目的:目前醫(yī)學認為,癌癥的發(fā)生和發(fā)展是一個復雜的過程,是遺傳因素和環(huán)境因素及其相互作用產(chǎn)生的結(jié)果。含pa t a t in樣磷脂酶域3(pa t a t in-l ike phospholipase domain containing 3,PNPLA3)基因的作用是編碼一個在肝細胞膜表達的跨膜蛋白,該蛋白具有調(diào)節(jié)脂質(zhì)代謝、炎癥介質(zhì)等作用,研究發(fā)現(xiàn)該基因與肝臟炎癥、肝纖維化進展有關(guān),其位點rs738409與肝細胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)發(fā)生的相關(guān)性越來越受到重視。6號跨膜超家族2號(transmembrane 6 superfamily member 2,TM6SF2)基因主要編碼跨膜蛋白,負責肝臟脂質(zhì)代謝。一項研究表明其位點rs58542926影響非酒精性脂肪肝患者的肝纖維化程度,與肝硬化的發(fā)生有關(guān)。目前對TM6SF2基因與HCC關(guān)系的相關(guān)研究很少。因此本研究的遺傳因素選擇以上2個基因的rs738409、rs58542926位點。吸煙與飲酒是很多疾病的危險因素,對肝臟疾病的危害更是不容忽視,本研究選擇吸煙、飲酒作為環(huán)境因素。分析遺傳因素、環(huán)境因素與乙肝病毒相關(guān)性肝癌(hepatitis B virus hepato-cellular carcinoma,HBV-HCC)的關(guān)聯(lián),以及與乙肝病毒慢性感染不同結(jié)局的關(guān)系,并探討兩個基因之間及與吸煙、飲酒的交互作用與HBV-HCC的關(guān)聯(lián)性。方法:1候選基因的選取。利用NCBI搜索關(guān)鍵詞:single nucleotide polymorphism(單核苷酸多態(tài)性,SNP)hepatocellular carcinoma,從得到的文獻中,對2014年后的相關(guān)英文文獻進行查閱,得到相關(guān)候選基因PNPLA3、TM6SF2。在Hapmap(http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/index.html.en)項目數(shù)據(jù)庫以及Pubmed SNP數(shù)據(jù)庫檢索PNPLA3、TM6SF2基因的位點信息,人種選擇CHB(中國漢族人群Han Chinese in Beijing,China)。將從Hap Map數(shù)據(jù)庫中下載的PNPLA3基因SNP信息導入Haploview 4.2軟件,利用Haploview4.2軟件對位點進行篩選,選擇MAF(Minor Allele Frequency,最小等位基因頻率)10%,r2(連鎖不平衡系數(shù))0.8,D’(連鎖不平衡程度隨距離而改變的程度)=1的位點,并在Pubmed SNP數(shù)據(jù)庫檢索TM6SF2基因的位點信息,結(jié)合文獻資料,最終選定PNPLA3rs738409位點與TM6SF2rs58542926位點。2樣本收集選擇石家莊市四所三甲醫(yī)院,共納入2161人,其中慢性乙肝患者(Chronic hepatitis B,CHB)691人,肝硬化患者(Liver cirrhosis,LC)680人,乙肝病毒相關(guān)性肝癌患者(hepatitis B virus hepatocellular carcinoma,HBV-HCC)420人,健康體檢者370人,同時獲得研究對象的基線資料及臨床檢查結(jié)果。3基因分型從外周血中提取DNA,運用美國SEQUENOM公司Mass Array時間飛行質(zhì)譜技術(shù)進行基因分型,檢測候選基因PNPLA3、TM6SF2的兩個SNP位點(rs738409、rs58542926)的多態(tài)性。PNPLA3rs738409的基因多態(tài)性為CC、CG、GG,TM6SF2rs58542926的基因多態(tài)性為CC、CT、TT。4統(tǒng)計學處理應(yīng)用Epidata3.1軟件建立數(shù)據(jù)庫,在線SNP stats尋找基因多態(tài)性的最優(yōu)賦值方法,SPSS20.0與SAS9.1進行數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析;采用擬合優(yōu)度的χ~2檢驗進行哈代-溫伯格(Hardy-Weinberg,H-W)平衡檢驗;采用多分類非條件logistic回歸分析對疾病的相關(guān)基因多態(tài)性及吸煙與飲酒進行篩選,采用二分類logistic回歸分析、叉生分析探討基因-基因、基因-環(huán)境交互作用。二分類logistic回歸入α=0.05,出α=0.10,H-W平衡檢驗α=0.10,其余α=0.05。結(jié)果:1一般情況健康組男性205人,女性165人;CHB組男性466人,女性225人;LC組男性470人,女性210人;HBV-HCC組男性326人,女性94人。進行χ~2檢驗,χ~2=45.223,P0.001,四組性別構(gòu)成差異有統(tǒng)計學意義。CHB組和LC組在性別構(gòu)成上差異無統(tǒng)計學意義(P=0.504),其它任何兩組在性別構(gòu)成上差異均有統(tǒng)計學意義。