發(fā)布時間：2022-01-03 11:53

　　目的免疫治療在膀胱癌中發(fā)揮著重要作用。腫瘤突變負(fù)荷（Tumor Mutation Burden,TMB）與免疫微環(huán)境的關(guān)系密切。基于TMB分析探索膀胱癌的病理機制,有助于膀胱癌免疫機制的明確,也為臨床醫(yī)生提供一個新的生物標(biāo)志物。方法從TCGA數(shù)據(jù)庫中收集與膀胱癌有關(guān)的數(shù)據(jù),計算TMB值,將之分為高TMB組與低TMB組。分析TMB與臨床數(shù)據(jù)之間的相關(guān)性,繪制生存曲線。利用limma程序包,查找兩組間的差異表達(dá)基因（Differential Expressed Genes,DEGs）。對DEGs進行GO和KEGG通路分析。之后應(yīng)用clusterProfiler軟件包對差異基因的功能進行分析。應(yīng)用GEPIA探討差異基因與膀胱癌患者總生存期的關(guān)系。最后,建立膀胱癌TMB與免疫微環(huán)境的關(guān)系,探究膀胱癌中免疫細(xì)胞的變化。結(jié)果（1）膀胱癌中最常見的突變是錯義突變。變體類型中SNP占比最大。SNV中的C>T轉(zhuǎn)換最多,C>G次之。膀胱癌中突變的TP53基因與突變的FGFR3基因互斥,而與突變的RB1基因共現(xiàn)。突變的TTN基因與突變的ERBB2、OBSCN、FAT4、ATM、MACF1和MUC... 

【文章來源】：蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：63 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

膀胱癌體細(xì)胞變異的可視化

蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文基于腫瘤突變負(fù)荷分析對膀胱癌病理機制的探討13圖3-2突變基因的瀑布圖注：根據(jù)基因的突變頻率排序，突變類型顯示在底部。圖3-3突變基因的三角矩陣圖注：膀胱癌中突變基因的互斥和共存以三角矩陣圖顯示。綠色表示共現(xiàn)的傾向，而粉紅色表示傾向于排他性。

蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文基于腫瘤突變負(fù)荷分析對膀胱癌病理機制的探討13圖3-2突變基因的瀑布圖注：根據(jù)基因的突變頻率排序，突變類型顯示在底部。圖3-3突變基因的三角矩陣圖注：膀胱癌中突變基因的互斥和共存以三角矩陣圖顯示。綠色表示共現(xiàn)的傾向，而粉紅色表示傾向于排他性。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]273例多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤TTN突變分析[J]. 房磊,矯健,高明偉,房昕.  解剖科學(xué)進展. 2019(04)
[2]皮革樣膀胱癌的臨床特點分析[J]. 張維宇,王煥瑞,胡浩,王起,張曉鵬,許克新.  中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)報. 2019(03)
[3]膀胱癌病因?qū)W研究進展[J]. 白云金,李金洪,魏強,韓平.  現(xiàn)代泌尿外科雜志. 2014(10)



本文編號：3566230