長鏈非編碼RNA在肺腺癌分子診斷/預后中的應用及功能研究
發(fā)布時間:2020-12-04 13:11
研究目的和意義:自20世紀80年代起,肺癌已經(jīng)逐步成為全球范圍內(nèi)發(fā)病率及致死率最高的癌癥之一,而且發(fā)病率和致死率呈現(xiàn)逐年上升的趨勢,跟據(jù)2016年美國癌癥學會的調(diào)查統(tǒng)計數(shù)據(jù)顯示,肺癌在男性和女性患者中的平均致死率分別為27%和26%,位居惡性腫瘤致死率之首。在我國,肺癌的發(fā)病率和病死率逐年上升,已經(jīng)成為對人群健康和生命威脅最大的惡性腫瘤。近年來,隨著肺癌突變基因研究的不斷深入和大量靶向藥物的研究應用,肺癌的治療逐步向以基因為導向的個體化治療轉(zhuǎn)變。在過去,人們將肺癌個體化治療研究的重點放在編碼基因上,而隨著研究的不斷深入人們發(fā)現(xiàn)長鏈非編碼RNA(long non coding RNA,lnc RNA)在惡性腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中起著不可忽視的重要作用,同時其顯著的腫瘤組織特異性及其應用于腫瘤診斷的可能性也使其日益成為腫瘤研究中新的熱點。隨著測序技術的不斷發(fā)展,越來越多的研究者采用高通量基因組篩選技術,根據(jù)基因功能來鑒別新型肺癌。試圖在對肺癌進行有效分型的基礎上開發(fā)更精確的診斷工具,從而對肺癌進行更好的治療。本研究的目的是通過轉(zhuǎn)錄組測序技術(RNA-Seq)對不同亞型肺癌組織進行全基因組lnc...
【文章來源】:廣西醫(yī)科大學廣西壯族自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:142 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
RNA-Seq檢測到的各種基因表達值的比較(Log2FPKM值)
行聚類分析,結果均顯示肺腺癌表達的特異性(圖1-2 B),同時大部分lncRNA在肺腺癌和鱗癌或大細胞癌之間存在表達差異(圖1-2 C)。圖1-3 發(fā)現(xiàn)和識別肺腺癌潛在的lncRNA分子診斷標志物Figure 1-3 Different expressed lncRNAs in lung AD and normal lung tissues
41.圖1-5 已知肺癌相關基因PVT1和HOTAIR在3個不同RNA-Seq數(shù)據(jù)庫中的表達Figure 1-5 Representative of boxplot for two known lung cancer-associated IncRNAs, PVT1 andHOTAIR, in 3 RNA Seq data sets (p < 0.001).
【參考文獻】:
期刊論文
[1]HOTAIR:an oncogenic long non-coding RNA in different cancers[J]. Mohammadreza Hajjari,Abbas Salavaty. Cancer Biology & Medicine. 2015(01)
[2]長鏈非編碼RNA與肺癌[J]. 陳杰,朱成杰,商艷,白沖,李強. 第二軍醫(yī)大學學報. 2014(10)
[3]長鏈非編碼RNA HOTAIR在腫瘤中的研究進展[J]. 庹磊,李蘇卿,汪春梅,曹秀峰. 醫(yī)學綜述. 2014(16)
[4]長鏈非編碼RNA研究進展[J]. 楊峰,易凡,曹慧青,梁子才,杜權. 遺傳. 2014(05)
[5]長鏈非編碼RNA的作用機制及其研究方法[J]. 夏天,肖丙秀,郭俊明. 遺傳. 2013(03)
[6]MALAT1生物學功能及其與炎癥-腫瘤的關系[J]. 王俊青,任建敏,張彥潔,許春娣,劉炳亞,朱正綱,周同. 生命科學. 2012(10)
[7]肺癌侵襲和轉(zhuǎn)移的分子機制及其調(diào)控的研究進展[J]. 車國衛(wèi),張世雯,周清華. 中國肺癌雜志. 2001(02)
博士論文
[1]E-cadherin通過Notch信號通路介導前列腺癌耐藥的分子機制[D]. 王聞楚.廣西醫(yī)科大學 2015
[2]胰腺癌易感基因LINC00673的發(fā)現(xiàn)及其功能研究[D]. 鄭健.北京協(xié)和醫(yī)學院 2015
[3]長非編碼RNA BC032469調(diào)控胃癌細胞hTERT表達的分子機制研究[D]. 呂沐瀚.第三軍醫(yī)大學 2013
本文編號:2897667
【文章來源】:廣西醫(yī)科大學廣西壯族自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:142 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
RNA-Seq檢測到的各種基因表達值的比較(Log2FPKM值)
行聚類分析,結果均顯示肺腺癌表達的特異性(圖1-2 B),同時大部分lncRNA在肺腺癌和鱗癌或大細胞癌之間存在表達差異(圖1-2 C)。圖1-3 發(fā)現(xiàn)和識別肺腺癌潛在的lncRNA分子診斷標志物Figure 1-3 Different expressed lncRNAs in lung AD and normal lung tissues
41.圖1-5 已知肺癌相關基因PVT1和HOTAIR在3個不同RNA-Seq數(shù)據(jù)庫中的表達Figure 1-5 Representative of boxplot for two known lung cancer-associated IncRNAs, PVT1 andHOTAIR, in 3 RNA Seq data sets (p < 0.001).
【參考文獻】:
期刊論文
[1]HOTAIR:an oncogenic long non-coding RNA in different cancers[J]. Mohammadreza Hajjari,Abbas Salavaty. Cancer Biology & Medicine. 2015(01)
[2]長鏈非編碼RNA與肺癌[J]. 陳杰,朱成杰,商艷,白沖,李強. 第二軍醫(yī)大學學報. 2014(10)
[3]長鏈非編碼RNA HOTAIR在腫瘤中的研究進展[J]. 庹磊,李蘇卿,汪春梅,曹秀峰. 醫(yī)學綜述. 2014(16)
[4]長鏈非編碼RNA研究進展[J]. 楊峰,易凡,曹慧青,梁子才,杜權. 遺傳. 2014(05)
[5]長鏈非編碼RNA的作用機制及其研究方法[J]. 夏天,肖丙秀,郭俊明. 遺傳. 2013(03)
[6]MALAT1生物學功能及其與炎癥-腫瘤的關系[J]. 王俊青,任建敏,張彥潔,許春娣,劉炳亞,朱正綱,周同. 生命科學. 2012(10)
[7]肺癌侵襲和轉(zhuǎn)移的分子機制及其調(diào)控的研究進展[J]. 車國衛(wèi),張世雯,周清華. 中國肺癌雜志. 2001(02)
博士論文
[1]E-cadherin通過Notch信號通路介導前列腺癌耐藥的分子機制[D]. 王聞楚.廣西醫(yī)科大學 2015
[2]胰腺癌易感基因LINC00673的發(fā)現(xiàn)及其功能研究[D]. 鄭健.北京協(xié)和醫(yī)學院 2015
[3]長非編碼RNA BC032469調(diào)控胃癌細胞hTERT表達的分子機制研究[D]. 呂沐瀚.第三軍醫(yī)大學 2013
本文編號:2897667
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