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基于質(zhì)譜的肺腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白質(zhì)組學(xué)及磷酸化修飾組學(xué)研究

發(fā)布時間:2021-06-24 14:35
  目的肺腺癌是惡性程度最高的腫瘤之一,淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移是其最主要的轉(zhuǎn)移途徑之一。一部分患者在腫瘤體積較小時即出現(xiàn)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,蛋白質(zhì)是生命功能的執(zhí)行者,了解這部分患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白具有重要的臨床價值。本研究通過基于質(zhì)譜的蛋白組學(xué)及磷酸化修飾組學(xué),探索肺腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移關(guān)鍵蛋白和通路,并嘗試建立蛋白亞組。方法本研究入組52例肺腺癌患者并收集臨床資料,其中實驗組(淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性肺腺癌,病理分期T1b N2M0)病例25例,對照組(無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性肺腺癌病理分期T3-4N0M0)病例27例。利用52例患者的冰凍腫瘤樣本和正常肺組織樣本,通過基于質(zhì)譜的4D-LFQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定蛋白并進行定量,由于樣本量限制,42例患者進行了蛋白磷酸化修飾組學(xué)檢測。本研究以差異表達(dá)量變化≥2作為顯著上調(diào)的閾值,≤1/2作為顯著下調(diào)的變化閾值,分別篩選腫瘤樣本對比正常樣本、實驗組腫瘤樣本對比正常組腫瘤樣本的差異表達(dá)蛋白及磷酸化修飾位點,并對差異蛋白進行亞細(xì)胞定位、結(jié)構(gòu)域分析、GO功能注釋和KEGG通路富集分析。通過蛋白互作網(wǎng)絡(luò)篩選關(guān)鍵蛋白,并對患者進行蛋白亞組分組和預(yù)后分析。結(jié)果實驗組患者EGFR基因突變頻率更高,而... 

【文章來源】:華南理工大學(xué)廣東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:84 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于質(zhì)譜的肺腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白質(zhì)組學(xué)及磷酸化修飾組學(xué)研究


病例篩選流程圖

曲線,生存分析,實驗組,患者


第二章肺腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移實驗組與對照組病例篩選流程及臨床數(shù)據(jù)分析11表2-5臨床變量與OS的單因素與多因素cox分析(續(xù))2.3.4.2實驗組和對照組生存分析實驗組和對照組患者的術(shù)后無病生存時間(DFS)見圖2-2,總生存時間(OS)見圖2-3,實驗組的DFS更差(HR=1.934,95%CI:0.992-3.772,P=0.046),但生存曲線出現(xiàn)明顯交叉。實驗組和對照組的OS無差異(P=0.464)。圖2-2實驗組和對照組患者DFS生存分析圖

生存分析,實驗組,患者


華南理工大學(xué)碩士學(xué)位論文12圖2-3實驗組和對照組患者OS生存分析圖2.4討論淋巴結(jié)是肺腺癌最常見的轉(zhuǎn)移模式,也是最常見的術(shù)后復(fù)發(fā)模式,因此,探索肺腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的影響因素和蛋白,有助于判斷臨床預(yù)后,進而為手術(shù)方式、術(shù)后輔助治療和隨訪提供參考意見。為更好地尋找早期肺腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的影響因素,本研究通過設(shè)定嚴(yán)格的入組條件,篩選出27例對照組患者和25例實驗組患者,并在本章中對臨床信息進行對比。本研究發(fā)現(xiàn),大腫瘤組患者的吸煙指數(shù)更高。吸煙可提升多種癌癥的發(fā)病率,2019年science一篇研究通過大樣本全外顯子測序,發(fā)現(xiàn)吸煙與多種不同突變特征的突變負(fù)荷增加相關(guān),吸煙指數(shù)的提升與DNA突變數(shù)目成正比,提示吸煙可通過影響基因的穩(wěn)定性而影響腫瘤的發(fā)生[19]。本研究對兩組患者進行生存分析,實驗組的病理分期高于對照組,結(jié)果顯示實驗組DFS劣于對照組。兩組總生存時間沒有生存差異,可能由三個原因造成:①由于本研究入組患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移異質(zhì)性高,為臨床上較少見類型,樣本量有限制。②實驗組雖然分期高,但更多患者接受了輔助治療。③實驗組擁有更多EGFR突變的患者。EGFR突變是手術(shù)完全切除后的NSCLC預(yù)后良好因素[20]。本研究團隊既往研究adjuvant研究入組了IIA-IIIA期(N1-N2)EGFR19/21位點突變的非小細(xì)胞肺癌患者,手術(shù)R0切除后輔助治療方案1:1隨機分配進行EGFR抑制劑吉非替尼或長春瑞濱+順鉑化療,結(jié)果顯示靶向治療組的DFS有明顯獲益,但今年最新的隨訪結(jié)果提示DFS的獲益并沒有轉(zhuǎn)化為OS的獲益,原因可能是化療組進展后允許接受后續(xù)靶向治療[21]?傮w而言,在其

【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3247282

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