Micro RNA（mi RNA）是一類長度約為22個(gè)核苷酸的小分子非編碼RNA。研究表明,mi RNA與細(xì)胞生長、分化、增殖和凋亡等過程密切相關(guān)。并且,mi RNA能夠在轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào)控基因表達(dá),在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要作用。目前,癌癥mi RNA-m RNA調(diào)控機(jī)制的研究主要通過生物學(xué)實(shí)驗(yàn)以及生物信息學(xué)方法預(yù)測。但是,相關(guān)研究主要以單個(gè)癌癥為主,基于泛癌分析的mi RNA-m RNA調(diào)控機(jī)制研究尚不多見。本課題以乳腺癌、腎透明細(xì)胞癌、肺腺癌等十種常見癌癥為切入點(diǎn),從mi RNA生物標(biāo)志物及其靶基因的調(diào)控關(guān)系角度,探究不同癌癥中mi RNAm RNA作用模式與癌癥發(fā)病機(jī)制的關(guān)系。方法上,通過癌癥mi RNA/m RNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)收集、mi RNA標(biāo)志物的生物信息學(xué)識別、靶基因預(yù)測、信號通路富集分析等,重點(diǎn)研究不同癌癥中的mi RNA生物標(biāo)志物及mi RNA-m RNA調(diào)控模式。首先,篩選每種癌癥中差異表達(dá)的mi RNA/m RNA,并利用課題組已有的預(yù)測模型Mi RNA-BD,分別預(yù)測十種癌癥的mi RNA生物標(biāo)志物。通過模型得到的癌癥相關(guān)mi RNA-m RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),尋找m... 

【文章來源】：蘇州大學(xué)江蘇省211工程院校

【文章頁數(shù)】：79 頁

【學(xué)位級別】：碩士

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候選miRNA生物標(biāo)志物文獻(xiàn)報(bào)道比例

圖 3.2 未報(bào)道的 miRNA 生物標(biāo)志物的 ROC 曲線。其中，每一個(gè)小圖表示，候選 miRNA 生物標(biāo)志物在不同癌癥中的 ROC 曲線，并以不同的顏色區(qū)分（紅色、綠色、黑色）不同數(shù)據(jù)集的情況。藍(lán)色線表示 AUC 值為 0.5。本節(jié)通過文獻(xiàn)驗(yàn)證、ROC 曲線兩方面驗(yàn)證了候選 miRNA 生物標(biāo)志物的可靠性。我們發(fā)現(xiàn)，由 miRNA/mRNA 兩類數(shù)據(jù)共同預(yù)測的 miRNA 生物標(biāo)志物共 75 個(gè)，其中61 個(gè) miRNA 生物標(biāo)志物被已有研究報(bào)道，在相關(guān)癌癥中可作為潛在的 miRNA 生物標(biāo)志物。在這 75 個(gè)癌癥候選 miRNA 生物標(biāo)志物中，文獻(xiàn)未報(bào)道的 miRNA 生物標(biāo)志物的 AUC > 0.7 的比例為 85.7%，文獻(xiàn)已報(bào)道的 miRNA 生物標(biāo)志物的 AUC > 0.7 的比例為85.2%。這兩方面表明，在利用miRNA/mRNA數(shù)據(jù)同時(shí)預(yù)測候選癌癥的miRNA生物標(biāo)志物時(shí)，模型具有更高的可信度。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]腫瘤基因組圖譜泛癌分析計(jì)劃[J]. 張坤,王紅.  中國肺癌雜志. 2015(04)
[2]MicroRNA-mRNA functional pairs for cisplatin resistance in ovarian cancer cells[J]. Mei Liu,Xin Zhang,Chen-Fei Hu,Qing Xu,Hong-Xia Zhu,Ning-Zhi Xu.  Chinese Journal of Cancer. 2014(06)

碩士論文
[1]MicroRNA生物標(biāo)志物識別的模型構(gòu)建[D]. 林宇鑫.蘇州大學(xué) 2016



本文編號：3614395