肝癌細胞中靶向調控Gab2蛋白的miRNA的初步研究
發(fā)布時間:2020-12-20 16:09
肝細胞癌(HCC)是全球最流行的惡性腫瘤之一,并且其高死亡率和高復發(fā)率一直是困擾臨床治療的難題。隨著對HCC發(fā)展的分子機制和治療耐藥性認識的增強,臨床研究者已經開發(fā)出許多分子靶向藥物,并成為當前抗HCC藥物研究的重點之一。這些藥物可能靶向癌癥發(fā)展中重要的一個或多個關鍵信號傳導通路,例如細胞增殖,細胞凋亡和血管生成等。銜接蛋白Gab2作為支架分子,不僅在細胞異常增殖、侵襲、遷移等病理過程中發(fā)揮重要的作用,而且在信號轉導中也扮演了重要的角色,使得其在人類癌癥的發(fā)生、發(fā)展中所發(fā)揮的作用備受關注。本實驗室過往的研究表明,Gab2在肝癌中的表達顯著高于癌旁或正常組織細胞,并且過表達Gab2的腫瘤細胞的增殖,遷移及侵襲能力常常高于相應的癌旁或正常組織細胞。肝癌細胞中Gab2的高表達現(xiàn)象是由許多因素與調控機制共同作用形成的,而microRNA的調控表現(xiàn)的至關重要,并且異常表達的microRNA作為生物標志物可以用作HCC早期診斷以及預后治療的分子靶點,因此我們對靶向調控Gab2蛋白的microRNA進行了探索。本課題利用生物信息學網(wǎng)站及軟件對可能調控Gab2的microRNA進行預測,篩選出9個mi...
【文章來源】:廈門大學福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:89 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1.?Gab2介導的細胞內信號傳導途徑??Fig.?1-1.?Gab2-mediated?intracellular?signaling?pathway??
然后按照試劑盒所述配置反轉錄體系,如下:??RNA?1?p,g??SiperMix?for?qPCR?4?jj.L??DNA?remover?1?|j.L??RNase-Water?M?20?|iL??超純水根據(jù)RNA的體積調整補齊至20?pL反應體系反復吹打混勻,再在??PCR儀中42?°C孵育30分鐘,85?°C加熱10秒終止反應。??(2)?miRNA與普通RNA的反轉錄有所不同。由于miRNA的長度太短,往往??小于qPCR引物的長度,用mRNA的反轉錄方法不利于引物結合并且容易引起??非特異性擴增,無法得到足以定量的cDNA。所以,miRNA的反轉要求將其序??列進行延長。目前常用的序列延長反轉錄法包括莖環(huán)法和polyA加尾法兩種。其??原理如圖2-1所示。??
圖2-2.重疊延伸PCP??Fig2-2.?Overlap?extension?PCP.??(1)引物F及R為原基因兩端特異引物,其中Fm及Rm為設計中間引物,且??引物Fm及Rm中間共享一段序列(至少15?bp左右堿基序列完全匹配),*為突??變點。然后分別用引物?和。抟约埃疲砗停蚁嗷ヅ鋵M行普通PCR擴增。此??夕卜,值得注意的是因為Taq酶擴增容易造成產物移碼突變,PCP擴增時最好選擇??P&酶。??(2)回收第I步所得兩條PCR產物??(3)將第2步所得兩份PCR產物進行混合使其互為模板及引物,加入dNIP、??P&酶及引物F和R進行普通PCR擴增即可獲得出定點突變的產物。??Hsa-miR-l8la的結合位點有8個連續(xù)的堿基,hsa-miR-9的結合位點有8個??連續(xù)的堿基和7個不連續(xù)的堿基,我們根據(jù)重疊延伸PCR的原理來設計引物將??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Biomarkers for the early diagnosis of hepatocellular carcinoma[J]. Nobuhiro Tsuchiya,Yu Sawada,Itaru Endo,Keigo Saito,Yasushi Uemura,Tetsuya Nakatsura. World Journal of Gastroenterology. 2015(37)
[2]Surgical treatment for liver cancer[J]. Nicole C Tsim,Adam E Frampton,Nagy A Habib,Long R Jiao. World Journal of Gastroenterology. 2010(08)
[3]Tumor vaccine against recurrence of hepatocellular carcinoma[J]. Bao-Gang Peng, Li-Jiang Liang, Qiang He, Ming Kuang, Jia-Ming Lia, Ming-De Lu, Jie-Fu Huang, Hepatobiliary Surgery Department, The First Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, Guangzhou 510080, Guangdong Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(05)
本文編號:2928158
【文章來源】:廈門大學福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:89 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1.?Gab2介導的細胞內信號傳導途徑??Fig.?1-1.?Gab2-mediated?intracellular?signaling?pathway??
然后按照試劑盒所述配置反轉錄體系,如下:??RNA?1?p,g??SiperMix?for?qPCR?4?jj.L??DNA?remover?1?|j.L??RNase-Water?M?20?|iL??超純水根據(jù)RNA的體積調整補齊至20?pL反應體系反復吹打混勻,再在??PCR儀中42?°C孵育30分鐘,85?°C加熱10秒終止反應。??(2)?miRNA與普通RNA的反轉錄有所不同。由于miRNA的長度太短,往往??小于qPCR引物的長度,用mRNA的反轉錄方法不利于引物結合并且容易引起??非特異性擴增,無法得到足以定量的cDNA。所以,miRNA的反轉要求將其序??列進行延長。目前常用的序列延長反轉錄法包括莖環(huán)法和polyA加尾法兩種。其??原理如圖2-1所示。??
圖2-2.重疊延伸PCP??Fig2-2.?Overlap?extension?PCP.??(1)引物F及R為原基因兩端特異引物,其中Fm及Rm為設計中間引物,且??引物Fm及Rm中間共享一段序列(至少15?bp左右堿基序列完全匹配),*為突??變點。然后分別用引物?和。抟约埃疲砗停蚁嗷ヅ鋵M行普通PCR擴增。此??夕卜,值得注意的是因為Taq酶擴增容易造成產物移碼突變,PCP擴增時最好選擇??P&酶。??(2)回收第I步所得兩條PCR產物??(3)將第2步所得兩份PCR產物進行混合使其互為模板及引物,加入dNIP、??P&酶及引物F和R進行普通PCR擴增即可獲得出定點突變的產物。??Hsa-miR-l8la的結合位點有8個連續(xù)的堿基,hsa-miR-9的結合位點有8個??連續(xù)的堿基和7個不連續(xù)的堿基,我們根據(jù)重疊延伸PCR的原理來設計引物將??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Biomarkers for the early diagnosis of hepatocellular carcinoma[J]. Nobuhiro Tsuchiya,Yu Sawada,Itaru Endo,Keigo Saito,Yasushi Uemura,Tetsuya Nakatsura. World Journal of Gastroenterology. 2015(37)
[2]Surgical treatment for liver cancer[J]. Nicole C Tsim,Adam E Frampton,Nagy A Habib,Long R Jiao. World Journal of Gastroenterology. 2010(08)
[3]Tumor vaccine against recurrence of hepatocellular carcinoma[J]. Bao-Gang Peng, Li-Jiang Liang, Qiang He, Ming Kuang, Jia-Ming Lia, Ming-De Lu, Jie-Fu Huang, Hepatobiliary Surgery Department, The First Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, Guangzhou 510080, Guangdong Province, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(05)
本文編號:2928158
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