生物信息學(xué)分析AURKB和KIF18B的協(xié)同表達(dá)在腎透明細(xì)胞癌發(fā)展中的重要意義
發(fā)布時間:2022-10-09 17:56
目的:泌尿系統(tǒng)腫瘤的發(fā)病現(xiàn)狀一直是研究者們的關(guān)注重點,其最常見的腫瘤類型之一是腎細(xì)胞癌(Renal Cell Carcinoma,RCC),腎細(xì)胞癌的最常見亞型則為腎透明細(xì)胞癌亞型(clear cell Renal Cell Carcinoma,ccRCC),ccRCC的高轉(zhuǎn)移率和高死亡率一直影響著該類癌癥的治療。腎透明細(xì)胞癌發(fā)生和發(fā)展的分子生物學(xué)機(jī)制尚未完全闡明,研究腎透明細(xì)胞癌的分子機(jī)制具有重要意義。如今,生物信息學(xué)方法已經(jīng)在癌癥生物學(xué)領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用,被用來協(xié)助尋找癌癥生物標(biāo)記物和治療靶標(biāo)。本研究我們利用開放的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫尋找與腫瘤發(fā)生進(jìn)展相關(guān)的潛在治療靶點,可能為ccRCC的臨床治療做出貢獻(xiàn)。研究方法:我們首先從人類腫瘤基因組(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫中獲取腎透明細(xì)胞癌的表達(dá)譜,共包含539例ccRCC樣本以及72例癌旁組織樣本。然后,我們利用“edgeR”包獲取在ccRCC患者與癌旁組織,III/IV期ccRCC患者與I/II期ccRCC患者中皆差異表達(dá)的基因,篩選出隨著ccRCC病程進(jìn)展上調(diào)的基因,最終選擇分析上調(diào)基因AURKB、...
【文章頁數(shù)】:48 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略語
1 前言
2 材料與方法
2.1 收集患者數(shù)據(jù)
2.2 篩選差異表達(dá)基因
2.3 相關(guān)性分析
2.4 GEO數(shù)據(jù)集驗證
2.5 臨床病理參數(shù)分析
2.6 生存分析
2.7 通路富集分析
2.8 統(tǒng)計學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 AURKB和 KIF18B隨ccRCC進(jìn)展表達(dá)水平上調(diào)且具有密切的相關(guān)性
3.2 GEO驗證AURKB與KIF18B隨ccRCC進(jìn)展表達(dá)水平上調(diào)且具有相關(guān)性
3.3 AURKB,KIF18B表達(dá)與ccRCC臨床病理特征的關(guān)系
3.4 AURKB與KIF18B協(xié)同高表達(dá)與ccRCC不良預(yù)后相關(guān)
3.5 KEGG通路富集分析
4 討論
5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評價
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個人簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Aurora激酶抑制劑MK-0457治療多種惡性血液病的研究進(jìn)展[J]. 梁藝瓊,陳寶安,陳亞利. 中國實驗血液學(xué)雜志. 2009(03)
本文編號:3689095
【文章頁數(shù)】:48 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略語
1 前言
2 材料與方法
2.1 收集患者數(shù)據(jù)
2.2 篩選差異表達(dá)基因
2.3 相關(guān)性分析
2.4 GEO數(shù)據(jù)集驗證
2.5 臨床病理參數(shù)分析
2.6 生存分析
2.7 通路富集分析
2.8 統(tǒng)計學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 AURKB和 KIF18B隨ccRCC進(jìn)展表達(dá)水平上調(diào)且具有密切的相關(guān)性
3.2 GEO驗證AURKB與KIF18B隨ccRCC進(jìn)展表達(dá)水平上調(diào)且具有相關(guān)性
3.3 AURKB,KIF18B表達(dá)與ccRCC臨床病理特征的關(guān)系
3.4 AURKB與KIF18B協(xié)同高表達(dá)與ccRCC不良預(yù)后相關(guān)
3.5 KEGG通路富集分析
4 討論
5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評價
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個人簡歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Aurora激酶抑制劑MK-0457治療多種惡性血液病的研究進(jìn)展[J]. 梁藝瓊,陳寶安,陳亞利. 中國實驗血液學(xué)雜志. 2009(03)
本文編號:3689095
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