金屬離子對腫瘤抑制蛋白p53影響的分子模擬
發(fā)布時間:2021-01-25 22:07
p53蛋白是一種腫瘤抑制蛋白,在人體內有重要的功能。本文通過分子模擬研究了金屬離子Na+,K+,Ca2+,Mg2+,Zn2+對p53蛋白的影響。模擬結果顯示,Mg2+離子導致p53蛋白RMSD值較大,說明Mg2+引起蛋白質構象變化較大。Mg2+影響p53蛋白核心區(qū)域與DNA結合能力,最終會影響p53蛋白功能。
【文章來源】:大連大學學報. 2020,41(03)
【文章頁數】:3 頁
【部分圖文】:
p53蛋白質結構
放入蛋白質分子的球狀水體
圖3是分子模擬的計算結果。從圖3中可以看出,加入Mg2+后,p53蛋白質的RMSD值要明顯比加入Na+,K+,Ca2+,Zn2+離子的值要高。這表明在Mg2+的作用下,p53蛋白質中各原子的運動幅度要高于在其他離子作用下的運動幅度。也就是說,Mg2+引起蛋白質構象變化較大,而這種大的變化有可能導致p53蛋白的突變。圖4、圖5從不同角度顯示了分子模擬過程中,Mg2+作用下p53蛋白質分子中各氨基酸殘基的RMSD值分布情況,其中紅色表示殘基活動劇烈,藍色表示運動幅度較小,而白色則介于二者之間。從圖中可以看出,在Mg2+影響下,蛋白質分子有幾處氨基酸殘基運動幅度較大,特別是圖4右方α螺旋附近區(qū)域,有氨基酸殘基運動劇烈。該區(qū)域是p53蛋白的核心區(qū)域,負責與DNA的結合,其氨基酸殘基運動幅度較大有可能增加p53蛋白質與DNA結合概率,但是過大的運動幅度則該區(qū)域構象有可能發(fā)生突變,使p53蛋白質失去與DNA結合的能力,喪失DNA修復等功能。
本文編號:2999975
【文章來源】:大連大學學報. 2020,41(03)
【文章頁數】:3 頁
【部分圖文】:
p53蛋白質結構
放入蛋白質分子的球狀水體
圖3是分子模擬的計算結果。從圖3中可以看出,加入Mg2+后,p53蛋白質的RMSD值要明顯比加入Na+,K+,Ca2+,Zn2+離子的值要高。這表明在Mg2+的作用下,p53蛋白質中各原子的運動幅度要高于在其他離子作用下的運動幅度。也就是說,Mg2+引起蛋白質構象變化較大,而這種大的變化有可能導致p53蛋白的突變。圖4、圖5從不同角度顯示了分子模擬過程中,Mg2+作用下p53蛋白質分子中各氨基酸殘基的RMSD值分布情況,其中紅色表示殘基活動劇烈,藍色表示運動幅度較小,而白色則介于二者之間。從圖中可以看出,在Mg2+影響下,蛋白質分子有幾處氨基酸殘基運動幅度較大,特別是圖4右方α螺旋附近區(qū)域,有氨基酸殘基運動劇烈。該區(qū)域是p53蛋白的核心區(qū)域,負責與DNA的結合,其氨基酸殘基運動幅度較大有可能增加p53蛋白質與DNA結合概率,但是過大的運動幅度則該區(qū)域構象有可能發(fā)生突變,使p53蛋白質失去與DNA結合的能力,喪失DNA修復等功能。
本文編號:2999975
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