p53蛋白是一種腫瘤抑制蛋白,在人體內(nèi)有重要的功能。本文通過分子模擬研究了金屬離子Na⁺,K⁺,Ca²⁺,Mg²⁺,Zn²⁺對p53蛋白的影響。模擬結(jié)果顯示,Mg²⁺離子導(dǎo)致p53蛋白RMSD值較大,說明Mg²⁺引起蛋白質(zhì)構(gòu)象變化較大。Mg²⁺影響p53蛋白核心區(qū)域與DNA結(jié)合能力,最終會影響p53蛋白功能。 

【文章來源】：大連大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,41(03)

【文章頁數(shù)】：3 頁

【部分圖文】：

p53蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)

放入蛋白質(zhì)分子的球狀水體

圖3是分子模擬的計(jì)算結(jié)果。從圖3中可以看出,加入Mg2+后,p53蛋白質(zhì)的RMSD值要明顯比加入Na+,K+,Ca2+,Zn2+離子的值要高。這表明在Mg2+的作用下,p53蛋白質(zhì)中各原子的運(yùn)動(dòng)幅度要高于在其他離子作用下的運(yùn)動(dòng)幅度。也就是說,Mg2+引起蛋白質(zhì)構(gòu)象變化較大,而這種大的變化有可能導(dǎo)致p53蛋白的突變。圖4、圖5從不同角度顯示了分子模擬過程中，Mg2+作用下p53蛋白質(zhì)分子中各氨基酸殘基的RMSD值分布情況，其中紅色表示殘基活動(dòng)劇烈，藍(lán)色表示運(yùn)動(dòng)幅度較小，而白色則介于二者之間。從圖中可以看出，在Mg2+影響下，蛋白質(zhì)分子有幾處氨基酸殘基運(yùn)動(dòng)幅度較大，特別是圖4右方α螺旋附近區(qū)域，有氨基酸殘基運(yùn)動(dòng)劇烈。該區(qū)域是p53蛋白的核心區(qū)域，負(fù)責(zé)與DNA的結(jié)合，其氨基酸殘基運(yùn)動(dòng)幅度較大有可能增加p53蛋白質(zhì)與DNA結(jié)合概率，但是過大的運(yùn)動(dòng)幅度則該區(qū)域構(gòu)象有可能發(fā)生突變，使p53蛋白質(zhì)失去與DNA結(jié)合的能力，喪失DNA修復(fù)等功能。


本文編號：2999975