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基于適體觸發(fā)原位滾環(huán)擴增的體液稀有腫瘤細胞檢測新方法

發(fā)布時間:2020-09-10 21:30
   體液標(biāo)本中播散腫瘤細胞的檢測作為一種相對無創(chuàng)的液體活檢方式已廣泛用于腫瘤的早期診斷、治療指導(dǎo)、復(fù)發(fā)與轉(zhuǎn)移評估,對腫瘤的個體化治療及預(yù)后評估等具有重要臨床意義。尤其是對于一些難以耐受活檢等侵入式檢查和難以獲得腫瘤組織標(biāo)本的患者,該檢查顯得尤為重要。目前,播散腫瘤細胞檢測面臨最大的挑戰(zhàn)是其在外周血和體液中的含量非常低,現(xiàn)有方法無法實現(xiàn)靈敏檢測。因此,本課題設(shè)計了基于適體識別靶細胞并觸發(fā)細胞表面原位滾環(huán)擴增的新方法用于體液中稀有腫瘤細胞的高靈敏檢測。本課題以乳腺癌細胞MCF-7為模式檢測對象,設(shè)計一條上皮細胞黏附分子(EpCAM)適體-引物復(fù)合探針,其中適體部分作為識別元件特異地識別結(jié)合EpCAM陽性腫瘤細胞,隨后引物部分可觸發(fā)細胞表面原位滾環(huán)擴增,產(chǎn)生大量富含鳥嘌呤的G四聯(lián)體序列。G-四聯(lián)體/hemin DNA酶折疊形成后可以催化比色反應(yīng)實現(xiàn)腫瘤細胞的檢測。在混有不同濃度靶細胞的懸液(細胞總數(shù)為105個)中,本方法得到的最低檢測限為10個腫瘤細胞,即低至0.01%的靶細胞仍可被檢出。針對10例臨床體液標(biāo)本檢測(包括5例良性體液標(biāo)本和5例不同來源的惡性體液標(biāo)本),該方法展示了良好的特異性和臨床適用性。本文建立的基于適體識別靶細胞觸發(fā)表面滾環(huán)擴增的腫瘤細胞檢測新方法具有簡單快速、靈敏度高、特異性好的優(yōu)點;并成功用于臨床體液標(biāo)本中稀有腫瘤細胞的檢測。該方法為外周血或體液中稀有腫瘤細胞的檢測提供了新的技術(shù)支持,具有廣闊的臨床應(yīng)用前景。
【學(xué)位單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R730.43
【部分圖文】:

序列,鎖式探針,條帶,引物


為了進一步驗證RCA產(chǎn)物與Hemin結(jié)合后可以催化ABTS-H202系統(tǒng),我們逡逑通過紫外分光度計測量400邋rnn到500邋nm波長的吸光度變化,取418邋nm處的吸光逡逑度測量值為結(jié)果,可看到有一個明顯的特征峰(圖2B),說明基于適體觸發(fā)RCA逡逑產(chǎn)物中的G-四聯(lián)體序列與Hemin結(jié)合后形成了邋G-四聯(lián)體/hemin邋DNA酶,催化底逡逑物發(fā)生比色反應(yīng)使吸光度產(chǎn)生變化。與此同時,我們也測量了空白與沒有加入APP逡逑只有純化環(huán)狀模板參與的RCA產(chǎn)物的吸光度值,結(jié)果顯示波長418邋nm處幾乎沒逡逑有明顯的特征峰,進一步的證明了環(huán)狀模板已經(jīng)成功被純化,在沒有引物存在的逡逑情況下自身不會發(fā)生RCA反應(yīng)無背景信號產(chǎn)生,而且結(jié)果同時還證明了游離的逡逑Hemin不會催化ABTS-H202系統(tǒng)產(chǎn)生背景信號。所以,在后續(xù)的細胞實驗中離心逡逑后不需要去除游離的Hemin。逡逑Ml邋2邐3邐4邐5邐^逡逑A邐B逡逑,A逡逑m邋42a邐44?邐m逡逑).(nm)逡逑圖2邋(A)聚丙烯酰胺凝膠電泳表征圖:(條帶1)引物探針

