蛋白芯片和GEO篩選食管鱗癌相關(guān)抗原及其自身抗體診斷價(jià)值評價(jià)
發(fā)布時(shí)間:2021-10-09 14:38
食管癌(esophageal cancer,EC)是最常見的消化道癌癥之一,在我國,食管鱗狀細(xì)胞癌(食管鱗癌,esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)患者占食管癌患者的90%以上,因起病隱匿,早期癥狀不明顯,許多患者初診時(shí)已處于晚期,預(yù)后較差。腫瘤相關(guān)抗原(tumor associated antigen,TAA)自身抗體可在腫瘤患者的血清中穩(wěn)定存在,并可以在臨床癥狀出現(xiàn)的數(shù)月甚至數(shù)年之前被檢測到,因此,具有作為腫瘤早期免疫診斷標(biāo)志物的潛力。目的本研究通過定制癌癥驅(qū)動(dòng)基因編碼的蛋白芯片和對GEO數(shù)據(jù)庫中食管鱗癌相關(guān)數(shù)據(jù)集的生物信息學(xué)分析,結(jié)合酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)技術(shù),對食管鱗癌相關(guān)自身抗體進(jìn)行篩選和驗(yàn)證,探索最優(yōu)的食管鱗癌診斷模型,為建立一種非侵入性的食管鱗癌早期診斷技術(shù)提供一定的科學(xué)依據(jù)。方法1.蛋白質(zhì)芯片篩選食管鱗癌相關(guān)抗原基于癌癥驅(qū)動(dòng)基因編碼的蛋白質(zhì)定制Focused array人類蛋白質(zhì)芯片,檢測90例食管鱗癌患者和50例正常人血清中的抗TAA自身抗體的表達(dá)水平...
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:97 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
基金資助
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 引言
2 材料與方法
2.1 基于蛋白質(zhì)芯片篩選食管鱗癌相關(guān)抗原
2.1.1 蛋白芯片的檢測
2.1.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理及分析策略
2.2 基于GEO數(shù)據(jù)庫篩選食管鱗癌相關(guān)抗原
2.2.1 GEO數(shù)據(jù)庫中差異基因分析
2.2.2 功能和通路富集分析
2.2.3 GEPIA數(shù)據(jù)庫驗(yàn)證
2.3 應(yīng)用間接ELISA確認(rèn)抗TAA自身抗體對食管鱗癌的診斷價(jià)值
2.3.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及血清標(biāo)本
2.3.2 主要試劑及儀器設(shè)備
2.3.3 主要溶液的配制
2.3.4 實(shí)驗(yàn)方法及步驟
2.3.5 統(tǒng)計(jì)分析方法
3 結(jié)果
3.1 蛋白芯片篩選的候選TAA
3.1.1 蛋白芯片的檢測結(jié)果及穩(wěn)定性
3.1.2 食管鱗癌組和對照組中差異表達(dá)的候選TAA
3.1.3 芯片檢測中候選TAA的基本信息
3.2 GEO數(shù)據(jù)庫篩選的候選TAA
3.2.1 食管鱗癌的差異表達(dá)基因篩選
3.2.2 差異基因的富集分析及驗(yàn)證
3.2.3 候選TAA的基本信息
3.3 評價(jià)抗TAA自身抗體對食管鱗癌的診斷價(jià)值及構(gòu)建診斷模型
3.3.1 研究對象的基本特征
3.3.2 訓(xùn)練集中單個(gè)自身抗體對食管鱗癌的診斷價(jià)值
3.3.3 驗(yàn)證集中單個(gè)自身抗體對食管鱗癌的診斷價(jià)值
3.3.4 食管鱗癌診斷模型的構(gòu)建與評價(jià)
3.3.5 最優(yōu)診斷模型對不同臨床特征的食管鱗癌的診斷價(jià)值評價(jià)
4 討論
4.1 蛋白芯片技篩選TAA
4.2 GEO數(shù)據(jù)庫篩選TAA
4.3 9種抗TM自身抗體對食管鱗癌的診斷價(jià)值
4.4 抗TAA自身抗體組合對食管鱗癌的診斷價(jià)值
4.5 本研究的優(yōu)缺點(diǎn)
4.6 工作展望
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 腫瘤相關(guān)抗原自身抗體在惡性腫瘤中的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
附錄
個(gè)人簡歷及學(xué)術(shù)論文發(fā)表情況
