miR-628-3p及miR-3613-5p在胰腺導管腺癌組織中的表達及意義/早發(fā)型胰腺癌的臨床病理特征及預后分析
發(fā)布時間:2021-01-10 12:28
胰腺癌是一種惡性程度極高,預后極差的消化道惡性腫瘤,且發(fā)病率呈逐年上升趨勢。目前手術(shù)切除仍是治愈胰腺癌的首選手段。然而,由于早期缺乏特異性的臨床表現(xiàn),大多數(shù)病人發(fā)現(xiàn)時已經(jīng)喪失了手術(shù)機會,5年生存率不足5%。腫瘤標志物CA19-9及CEA是目前胰腺癌常用的診斷標志物。但是CA19-9及CEA作為胰腺癌篩查指標來說敏感性及特異性明顯不足,僅可作為疾病治療后隨診的指標。因此積極尋找胰腺癌新的標志物對于胰腺癌的早期診斷及治療具有重要的臨床價值。microRNAs(miRNA)在細胞分化,增值及凋亡方面均發(fā)揮著重要的生物學功能。雖然在人類基因組中只占3%的比例,但是miRNA可以調(diào)節(jié)20-30%的蛋白編碼基因。在包括胰腺癌在內(nèi)的多種腫瘤組織中均發(fā)現(xiàn)了 miRNA的差異表達,提示miRNA有可能成為潛在的腫瘤標志物。本研究將利用美國The Cancer Genome Atlas/TCGA數(shù)據(jù)庫篩選胰腺癌差異表達并與預后相關(guān)的miRNA,并在中國人群組織樣本中進行驗證及相關(guān)功能研究。通過分析TCGA胰腺導管腺癌數(shù)據(jù)庫中178例胰腺原位癌及4例正常胰腺組織的miRNA表達信息,共篩選出49個差異表達的...
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
TCGA數(shù)據(jù)庫中胰腺導管腺癌樣本tniRNA表達量的主成分分析結(jié)果
為DEGseq,并采用wilcox?test同步進行篩選,篩選條件為|log2(FC)??normalized|>=l?&&q-value(Benjamini)<0.001?&&wilcox.test<0.05。共發(fā)現(xiàn)49個顯著??差異表達的miRNA,其熱點圖(heatmap)如圖2所示。利用數(shù)據(jù)庫中各病例樣本的??臨床信息綜合分析上述49個差異表達的miRNA,發(fā)現(xiàn)miR-628-3p和miR-3613-5p在??胰腺導管腺癌組織中存在差異表達,且表達水平與患者預后相關(guān),目前尚無胰腺癌??中相關(guān)研宄的報道。遂選擇miR-628-3p和miR-3613-5p在中國人群胰腺癌組織樣本中??檢測其表達水平并進行相關(guān)功能研宄。??19??
圖4.RT-PCR檢測miR-628-3p及miR-3613-5p在98例胰腺癌組織及癌旁組織中的表??達情況。??3.?miRNA表達水平與胰腺癌各臨床病理因素之間的關(guān)系??
本文編號:2968706
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
TCGA數(shù)據(jù)庫中胰腺導管腺癌樣本tniRNA表達量的主成分分析結(jié)果
為DEGseq,并采用wilcox?test同步進行篩選,篩選條件為|log2(FC)??normalized|>=l?&&q-value(Benjamini)<0.001?&&wilcox.test<0.05。共發(fā)現(xiàn)49個顯著??差異表達的miRNA,其熱點圖(heatmap)如圖2所示。利用數(shù)據(jù)庫中各病例樣本的??臨床信息綜合分析上述49個差異表達的miRNA,發(fā)現(xiàn)miR-628-3p和miR-3613-5p在??胰腺導管腺癌組織中存在差異表達,且表達水平與患者預后相關(guān),目前尚無胰腺癌??中相關(guān)研宄的報道。遂選擇miR-628-3p和miR-3613-5p在中國人群胰腺癌組織樣本中??檢測其表達水平并進行相關(guān)功能研宄。??19??
圖4.RT-PCR檢測miR-628-3p及miR-3613-5p在98例胰腺癌組織及癌旁組織中的表??達情況。??3.?miRNA表達水平與胰腺癌各臨床病理因素之間的關(guān)系??
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