FASN基因的原核表達(dá)及生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-03 03:56
脂肪酸合成酶(FASN)在生物體內(nèi)起著重要的作用,主要參與惡性腫瘤的數(shù)量調(diào)控。本研究旨在構(gòu)建pET28a-FASN原核表達(dá)載體,并表達(dá)重組His-FASN蛋白,對(duì)該基因進(jìn)行結(jié)構(gòu)與功能的生物信息學(xué)分析。設(shè)計(jì)FASN基因特異性引物,通過PCR擴(kuò)增獲得的目的基因與原核表達(dá)載體pET28a連接,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá)His-FASN蛋白。獲得基因片段大小為1 320 bp,編碼440個(gè)氨基酸;成功構(gòu)建至pET28a原核表達(dá)載體,通過優(yōu)化表達(dá),確定在溫度為35℃、IPTG濃度0.5 mmol/L、誘導(dǎo)時(shí)間為6 h的條件下融合蛋白表達(dá)量較高,獲得蛋白大小約為53 kD;生物信息學(xué)分析結(jié)果表明FASN基因編碼的蛋白是一個(gè)不穩(wěn)定且具有親水性的蛋白,不存在信號(hào)肽及跨膜區(qū),可成為蛋白激酶磷酸化位點(diǎn)有12個(gè)Ser、5個(gè)Thr、3個(gè)Tyr。此外,從蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)中發(fā)現(xiàn),相互作用的蛋白包括主要;o酶A合成酶長鏈家族成員及乙酰輔酶A羧化酶家族成員,為開發(fā)抑制劑藥物提供了理論依據(jù)。
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
FASN基因PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳
重組質(zhì)粒pET28a-FASN的菌液PCR及雙酶切鑒定
利用ExPASy網(wǎng)站中的ProtParam工具對(duì)人類FASN基因編碼的氨基酸序列進(jìn)行分析顯示:FASN所編碼的蛋白質(zhì)由522個(gè)氨基酸組成,其中亮氨酸含量最高達(dá)13.0%,比其它氨基酸的含量大很多。FASN編碼蛋白質(zhì)分子量大小為57.466 13 kD,分子式為C2515H3999N725O773S22,等電點(diǎn)理論值為6.08,原子總數(shù)8 034,不穩(wěn)定系數(shù)為41.70,說明FASN基因編碼的蛋白是一個(gè)不穩(wěn)定蛋白;總平均親水性為-0.216,說明FASN基因編碼的蛋白是一個(gè)親水蛋白。圖4 融合蛋白His-FASN的不同時(shí)間的誘導(dǎo)表達(dá)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]GPC3基因的結(jié)構(gòu)與功能生物信息學(xué)預(yù)測[J]. 騰橋,夏麗潔,張富春. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(03)
[2]脂肪酸合成酶在胰腺癌細(xì)胞凋亡過程中的作用[J]. 苗常青,許靜,王軍,沙煥臣,王凱飛,李曉青,彭波. 西安交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2015(06)
[3]腫瘤細(xì)胞脂肪酸合成酶的研究進(jìn)展[J]. 藍(lán)英,張哲. 中國老年學(xué)雜志. 2015(11)
[4]脂肪酸合成酶抑制劑及其抗腫瘤作用研究進(jìn)展[J]. 陳一婧,張厚德. 中國現(xiàn)代醫(yī)生. 2015(15)
[5]脂肪酸合成酶與疾病[J]. 占敏霞,巫冠中. 亞太傳統(tǒng)醫(yī)藥. 2012(09)
[6]脂肪酸合成酶抑制劑的研究進(jìn)展[J]. 徐曉偉,王曉奎,李松. 國際藥學(xué)研究雜志. 2009(02)
[7]脂肪酸合成酶與乳腺癌[J]. 王書云,花天放. 中國臨床營養(yǎng)雜志. 2002(03)
本文編號(hào):3565519
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
FASN基因PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳
重組質(zhì)粒pET28a-FASN的菌液PCR及雙酶切鑒定
利用ExPASy網(wǎng)站中的ProtParam工具對(duì)人類FASN基因編碼的氨基酸序列進(jìn)行分析顯示:FASN所編碼的蛋白質(zhì)由522個(gè)氨基酸組成,其中亮氨酸含量最高達(dá)13.0%,比其它氨基酸的含量大很多。FASN編碼蛋白質(zhì)分子量大小為57.466 13 kD,分子式為C2515H3999N725O773S22,等電點(diǎn)理論值為6.08,原子總數(shù)8 034,不穩(wěn)定系數(shù)為41.70,說明FASN基因編碼的蛋白是一個(gè)不穩(wěn)定蛋白;總平均親水性為-0.216,說明FASN基因編碼的蛋白是一個(gè)親水蛋白。圖4 融合蛋白His-FASN的不同時(shí)間的誘導(dǎo)表達(dá)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]GPC3基因的結(jié)構(gòu)與功能生物信息學(xué)預(yù)測[J]. 騰橋,夏麗潔,張富春. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(03)
[2]脂肪酸合成酶在胰腺癌細(xì)胞凋亡過程中的作用[J]. 苗常青,許靜,王軍,沙煥臣,王凱飛,李曉青,彭波. 西安交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2015(06)
[3]腫瘤細(xì)胞脂肪酸合成酶的研究進(jìn)展[J]. 藍(lán)英,張哲. 中國老年學(xué)雜志. 2015(11)
[4]脂肪酸合成酶抑制劑及其抗腫瘤作用研究進(jìn)展[J]. 陳一婧,張厚德. 中國現(xiàn)代醫(yī)生. 2015(15)
[5]脂肪酸合成酶與疾病[J]. 占敏霞,巫冠中. 亞太傳統(tǒng)醫(yī)藥. 2012(09)
[6]脂肪酸合成酶抑制劑的研究進(jìn)展[J]. 徐曉偉,王曉奎,李松. 國際藥學(xué)研究雜志. 2009(02)
[7]脂肪酸合成酶與乳腺癌[J]. 王書云,花天放. 中國臨床營養(yǎng)雜志. 2002(03)
本文編號(hào):3565519
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