基于長鏈非編碼RNA的生物標(biāo)志物預(yù)測膀胱尿路上皮癌患者生存的生物信息學(xué)研究
發(fā)布時間:2021-12-02 06:05
背景:膀胱尿路上皮癌(BLCA)是人體最常見的惡性腫瘤之一,具有異質(zhì)性顯著,復(fù)發(fā)率高、惡性程度高、預(yù)后較差的特點。精確的預(yù)后判斷是個體化精準(zhǔn)治療的基礎(chǔ)。然而,使用傳統(tǒng)的臨床病理特征判斷預(yù)后并不準(zhǔn)確。目前,新型分子生物標(biāo)志物被越來越多地研究用于病人風(fēng)險分層和生存預(yù)測。本研究的目的是確定一組可以用來精準(zhǔn)預(yù)測BLCA患者預(yù)后生存的基于長鏈非編碼RNA(lncRNA)的新型生物標(biāo)志物。方法:通過單因素COX分回歸析和隨機生存森林變量選擇的大數(shù)據(jù)統(tǒng)計方法對來自基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(Gene Expression Omnibus)的三個數(shù)據(jù)集:GSE32894、GSE32548、GSE13507共520例BLCA患者的lncRNA表達(dá)譜進(jìn)行分析,得到一組具有預(yù)后意義的lncRNA生物標(biāo)記物并建立預(yù)后模型,并采用了多種統(tǒng)計方法驗證該模型的預(yù)后價值。通過與其他分子標(biāo)志物對比和GSEA等方法對該模型進(jìn)行橫向討論。結(jié)果:本研究共挖掘出10個與預(yù)后顯著相關(guān)的lncRNA,并通過列線圖的方式建立了風(fēng)險模型。經(jīng)驗證,此模型可以將GSE32894數(shù)據(jù)組的患者分為疾病特異性存活率顯著不同的高危組和低危組(HR=1.9...
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
A所示,Kaplan-Meier曲線展示了在訓(xùn)練集GSE32894中,具有較高風(fēng)險評分的患者的DSS比具有較低風(fēng)險評分的患者的疾DSS顯著縮短(log-rankP
本文編號:3527881
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
A所示,Kaplan-Meier曲線展示了在訓(xùn)練集GSE32894中,具有較高風(fēng)險評分的患者的DSS比具有較低風(fēng)險評分的患者的疾DSS顯著縮短(log-rankP
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