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嬰兒血管瘤長鏈非編碼RNA與mRNA表達譜分析

發(fā)布時間:2021-12-30 11:20
  目的研究增殖期與消退期嬰兒血管瘤(IH)長鏈非編碼RNA(lncRNA)與mRNA的差異表達情況。方法 2019年1-3月在四川大學華西醫(yī)院小兒外科收集行手術(shù)切除治療的8例IH組織(增殖期與消退期各4例),運用基因芯片技術(shù)篩選差異表達(P < 0.05,差異倍數(shù)≥ 1.5)lncRNA和mRNA,并用實時熒光定量PCR(qRT-PCR)技術(shù)對芯片結(jié)果進行驗證。同時,應用生物信息學方法,對差異基因進行GO功能和KEGG通路分析,并構(gòu)建lncRNA-mRNA共表達網(wǎng)絡,預測差異lncRNA的順式作用靶基因。結(jié)果通過基因芯片技術(shù)共篩選出405條差異lncRNA(108條下調(diào),297條上調(diào))與772條差異mRNA(107條下調(diào),665條上調(diào))。qRT-PCR驗證4條lncRNA(n335248、ENST00000450864、n333319和n335185)與4條mRNA(EDNRA、IFI6、HK2與ITGA1)的表達,結(jié)果與基因芯片檢測結(jié)果一致。GO與KEGG富集分析發(fā)現(xiàn),差異mRNA主要參與血管凝固、軸突導向、血管生成和細胞黏附等生物過程,差異mRNA主要富集在代謝通路、細胞局部黏... 

【文章來源】:中華皮膚科雜志. 2020,53(07)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:6 頁

【參考文獻】:
期刊論文
[1]嬰兒血管瘤發(fā)病過程中的關(guān)鍵信號通路[J]. 楊開穎,陳思源,吉毅.  國際皮膚性病學雜志. 2017 (06)



本文編號:3558091

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