Micro RNA（mi RNA）是一類長度約為22個核苷酸的小分子非編碼RNA。研究表明,mi RNA與細胞生長、分化、增殖和凋亡等過程密切相關。并且,mi RNA能夠在轉錄后水平上調控基因表達,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要作用。目前,癌癥mi RNA-m RNA調控機制的研究主要通過生物學實驗以及生物信息學方法預測。但是,相關研究主要以單個癌癥為主,基于泛癌分析的mi RNA-m RNA調控機制研究尚不多見。本課題以乳腺癌、腎透明細胞癌、肺腺癌等十種常見癌癥為切入點,從mi RNA生物標志物及其靶基因的調控關系角度,探究不同癌癥中mi RNAm RNA作用模式與癌癥發(fā)病機制的關系。方法上,通過癌癥mi RNA/m RNA表達譜數(shù)據(jù)收集、mi RNA標志物的生物信息學識別、靶基因預測、信號通路富集分析等,重點研究不同癌癥中的mi RNA生物標志物及mi RNA-m RNA調控模式。首先,篩選每種癌癥中差異表達的mi RNA/m RNA,并利用課題組已有的預測模型Mi RNA-BD,分別預測十種癌癥的mi RNA生物標志物。通過模型得到的癌癥相關mi RNA-m RNA調控網(wǎng)絡,尋找m... 

【文章來源】：蘇州大學江蘇省211工程院校

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【學位級別】：碩士

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候選miRNA生物標志物文獻報道比例

圖 3.2 未報道的 miRNA 生物標志物的 ROC 曲線。其中，每一個小圖表示，候選 miRNA 生物標志物在不同癌癥中的 ROC 曲線，并以不同的顏色區(qū)分（紅色、綠色、黑色）不同數(shù)據(jù)集的情況。藍色線表示 AUC 值為 0.5。本節(jié)通過文獻驗證、ROC 曲線兩方面驗證了候選 miRNA 生物標志物的可靠性。我們發(fā)現(xiàn)，由 miRNA/mRNA 兩類數(shù)據(jù)共同預測的 miRNA 生物標志物共 75 個，其中61 個 miRNA 生物標志物被已有研究報道，在相關癌癥中可作為潛在的 miRNA 生物標志物。在這 75 個癌癥候選 miRNA 生物標志物中，文獻未報道的 miRNA 生物標志物的 AUC > 0.7 的比例為 85.7%，文獻已報道的 miRNA 生物標志物的 AUC > 0.7 的比例為85.2%。這兩方面表明，在利用miRNA/mRNA數(shù)據(jù)同時預測候選癌癥的miRNA生物標志物時，模型具有更高的可信度。

【參考文獻】：
期刊論文
[1]腫瘤基因組圖譜泛癌分析計劃[J]. 張坤,王紅.  中國肺癌雜志. 2015(04)
[2]MicroRNA-mRNA functional pairs for cisplatin resistance in ovarian cancer cells[J]. Mei Liu,Xin Zhang,Chen-Fei Hu,Qing Xu,Hong-Xia Zhu,Ning-Zhi Xu.  Chinese Journal of Cancer. 2014(06)

碩士論文
[1]MicroRNA生物標志物識別的模型構建[D]. 林宇鑫.蘇州大學 2016



本文編號：3614395