.3 文獻(xiàn)資料分析、質(zhì)量評(píng)價(jià)
2.1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2.2 生物學(xué)實(shí)驗(yàn)
2.2.1 實(shí)驗(yàn)儀器
2.2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.2.3 溶液的配制
2.2.4 研究方法
2.2.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2.3 基因分型實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證后胃癌易感性相關(guān)SNPs的生物學(xué)功能初探
3 結(jié)果
3.1 ILs基因SNPs與胃癌易感性關(guān)聯(lián)的meta分析
3.1.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果
3.1.2 ILs基因SNPs及相應(yīng)文獻(xiàn)的基本信息
3.1.3 Meta分析結(jié)果
3.1.4 敏感性分析
3.1.5 發(fā)表偏倚分析
3.2 基因分型實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
3.2.1 研究對(duì)象一般特征
3.2.2 SNPs的分型結(jié)果
3.2.3 Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)
3.2.4 兩個(gè)SNPs和胃癌遺傳易感性的關(guān)系
3.2.5 兩個(gè)SNPs與胃癌遺傳易感性的分層分析
3.2.6 假陽(yáng)性報(bào)告率分析及人群歸因危險(xiǎn)度百分比評(píng)估
3.2.7 基因環(huán)境交互作用
3.3 rs763780的生物學(xué)功能初探
3.3.1 rs763780三維染色質(zhì)環(huán)作用關(guān)系
3.3.2 rs763780所致蛋白質(zhì)功能影響預(yù)測(cè)
4 討論
4.1 本研究概述
4.2 ILs基因單核苷酸多態(tài)性與胃癌的關(guān)系
4.3 基因-環(huán)境交互作用對(duì)胃癌的影響
4.4 基于生物信息學(xué)的rs763780生物學(xué)功能初探
4.5 本研究?jī)?yōu)點(diǎn)及局限性
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 白細(xì)胞介素:胃癌相關(guān)信號(hào)通路的重要調(diào)控因子
1 白細(xì)胞介素簡(jiǎn)介
2 白細(xì)胞介素與常見(jiàn)惡性腫瘤的關(guān)系
3 常見(jiàn)胃癌相關(guān)信號(hào)通路
4 白細(xì)胞介素參與影響胃癌發(fā)生、發(fā)展等過(guò)程的信號(hào)通路
參考文獻(xiàn)
個(gè)人簡(jiǎn)歷及學(xué)術(shù)論文發(fā)表情況
致謝
本文編號(hào):3754718
【文章頁(yè)數(shù)】:90 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 前言
2 材料與方法
2.1 ILs基因SNPs與胃癌易感性關(guān)聯(lián)研究的meta分析
2.1.1 文獻(xiàn)檢索與收集
2.1.2 文獻(xiàn)納入
2.1.3 文獻(xiàn)資料分析、質(zhì)量評(píng)價(jià)
2.1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2.2 生物學(xué)實(shí)驗(yàn)
2.2.1 實(shí)驗(yàn)儀器
2.2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.2.3 溶液的配制
2.2.4 研究方法
2.2.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2.3 基因分型實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證后胃癌易感性相關(guān)SNPs的生物學(xué)功能初探
3 結(jié)果
3.1 ILs基因SNPs與胃癌易感性關(guān)聯(lián)的meta分析
3.1.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果
3.1.2 ILs基因SNPs及相應(yīng)文獻(xiàn)的基本信息
3.1.3 Meta分析結(jié)果
3.1.4 敏感性分析
3.1.5 發(fā)表偏倚分析
3.2 基因分型實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
3.2.1 研究對(duì)象一般特征
3.2.2 SNPs的分型結(jié)果
3.2.3 Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)
3.2.4 兩個(gè)SNPs和胃癌遺傳易感性的關(guān)系
3.2.5 兩個(gè)SNPs與胃癌遺傳易感性的分層分析
3.2.6 假陽(yáng)性報(bào)告率分析及人群歸因危險(xiǎn)度百分比評(píng)估
3.2.7 基因環(huán)境交互作用
3.3 rs763780的生物學(xué)功能初探
3.3.1 rs763780三維染色質(zhì)環(huán)作用關(guān)系
3.3.2 rs763780所致蛋白質(zhì)功能影響預(yù)測(cè)
4 討論
4.1 本研究概述
4.2 ILs基因單核苷酸多態(tài)性與胃癌的關(guān)系
4.3 基因-環(huán)境交互作用對(duì)胃癌的影響
4.4 基于生物信息學(xué)的rs763780生物學(xué)功能初探
4.5 本研究?jī)?yōu)點(diǎn)及局限性
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 白細(xì)胞介素:胃癌相關(guān)信號(hào)通路的重要調(diào)控因子
1 白細(xì)胞介素簡(jiǎn)介
2 白細(xì)胞介素與常見(jiàn)惡性腫瘤的關(guān)系
3 常見(jiàn)胃癌相關(guān)信號(hào)通路
4 白細(xì)胞介素參與影響胃癌發(fā)生、發(fā)展等過(guò)程的信號(hào)通路
參考文獻(xiàn)
個(gè)人簡(jiǎn)歷及學(xué)術(shù)論文發(fā)表情況
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本文編號(hào):3754718
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