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抗HER2酪氨酸激酶抑制劑在腦轉(zhuǎn)移乳腺癌中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 張雪梅,田武國,張曉華,楊秀木. 現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2020(05)
[2]我國消化道早癌篩查的挑戰(zhàn)和展望[J]. 杜奕奇,李兆申. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020(01)
[3]Autoantibodies: Potential clinical applications in early detection of esophageal squamous cell carcinoma and esophagogastric junction adenocarcinoma[J]. Yi-Wei Xu,Yu-Hui Peng,Li-Yan Xu,Jian-Jun Xie,En-Min Li. World Journal of Gastroenterology. 2019(34)
[4]抗肝癌小分子酪氨酸激酶抑制劑的臨床研究進(jìn)展[J]. 常青青,彭英,王廣基,孫建國. 中國臨床藥理學(xué)與治療學(xué). 2019(08)
[5]肺癌血清學(xué)腫瘤標(biāo)志物的研究[J]. 謝田田,孫曉曉,馬靜,謝龍祥,張璐,厲永強(qiáng),韓亞莉,郭向前,張祎捷,閆中義. 河南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2018(04)
[6]抑制葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白1表達(dá)可降低神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移能力[J]. 彭妍,邢思寧,唐瑚應(yīng),劉星,汪長東,易發(fā)平,劉革力,武向梅. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2018(11)
[7]腫瘤自身抗體標(biāo)志物的研究進(jìn)展[J]. 李陽,郭書娟,陶生策. 生物產(chǎn)業(yè)技術(shù). 2018(02)
[8]癌癥早期診斷可拯救生命和降低醫(yī)療費(fèi)用[J]. 本刊編輯部. 中國腫瘤臨床與康復(fù). 2017(03)
[9]食管癌術(shù)后存活率及生活質(zhì)量的相關(guān)因素分析[J]. 李毅成. 泰山醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(01)
[10]食管癌發(fā)病水平及變化趨勢[J]. 曹小琴,孫喜斌. 中國腫瘤臨床. 2016(21)
博士論文
[1]外周血腫瘤相關(guān)抗原自身抗體水平與非小細(xì)胞肺癌早期診斷與預(yù)后的關(guān)系研究[D]. 趙歡.吉林大學(xué) 2019
[2]候選食管癌相關(guān)抗原的篩選鑒定及其對食管鱗癌的診斷價(jià)值[D]. 張紅飛.鄭州大學(xué) 2017
碩士論文
[1]腫瘤相關(guān)抗原自身抗體聯(lián)合檢測對胃癌診斷價(jià)值的評價(jià)[D]. 王帥兵.鄭州大學(xué) 2018
本文編號:3426585
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:97 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
基金資助
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 引言
2 材料與方法
2.1 基于蛋白質(zhì)芯片篩選食管鱗癌相關(guān)抗原
2.1.1 蛋白芯片的檢測
2.1.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理及分析策略
2.2 基于GEO數(shù)據(jù)庫篩選食管鱗癌相關(guān)抗原
2.2.1 GEO數(shù)據(jù)庫中差異基因分析
2.2.2 功能和通路富集分析
2.2.3 GEPIA數(shù)據(jù)庫驗(yàn)證
2.3 應(yīng)用間接ELISA確認(rèn)抗TAA自身抗體對食管鱗癌的診斷價(jià)值
2.3.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及血清標(biāo)本
2.3.2 主要試劑及儀器設(shè)備
2.3.3 主要溶液的配制
2.3.4 實(shí)驗(yàn)方法及步驟
2.3.5 統(tǒng)計(jì)分析方法
3 結(jié)果
3.1 蛋白芯片篩選的候選TAA
3.1.1 蛋白芯片的檢測結(jié)果及穩(wěn)定性
3.1.2 食管鱗癌組和對照組中差異表達(dá)的候選TAA
3.1.3 芯片檢測中候選TAA的基本信息
3.2 GEO數(shù)據(jù)庫篩選的候選TAA
