lncRNA-TUSC7標簽SNPs與胃癌易感性關(guān)聯(lián)研究及初步功能驗證
發(fā)布時間:2022-01-07 12:07
胃癌(Gastric Cancer,GC)在男性和女性的發(fā)病率分別位于全球惡性腫瘤發(fā)病順位的第四位和第五位,雖然近幾年其發(fā)病率和死亡率均有下降趨勢,但在韓國、日本、中國,胃癌的發(fā)病率仍然很高,其發(fā)病率和死亡率仍位于中國消化道惡性腫瘤的首位。越來越多的研究表明,長鏈非編碼RNA(lncRNAs)最近已被確認為在胃癌的發(fā)生和發(fā)展中發(fā)揮重要作用,有望成為胃癌早期診斷和預(yù)后的生物標志物,其中,腫瘤抑制候選基因-7(TUSC7)在癌癥包括結(jié)直腸癌、急性髓系白血病、腦膠質(zhì)瘤、胃癌等腫瘤的的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要作用。然而TUSC7的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)與胃癌易感性的關(guān)系及其TUSC7發(fā)揮功能的機制尚不清楚。目的本研究的目的是探索lncRNA-TUSC7的3個SNPs(rs12494960,rs1518338,rs2867837)與胃癌遺傳易感性的相關(guān)性及l(fā)ncRNA-TUSC7遺傳變異的初步功能驗證。方法(1)結(jié)合多種數(shù)據(jù)庫,查閱國內(nèi)外胃癌相關(guān)lncRNAs文獻,利用NCBI dbSNP數(shù)據(jù)庫,然后通過生物信息學(xué)方法篩選出胃癌相關(guān)的差異表達的lncRNAs并利用haploview篩選其標簽SN...
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1雙熒光素酶報告基因質(zhì)粒結(jié)構(gòu)圖
結(jié)果3.2 基因分型3.2.1 凝膠電泳結(jié)果TUSC7 rs12494960 位點的酶切電泳圖(見圖 1.2):泳道 M 為 泳道 1 為 AC 基因型,片段長度為 210bp、111bp 及 321bp 的三條帶AA 純合突變基因型,片段長度為 210bp、111b 兩條條帶;泳道 3 為片段長度為 321bp 的一條帶。
圖 1.3 TUSC7 rs1518338 位點的酶切電泳圖譜DNA Ladder;1 道:rs1518338CC 基因型;2 道:rs1518338 GG 基因C 基因型867837 位點酶切電泳跑膠圖(見圖 1.4):泳道 M 為 DNA L合突變基因型,82bp、113bp 及 195bp 三條帶;泳道 2 為 195bp 一條帶;泳道 3 為 GG 純合突變基因型,長為 82bp 及
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中國胃癌流行病學(xué)現(xiàn)狀[J]. 左婷婷,鄭榮壽,曾紅梅,張思維,陳萬青. 中國腫瘤臨床. 2017(01)
[2]Circulating micro RNAs and long non-coding RNAs in gastric cancer diagnosis:An update and review[J]. Ya-Kai Huang,Jian-Chun Yu. World Journal of Gastroenterology. 2015(34)
[3]Long Non-coding RNAs and Their Biological Roles in Plants[J]. Xue Liu,Lili Hao,Dayong Li,Lihuang Zhu,Songnian Hu. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(03)
[4]Trend Analysis of Cancer Mortality in the Jinchang Cohort, China,2001-2010[J]. QU Hong Mei,BAI Ya Na,CHENG Ning,DAI Min,ZHENG Tong Zhang,WANG Dennis,LI Hai Yan,HU Xiao Bin,LI Juan Sheng,REN Xiao Wei,SHANG Hui. Biomedical and Environmental Sciences. 2015(05)
[5]Molecular diagnosis and therapy for occult peritoneal metastasis in gastric cancer patients[J]. Shunsuke Kagawa,Kunitoshi Shigeyasu,Michihiro Ishida,Megumi Watanabe,Hiroshi Tazawa,Takeshi Nagasaka,Yasuhiro Shirakawa,Toshiyoshi Fujiwara. World Journal of Gastroenterology. 2014(47)
[6]胃癌病因?qū)W的研究進展[J]. 萬晶晶,馬興剛. 醫(yī)學(xué)綜述. 2014(14)
[7]Role of microRNAs in gastric cancer[J]. Hideyuki Ishiguro,Masahiro Kimura,Hiromitsu Takeyama. World Journal of Gastroenterology. 2014(19)
[8]History of Helicobacter pylori,duodenal ulcer,gastric ulcer and gastric cancer[J]. David Y Graham. World Journal of Gastroenterology. 2014(18)
