背景介紹胃癌是我國(guó)最常見(jiàn)的惡性腫瘤,起病隱匿,晚期胃癌預(yù)后極差。早期診斷是改善其預(yù)后的關(guān)鍵。隨著次世代測(cè)序技術(shù)和質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展,組學(xué)關(guān)聯(lián)分析越來(lái)越受到重視,許多研究利用代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合分析,探究腫瘤的發(fā)病機(jī)制。如同血液尿液一樣,唾液可以用來(lái)監(jiān)測(cè)人體的生理病理變化,且在收集,存儲(chǔ),運(yùn)輸和大量采樣方面具有巨大優(yōu)勢(shì)。方法收集157名胃癌患者和30良性胃病患者的唾液進(jìn)行超高像色譜質(zhì)譜分析,再通過(guò)學(xué)生t檢驗(yàn)(p<0.05)和OPLS-DA(VIP>1)分析尋找診斷相關(guān)標(biāo)志物,之后再對(duì)患者進(jìn)行隨訪并對(duì)隨訪數(shù)據(jù)進(jìn)行COX風(fēng)險(xiǎn)回歸分析篩選預(yù)后相關(guān)代謝物。同時(shí)收集了100名患者的胃癌組織樣本和30例癌旁組織樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序,以q(多重假設(shè)檢驗(yàn)校正的p值)小于0.05,兩組間基因表達(dá)差異倍數(shù)(foldchange)的絕對(duì)值大于2作為標(biāo)準(zhǔn)篩選顯著性DEGs。最后,對(duì)兩個(gè)組學(xué)的數(shù)據(jù)進(jìn)行KEGG pathway富集分析,以KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)為平臺(tái)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果在唾液UHPLC-MS分析中得到了58個(gè)顯著差異的代謝物�；�8個(gè)差異代謝物的診斷模型提供了最佳的診斷靈敏度和特異度,經(jīng)留一法交叉驗(yàn)...

【文章頁(yè)數(shù)】：60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
英文縮略詞表
中文摘要
英文摘要
引言
第一章 唾液組學(xué)分析
    1.1 材料與方法
        1.1.1 患者招募和臨床特征
        1.1.2 樣本收集
        1.1.3 UHPLC-MS實(shí)驗(yàn)流程
    1.2 代謝組學(xué)結(jié)果
        1.2.1 色譜質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)處理
        1.2.2 唾液差異代謝物的篩選和組間分布情況
        1.2.3 診斷函數(shù)模型
        1.2.4 代謝物的預(yù)后相關(guān)性分析
        1.2.5 KEGG pathway分析
    1.3 討論
        1.3.1 差異代謝物反映出差異代謝通路變化
        1.3.2 新穎的差異代謝物
        1.3.3 唾液代謝組的診斷效力和預(yù)后評(píng)估
第二章 轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 標(biāo)本收集
        2.1.2 測(cè)序流程
    2.2 測(cè)序結(jié)果
        2.2.1 測(cè)序結(jié)果的質(zhì)控檢查和比對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)
        2.2.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的定量分析和差異基因分析
    2.3 討論
第三章 組學(xué)關(guān)聯(lián)分析
    3.1 關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
    3.2 討論
第四章 結(jié)語(yǔ)
    4.1 結(jié)論
    4.2 展望
附錄 個(gè)人簡(jiǎn)歷
致謝
參考文獻(xiàn)
    引言參考文獻(xiàn)
    正文參考文獻(xiàn)
基于次世代測(cè)序和質(zhì)譜分析的多組學(xué)關(guān)聯(lián)分析對(duì)胃癌研究的啟示
    參考文獻(xiàn)



本文編號(hào)：3740535