3.2.1 食管鱗癌的差異表達(dá)基因篩選
3.2.2 差異基因的富集分析及驗(yàn)證
3.2.3 候選TAA的基本信息
3.3 評價(jià)抗TAA自身抗體對食管鱗癌的診斷價(jià)值及構(gòu)建診斷模型
3.3.1 研究對象的基本特征
3.3.2 訓(xùn)練集中單個(gè)自身抗體對食管鱗癌的診斷價(jià)值
3.3.3 驗(yàn)證集中單個(gè)自身抗體對食管鱗癌的診斷價(jià)值
3.3.4 食管鱗癌診斷模型的構(gòu)建與評價(jià)
3.3.5 最優(yōu)診斷模型對不同臨床特征的食管鱗癌的診斷價(jià)值評價(jià)
4 討論
4.1 蛋白芯片技篩選TAA
4.2 GEO數(shù)據(jù)庫篩選TAA
4.3 9種抗TM自身抗體對食管鱗癌的診斷價(jià)值
4.4 抗TAA自身抗體組合對食管鱗癌的診斷價(jià)值
4.5 本研究的優(yōu)缺點(diǎn)
4.6 工作展望
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 腫瘤相關(guān)抗原自身抗體在惡性腫瘤中的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
附錄
個(gè)人簡歷及學(xué)術(shù)論文發(fā)表情況
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抗HER2酪氨酸激酶抑制劑在腦轉(zhuǎn)移乳腺癌中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 張雪梅,田武國,張曉華,楊秀木. 現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2020(05)
[2]我國消化道早癌篩查的挑戰(zhàn)和展望[J]. 杜奕奇,李兆申. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020(01)
[3]Autoantibodies: Potential clinical applications in early detection of esophageal squamous cell carcinoma and esophagogastric junction adenocarcinoma[J]. Yi-Wei Xu,Yu-Hui Peng,Li-Yan Xu,Jian-Jun Xie,En-Min Li. World Journal of Gastroenterology. 2019(34)
[4]抗肝癌小分子酪氨酸激酶抑制劑的臨床研究進(jìn)展[J]. 常青青,彭英,王廣基,孫建國. 中國臨床藥理學(xué)與治療學(xué). 2019(08)
[5]肺癌血清學(xué)腫瘤標(biāo)志物的研究[J]. 謝田田,孫曉曉,馬靜,謝龍祥,張璐,厲永強(qiáng),韓亞莉,郭向前,張祎捷,閆中義. 河南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2018(04)
[6]抑制葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白1表達(dá)可降低神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移能力[J]. 彭妍,邢思寧,唐瑚應(yīng),劉星,汪長東,易發(fā)平,劉革力,武向梅. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2018(11)
[7]腫瘤自身抗體標(biāo)志物的研究進(jìn)展[J]. 李陽,郭書娟,陶生策. 生物產(chǎn)業(yè)技術(shù). 2018(02)
[8]癌癥早期診斷可拯救生命和降低醫(yī)療費(fèi)用[J]. 本刊編輯部. 中國腫瘤臨床與康復(fù). 2017(03)
[9]食管癌術(shù)后存活率及生活質(zhì)量的相關(guān)因素分析[J]. 李毅成. 泰山醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(01)
[10]食管癌發(fā)病水平及變化趨勢[J]. 曹小琴,孫喜斌. 中國腫瘤臨床. 2016(21)
博士論文
[1]外周血腫瘤相關(guān)抗原自身抗體水平與非小細(xì)胞肺癌早期診斷與預(yù)后的關(guān)系研究[D]. 趙歡.吉林大學(xué) 2019
[2]候選食管癌相關(guān)抗原的篩選鑒定及其對食管鱗癌的診斷價(jià)值[D]. 張紅飛.鄭州大學(xué) 2017
碩士論文
[1]腫瘤相關(guān)抗原自身抗體聯(lián)合檢測對胃癌診斷價(jià)值的評價(jià)[D]. 王帥兵.鄭州大學(xué) 2018
本文編號:3426585
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