實驗條件優(yōu)化,吸光度,細胞,反應(yīng)時間


為了實現(xiàn)最優(yōu)的檢測性能,我們對幾個實驗條件進行了優(yōu)化。首先,多功能逡逑的APP含有觸發(fā)RCA的引物部分,對結(jié)果有重要的影響意義。因此,APP與細逡逑胞懸液的反應(yīng)時間首先被優(yōu)化[17]。如圖4A所示,吸光度信號隨著APP反應(yīng)的時逡逑間增加而上升,在反應(yīng)40分鐘時達到最大值,所以40分鐘被選為最佳的反應(yīng)時逡逑間。另外,RCA的時間也是一個重要參數(shù)[36]。依據(jù)圖4B所示,吸光度信號隨著逡逑RCA反應(yīng)時間增加而上升,在反應(yīng)40分鐘后達到最大值。但繼續(xù)延長反應(yīng)時間并逡逑沒有使信號增加反而使信號降低,這可能是因為延長反應(yīng)時間使RCA產(chǎn)物分子量逡逑太大而從細胞表面脫離。因此,我們選擇40分鐘作為最佳反應(yīng)時間。為了提高檢逡逑測效率,我們同樣分析了邋Hemin濃度的影響,發(fā)現(xiàn)在1.4邋mM時達到最大值。逡逑A邐B邋|邋0]邐C邋u逡逑。海海。海哄澹剩。殄义希保斑姡玻板澹礤澹矗斑?邐10邐20邐3?邐441邐50邐U邋*?*邐1(4逡逑Incubttion邋Tim?邋(ntin)邐RCA邋Time邋(m邋In)邐Concentration邋of邋hernia邋(pM)逡逑圖4實驗條件優(yōu)化:所有的吸光度均在105個MCF-7細胞下測定。(A)邋APP反應(yīng)時間,(B)逡逑RCA反應(yīng)時間

比色分析,誤差棒,校準曲線,白細胞


為了模擬真實的惡性體液樣本,我們把不同數(shù)量的MCF-7細胞混入正常的白逡逑細胞中保證細胞總數(shù)為105個[37]。在上述最優(yōu)的實驗條件下,吸光度隨著MCF-7逡逑靶細胞數(shù)量的增加而增加(圖5A)。MCF-7靶細胞數(shù)量的對數(shù)從10到30000個細逡逑胞之間與其吸光度信號與有著較好的線性關(guān)系,相關(guān)系數(shù)為0.997邋(圖5B)。最低逡逑檢測線可達10個靶細胞/mL,相當(dāng)于在總數(shù)為105個細胞混合液中可檢測到0.01%逡逑MCF-7細胞,展示了本策略良好的檢測低豐度腫瘤細胞的分析性能。相比于之前逡逑報道的比色分析和基于適體標(biāo)記納米粒子[23,24]和適體修飾傳感器表面[37,22,38]檢測逡逑腫瘤細胞的方法,本方案有著更優(yōu)或相當(dāng)?shù)撵`敏度(表2)。這是因為本方法結(jié)合逡逑了邋EpCAM適體的高特異性和細胞表面RCA反應(yīng)的氋效信號擴增能力以及G-四聯(lián)逡逑體/heminDNA酶的高催化能力。與之前報道過檢測腫瘤細胞生物傳感方法最不同逡逑的一點是,本方法良好的分析性能是通過模擬真實臨床標(biāo)本將低豐度腫瘤細胞混逡逑入大量的正常白細胞中得到的,而不是簡單的檢測純的腫瘤細胞。逡逑(j邋B逡逑i.a-邐|逡逑I邐\邐S邋t逡逑^〔二 邐邐:邋0_丨_邋■逡逑 ̄^ ̄m ̄Z ̄Z ̄邐"邋?邐Z1邋 ̄^ ̄^ ̄rai7逡逑Number邋of邋>1CF-7逡逑圖5邋(A)紫外吸收光譜圖

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本文編號:2816357

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