健康組、CHB、LC、HBV-HCC組男性構(gòu)成比呈線性上升趨勢(χ~2=42.910,P0.001)。健康組年齡中位數(shù)為47歲,四分位間距22歲;CHB組分別為39歲和20歲。LC組為52歲和14歲;HBV-HCC組為57歲和12歲。K-W H檢驗,χ~2=491.55,P0.001,四組人群平均年齡差異有統(tǒng)計學意義。四組間進行兩兩比較,LC組和HBV-HCC組平均年齡差異沒有統(tǒng)計學意義,其余任兩組之間平均年齡差異均有統(tǒng)計學意義;2 H-W平衡檢驗健康者組rs738409、rs58542926位點的基因型頻率分布均符合H-W平衡定律,χ~2值分別為1.402、1.546,P值均大于0.10。CHB組rs738409位點的基因型頻率分布不符合H-W平衡定律,χ~2=11.980,P0.005。除此以外,其他組兩位點均符合H-W平衡檢驗;3在線模型篩選分析LC+CHB組與HBV-HCC組,rs58542926選擇共顯性模型,賦值為CC=1,CT=2,TT=3。rs738409按有無突變進行賦值,CC=0,CG/GG=1;4無序多分類logistic回歸分析4.1以健康組作為對照:CHB組:年齡每增加1歲,OR=0.951,95%CI(0.941,0.961),P0.001;男性與女性相比,OR=1.679,95%CI(1.241,2.273),P0.001。LC組:年齡每增加1歲,OR=1.034,95%CI(1.022,1.045),P0.001;男性與女性相比,OR=2.278,95%CI(1.684,3.082),P0.001。HBV-HCC組:年齡每增加1歲,OR=1.076,95%CI(1.062,1.091),P0.001;男性與女性相比,OR=3.002,95%CI(2.080,4.331),P0.001;rs58542926每突變一個位點,OR=1.659,95%CI(1.026,2.684),P=0.039。4.2以CHB組作為對照:LC組:年齡每增加1歲,OR=1.087,95%CI(1.076,1.098),P0.001;男性與女性相比,OR=1.356,95%CI(1.029,1.789),P0.001;rs738409CG/GG與CC相比,OR=0.751,95%CI(0.589,0.956),P=0.020。HBV-HCC組:年齡每增加1歲,OR=1.132,95%CI(1.117,1.147),P0.001;男性與女性相比,OR=1.787,95%CI(1.257,2.542),P=0.001;飲酒與不飲酒相比,OR=1.680,95%CI(1.121,2.519),P=0.012。4.3以LC組作為對照:HBV-HCC組:年齡每增加1歲,OR=1.041,95%CI(1.029,1.054),P0.001;飲酒與不飲酒相比,OR=1.539,95%CI(1.071,2.213),P=0.020;吸煙與不吸煙相比,OR=1.453,95%CI(1.005,2.099),P=0.047。5交互作用分析健康者組和HBV-HCC組比較,未發(fā)現(xiàn)基因-基因、基因-環(huán)境、環(huán)境間的相加交互作用。LC+CHB組和HBV-HCC組比較:rs738409與rs58542926存在交互作用,為負交互相加模型,P=0.017。結(jié)論:1 CHB、LC、HBV-HCC三組,男性構(gòu)成比逐漸增大,平均年齡也逐漸增大。2 rs58542926的T突變是HBV-HCC的危險因素,rs738409的G突變是LC的保護因素。CHB為對照,飲酒可能是HBV-HCC的危險因素。以LC為對照,吸煙、飲酒可能是HBV-HCC的危險因素。3乙肝病毒慢性感染后,rs738409與rs58542926都突變時,可能是HBV-HCC的危險因素。
【學位單位】：河北醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2016
【中圖分類】：R512.62;R735.7
【部分圖文】：

+LC組與HBV-HCC組比較，rs738409與rs58542926兩位點相型交互作用38409 and rs58542926 additive model interaction between CHgroup and HBV-HCC group

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3 李瀟;;乙肝病毒整合與肝癌的關(guān)系[J];生命的化學(中國生物化學會通訊);1990年03期

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8 李冬陽;林連捷;鄭長青;;PNPLA3基因在非酒精性脂肪性肝病中的作用[J];世界華人消化雜志;2011年17期

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1 ;乙肝病毒變異位點及與肝癌關(guān)系研究進展[A];2012年浙江省醫(yī)學會肝病、感染病學學術(shù)年會暨浙江省感染科醫(yī)師學術(shù)年會論文集[C];2012年

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4 肖絢;胡tD;邵世煌;;基于粗�；詣訖C的乙肝病毒動力學建模[A];第二十七屆中國控制會議論文集[C];2008年

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本文編號：2814850