食管癌（esophageal cancer,EC）是最常見的消化道癌癥之一,在我國,食管鱗狀細胞癌（食管鱗癌,esophageal squamous cell carcinoma,ESCC）患者占食管癌患者的90%以上,因起病隱匿,早期癥狀不明顯,許多患者初診時已處于晚期,預后較差。腫瘤相關抗原（tumor associated antigen,TAA）自身抗體可在腫瘤患者的血清中穩(wěn)定存在,并可以在臨床癥狀出現(xiàn)的數(shù)月甚至數(shù)年之前被檢測到,因此,具有作為腫瘤早期免疫診斷標志物的潛力。目的本研究通過定制癌癥驅動基因編碼的蛋白芯片和對GEO數(shù)據(jù)庫中食管鱗癌相關數(shù)據(jù)集的生物信息學分析,結合酶聯(lián)免疫吸附實驗（enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA）技術,對食管鱗癌相關自身抗體進行篩選和驗證,探索最優(yōu)的食管鱗癌診斷模型,為建立一種非侵入性的食管鱗癌早期診斷技術提供一定的科學依據(jù)。方法1.蛋白質芯片篩選食管鱗癌相關抗原基于癌癥驅動基因編碼的蛋白質定制Focused array人類蛋白質芯片,檢測90例食管鱗癌患者和50例正常人血清中的抗TAA自身抗體的表達水平... 

【文章來源】：鄭州大學河南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：97 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
基金資助
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 引言
2 材料與方法
    2.1 基于蛋白質芯片篩選食管鱗癌相關抗原
        2.1.1 蛋白芯片的檢測
        2.1.2 數(shù)據(jù)預處理及分析策略
    2.2 基于GEO數(shù)據(jù)庫篩選食管鱗癌相關抗原
        2.2.1 GEO數(shù)據(jù)庫中差異基因分析
        2.2.2 功能和通路富集分析
        2.2.3 GEPIA數(shù)據(jù)庫驗證
    2.3 應用間接ELISA確認抗TAA自身抗體對食管鱗癌的診斷價值
        2.3.1 實驗設計及血清標本
        2.3.2 主要試劑及儀器設備
        2.3.3 主要溶液的配制
        2.3.4 實驗方法及步驟
        2.3.5 統(tǒng)計分析方法
3 結果
    3.1 蛋白芯片篩選的候選TAA
        3.1.1 蛋白芯片的檢測結果及穩(wěn)定性
        3.1.2 食管鱗癌組和對照組中差異表達的候選TAA
        3.1.3 芯片檢測中候選TAA的基本信息
    3.2 GEO數(shù)據(jù)庫篩選的候選TAA
        3.2.1 食管鱗癌的差異表達基因篩選
        3.2.2 差異基因的富集分析及驗證
        3.2.3 候選TAA的基本信息
    3.3 評價抗TAA自身抗體對食管鱗癌的診斷價值及構建診斷模型
        3.3.1 研究對象的基本特征
        3.3.2 訓練集中單個自身抗體對食管鱗癌的診斷價值
        3.3.3 驗證集中單個自身抗體對食管鱗癌的診斷價值
        3.3.4 食管鱗癌診斷模型的構建與評價
        3.3.5 最優(yōu)診斷模型對不同臨床特征的食管鱗癌的診斷價值評價
4 討論
    4.1 蛋白芯片技篩選TAA
    4.2 GEO數(shù)據(jù)庫篩選TAA
    4.3 9種抗TM自身抗體對食管鱗癌的診斷價值
    4.4 抗TAA自身抗體組合對食管鱗癌的診斷價值
    4.5 本研究的優(yōu)缺點
    4.6 工作展望
5 結論
參考文獻
綜述 腫瘤相關抗原自身抗體在惡性腫瘤中的應用
    參考文獻
附錄
個人簡歷及學術論文發(fā)表情況
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]外周血腫瘤相關抗原自身抗體水平與非小細胞肺癌早期診斷與預后的關系研究[D]. 趙歡.吉林大學 2019
[2]候選食管癌相關抗原的篩選鑒定及其對食管鱗癌的診斷價值[D]. 張紅飛.鄭州大學 2017

碩士論文
[1]腫瘤相關抗原自身抗體聯(lián)合檢測對胃癌診斷價值的評價[D]. 王帥兵.鄭州大學 2018



本文編號：3426585