ILs基因SNPs與胃癌易感性關(guān)聯(lián)及生物信息學功能研究
發(fā)布時間:2023-03-04 17:47
胃癌是發(fā)病率及致死率極高的一種惡性腫瘤,影響全世界人群的健康。中國作為全球胃癌高發(fā)區(qū)之一,每年因胃癌所致的健康及經(jīng)濟負擔極大。多數(shù)胃癌早期不易發(fā)現(xiàn),嚴重影響胃癌病人的治療及預后,給病人帶來極大的生理及精神痛苦。因此,研究胃癌的易感性是十分必要的。單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是一類重要的突變,很多基因的SNPs與胃癌易感性相關(guān),可以作為胃癌易感性相關(guān)的生物標志物。炎癥影響胃癌的發(fā)生、發(fā)展,而白細胞介素(白介素),是一類炎癥相關(guān)的重要細胞因子。研究表明白介素(Interleukin,IL)基因的SNPs對胃癌的易感性也會產(chǎn)生影響。雖然已經(jīng)發(fā)現(xiàn)多種ILs基因的SNPs與胃癌易感性相關(guān),但現(xiàn)有的關(guān)于ILs基因SNPs與胃癌易感性的研究結(jié)果間仍存在爭議。目的通過meta分析的方法找出與胃癌易感性有關(guān)的ILs基因單核苷酸多態(tài)性位點,并對篩選出的SNPs在河南省漢族人群樣本中進行實驗,驗證其與胃癌易感性的關(guān)系,最后通過生物信息學等方法初步探索與胃癌易感性相關(guān)位點突變對生物學功能可能產(chǎn)生的影響。方法(1)基于meta分析的方法定量評價ILs基因...
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 前言
2 材料與方法
2.1 ILs基因SNPs與胃癌易感性關(guān)聯(lián)研究的meta分析
2.1.1 文獻檢索與收集
2.1.2 文獻納入
2.1.3 文獻資料分析、質(zhì)量評價
2.1.4 統(tǒng)計學分析
2.2 生物學實驗
2.2.1 實驗儀器
2.2.2 實驗試劑
2.2.3 溶液的配制
2.2.4 研究方法
2.2.5 統(tǒng)計學分析
2.3 基因分型實驗驗證后胃癌易感性相關(guān)SNPs的生物學功能初探
3 結(jié)果
3.1 ILs基因SNPs與胃癌易感性關(guān)聯(lián)的meta分析
3.1.1 文獻檢索結(jié)果
3.1.2 ILs基因SNPs及相應(yīng)文獻的基本信息
3.1.3 Meta分析結(jié)果
3.1.4 敏感性分析
3.1.5 發(fā)表偏倚分析
3.2 基因分型實驗結(jié)果分析
3.2.1 研究對象一般特征
3.2.2 SNPs的分型結(jié)果
3.2.3 Hardy-Weinberg平衡檢驗
3.2.4 兩個SNPs和胃癌遺傳易感性的關(guān)系
3.2.5 兩個SNPs與胃癌遺傳易感性的分層分析
3.2.6 假陽性報告率分析及人群歸因危險度百分比評估
3.2.7 基因環(huán)境交互作用
3.3 rs763780的生物學功能初探
3.3.1 rs763780三維染色質(zhì)環(huán)作用關(guān)系
3.3.2 rs763780所致蛋白質(zhì)功能影響預測
4 討論
4.1 本研究概述
4.2 ILs基因單核苷酸多態(tài)性與胃癌的關(guān)系
4.3 基因-環(huán)境交互作用對胃癌的影響
4.4 基于生物信息學的rs763780生物學功能初探
4.5 本研究優(yōu)點及局限性
5 結(jié)論
參考文獻
綜述 白細胞介素:胃癌相關(guān)信號通路的重要調(diào)控因子
1 白細胞介素簡介
2 白細胞介素與常見惡性腫瘤的關(guān)系
3 常見胃癌相關(guān)信號通路
4 白細胞介素參與影響胃癌發(fā)生、發(fā)展等過程的信號通路
參考文獻
個人簡歷及學術(shù)論文發(fā)表情況
致謝
本文編號:3754718
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學位級別】:碩士
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摘要
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英文縮略詞表
1 前言
2 材料與方法
2.1 ILs基因SNPs與胃癌易感性關(guān)聯(lián)研究的meta分析
2.1.1 文獻檢索與收集
2.1.2 文獻納入
2.1.3 文獻資料分析、質(zhì)量評價
2.1.4 統(tǒng)計學分析
2.2 生物學實驗
2.2.1 實驗儀器
2.2.2 實驗試劑
2.2.3 溶液的配制
2.2.4 研究方法
2.2.5 統(tǒng)計學分析
2.3 基因分型實驗驗證后胃癌易感性相關(guān)SNPs的生物學功能初探
3 結(jié)果
3.1 ILs基因SNPs與胃癌易感性關(guān)聯(lián)的meta分析
3.1.1 文獻檢索結(jié)果
3.1.2 ILs基因SNPs及相應(yīng)文獻的基本信息
3.1.3 Meta分析結(jié)果
3.1.4 敏感性分析
3.1.5 發(fā)表偏倚分析
3.2 基因分型實驗結(jié)果分析
3.2.1 研究對象一般特征
3.2.2 SNPs的分型結(jié)果
3.2.3 Hardy-Weinberg平衡檢驗
3.2.4 兩個SNPs和胃癌遺傳易感性的關(guān)系
3.2.5 兩個SNPs與胃癌遺傳易感性的分層分析
3.2.6 假陽性報告率分析及人群歸因危險度百分比評估
3.2.7 基因環(huán)境交互作用
3.3 rs763780的生物學功能初探
3.3.1 rs763780三維染色質(zhì)環(huán)作用關(guān)系
3.3.2 rs763780所致蛋白質(zhì)功能影響預測
4 討論
4.1 本研究概述
4.2 ILs基因單核苷酸多態(tài)性與胃癌的關(guān)系
4.3 基因-環(huán)境交互作用對胃癌的影響
4.4 基于生物信息學的rs763780生物學功能初探
4.5 本研究優(yōu)點及局限性
5 結(jié)論
參考文獻
綜述 白細胞介素:胃癌相關(guān)信號通路的重要調(diào)控因子
1 白細胞介素簡介
2 白細胞介素與常見惡性腫瘤的關(guān)系
3 常見胃癌相關(guān)信號通路
4 白細胞介素參與影響胃癌發(fā)生、發(fā)展等過程的信號通路
參考文獻
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本文編號:3754718
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