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基于生物信息學(xué)研究EGFR在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)及預(yù)后相關(guān)性

發(fā)布時(shí)間:2021-10-10 20:36
  背景肺癌(Lung cancer)已經(jīng)成為嚴(yán)重威脅人類健康的癌癥之一。肺癌的發(fā)病率在男性中居于第一位,在女性中僅次于乳腺癌,處于第二位。非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者約占所有肺癌發(fā)病率的80%~85%。NSCLC最常見(jiàn)的類型有鱗狀細(xì)胞癌(SCC)和腺癌(AD)。在不吸煙的人群中最常發(fā)生的肺癌類型主要為肺腺癌。目前手術(shù)切除病變組織仍是治療肺癌最有效的方法,盡管由于醫(yī)療條件的改善,手術(shù)技術(shù)以及輔助設(shè)備的升級(jí)提高了對(duì)于肺癌患者的治療效果,但NSCLC患者術(shù)后5年的總體生存率仍為15%~45%。腫瘤預(yù)后標(biāo)記物可以影響和預(yù)測(cè)癌癥患者生存期。表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)屬于受體酪氨酸激酶(RTKs)的Erb B家族,在上皮細(xì)胞生理作用中發(fā)揮重要作用,EGFR的激活主要介導(dǎo)基因的擴(kuò)增和自分泌刺激,是腫瘤發(fā)生的主要因素也是癌細(xì)胞侵襲性增加的主要因素,另一方面EGFR突變和基因重排經(jīng)常引起受體胞吞作用的改變,有助于增加信號(hào)傳導(dǎo)性。NSCLC中總的EGFR表達(dá)率約為51%,在頭頸癌、卵巢癌、子宮頸癌食道癌以及膀胱癌中70%無(wú)復(fù)發(fā)患者的不良預(yù)后都與EGFR的過(guò)表達(dá)相關(guān)。本課題通過(guò)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)下載NSCLC... 

【文章來(lái)源】:河南大學(xué)河南省

【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于生物信息學(xué)研究EGFR在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)及預(yù)后相關(guān)性


癌旁正常肺組織與NSCLC腫瘤組織HE染(a)

腫瘤


173實(shí)驗(yàn)結(jié)果3.1癌旁正常肺組織與NSCLC腫瘤組織HE染色比較癌旁正常組織在顯微鏡下可見(jiàn):支氣管粘膜上皮為假?gòu)?fù)層纖毛柱狀上皮,有杯狀細(xì)胞及少量腺體。I型肺泡上皮細(xì)胞較為寬扁,胞質(zhì)薄,細(xì)胞量較少,II型肺泡上皮細(xì)胞呈立方或圓形,細(xì)胞質(zhì)著色淺,呈泡沫狀,細(xì)胞量較多。間質(zhì)內(nèi)可見(jiàn)少量炎細(xì)胞浸潤(rùn)。NSCLC腫瘤組織顯微鏡下可見(jiàn):細(xì)胞排列紊亂,細(xì)胞核較大,核漿染色深,核漿比增大,肺泡及肺泡管異常擴(kuò)張(圖3-1)。圖3-1癌旁正常肺組織與NSCLC腫瘤組織HE染色比較。(a)為癌旁組織切片的HE染色鏡下觀。(b)為肺鱗癌腫瘤組織切片的HE染色鏡下觀。(c)為肺腺癌腫瘤組織切片HE染色鏡下觀。3.2生物信息學(xué)分析結(jié)果3.2.1EGFR表達(dá)量差異通過(guò)TCGA網(wǎng)站下載非小細(xì)胞肺癌數(shù)據(jù)文件,其中包含NSCLC樣本共1102例,其中腫瘤組織999例,癌旁組織103例,對(duì)數(shù)據(jù)中各樣本的EGFR表達(dá)量進(jìn)行提取,將腫瘤組織中的EGFR表達(dá)量與癌旁組織中的表達(dá)量應(yīng)用limmaR包進(jìn)行秩和檢驗(yàn)比較癌旁組織與腫瘤組織中EGFR的表達(dá)差異,結(jié)果表明在癌旁組織與腫瘤組織中EGFR的表達(dá)量有顯著差異,在癌旁組織中EGFR表達(dá)量較低,腫瘤組織中表達(dá)量較高,判斷標(biāo)準(zhǔn)為:P<0.05具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖3-2)。之后對(duì)同一樣本中癌旁組織與腫瘤組織中的EGFR表達(dá)量做配對(duì)差異分析,結(jié)果表明在同一樣本的不同組織類型中EGFR的表達(dá)有顯著差異,癌旁組織中EGFR表達(dá)量較低,腫瘤組織中表達(dá)量較高,判斷標(biāo)準(zhǔn)為:P<0.05具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖3-3)。在Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)中分析EGFR在正常組織與腫瘤組織中的(a)(b)(c)

基于生物信息學(xué)研究EGFR在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)及預(yù)后相關(guān)性


EGFR表達(dá)量差異

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]非小細(xì)胞肺癌組織起源分子病理分類及其臨床意義[J]. 王娜娜,江楠,楊曉慶,房磊,孫青.  中國(guó)肺癌雜志. 2018(07)
[3]非小細(xì)胞肺癌的分子靶向治療[J]. 南兆棣,陳紹水.  國(guó)際腫瘤學(xué)雜志. 2018 (01)
[4]非小細(xì)胞肺癌EGFR基因靶向治療研究進(jìn)展[J]. 張卉,張樹才.  中國(guó)肺癌雜志. 2017(01)
[5]非小細(xì)胞肺癌分子靶向治療藥物的現(xiàn)狀及進(jìn)展[J]. 金靜思,賀巾釗,周黎明.  中國(guó)腫瘤臨床. 2015(17)
[6]非小細(xì)胞肺癌驅(qū)動(dòng)基因研究進(jìn)展[J]. 趙建國(guó),熊建萍.  中國(guó)肺癌雜志. 2015(01)

碩士論文
[1]中國(guó)女性肺癌流行趨勢(shì)及其影響因素研究[D]. 倪雪.中國(guó)疾病預(yù)防控制中心 2019



本文編號(hào):3429115

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