[9]Function of lncRNAs and approaches to lncRNA-protein interactions[J]. ZHU JuanJuan,FU HanJiang,WU YongGe,ZHENG XiaoFei. Science China(Life Sciences). 2013(10)
[10]重慶市某4所中小學(xué)學(xué)生心理健康狀況MHT問卷調(diào)查分析[J]. 寧源,孔亞,溫茂霖,王麗,張玲,張勇,曾緩,韓令力,趙勇. 重慶醫(yī)學(xué). 2013(22)
本文編號:3574515
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1雙熒光素酶報告基因質(zhì)粒結(jié)構(gòu)圖
結(jié)果3.2 基因分型3.2.1 凝膠電泳結(jié)果TUSC7 rs12494960 位點的酶切電泳圖(見圖 1.2):泳道 M 為 泳道 1 為 AC 基因型,片段長度為 210bp、111bp 及 321bp 的三條帶AA 純合突變基因型,片段長度為 210bp、111b 兩條條帶;泳道 3 為片段長度為 321bp 的一條帶。
圖 1.3 TUSC7 rs1518338 位點的酶切電泳圖譜DNA Ladder;1 道:rs1518338CC 基因型;2 道:rs1518338 GG 基因C 基因型867837 位點酶切電泳跑膠圖(見圖 1.4):泳道 M 為 DNA L合突變基因型,82bp、113bp 及 195bp 三條帶;泳道 2 為 195bp 一條帶;泳道 3 為 GG 純合突變基因型,長為 82bp 及
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中國胃癌流行病學(xué)現(xiàn)狀[J]. 左婷婷,鄭榮壽,曾紅梅,張思維,陳萬青. 中國腫瘤臨床. 2017(01)
[2]Circulating micro RNAs and long non-coding RNAs in gastric cancer diagnosis:An update and review[J]. Ya-Kai Huang,Jian-Chun Yu. World Journal of Gastroenterology. 2015(34)
[3]Long Non-coding RNAs and Their Biological Roles in Plants[J]. Xue Liu,Lili Hao,Dayong Li,Lihuang Zhu,Songnian Hu. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(03)
[4]Trend Analysis of Cancer Mortality in the Jinchang Cohort, China,2001-2010[J]. QU Hong Mei,BAI Ya Na,CHENG Ning,DAI Min,ZHENG Tong Zhang,WANG Dennis,LI Hai Yan,HU Xiao Bin,LI Juan Sheng,REN Xiao Wei,SHANG Hui. Biomedical and Environmental Sciences. 2015(05)
[5]Molecular diagnosis and therapy for occult peritoneal metastasis in gastric cancer patients[J]. Shunsuke Kagawa,Kunitoshi Shigeyasu,Michihiro Ishida,Megumi Watanabe,Hiroshi Tazawa,Takeshi Nagasaka,Yasuhiro Shirakawa,Toshiyoshi Fujiwara. World Journal of Gastroenterology. 2014(47)
[6]胃癌病因?qū)W的研究進展[J]. 萬晶晶,馬興剛. 醫(yī)學(xué)綜述. 2014(14)
[7]Role of microRNAs in gastric cancer[J]. Hideyuki Ishiguro,Masahiro Kimura,Hiromitsu Takeyama. World Journal of Gastroenterology. 2014(19)
[8]History of Helicobacter pylori,duodenal ulcer,gastric ulcer and gastric cancer[J]. David Y Graham. World Journal of Gastroenterology. 2014(18)
[9]Function of lncRNAs and approaches to lncRNA-protein interactions[J]. ZHU JuanJuan,FU HanJiang,WU YongGe,ZHENG XiaoFei. Science China(Life Sciences). 2013(10)
[10]重慶市某4所中小學(xué)學(xué)生心理健康狀況MHT問卷調(diào)查分析[J]. 寧源,孔亞,溫茂霖,王麗,張玲,張勇,曾緩,韓令力,趙勇. 重慶醫(yī)學(xué). 2013(22)
本文編號:3574515
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/zlx/3574515.html
最近更新
教材專著