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RNF43點(diǎn)突變?cè)谀懩野┌l(fā)生發(fā)展中的作用及分子機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2020-08-12 05:53
【摘要】:研究背景及目的膽囊癌在消化道惡性腫瘤中發(fā)病率排名第6位,其預(yù)后極差,死亡率接近發(fā)病率。膽囊癌早期缺乏特異性臨床表現(xiàn),如今根治性手術(shù)切除是唯一的治愈手段,但術(shù)后易出現(xiàn)復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移;蛲蛔?cè)谀[瘤發(fā)生過程中發(fā)揮著重要作用,而對(duì)于腫瘤驅(qū)動(dòng)基因的研究不僅揭示腫瘤發(fā)生的原因,更重要的是可以以此為切入點(diǎn),探索治療方式。環(huán)指蛋白43(Ring finger protein 43,RNF43)作為Wnt信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的抑制因子,在個(gè)體發(fā)育、細(xì)胞增殖分化等方便發(fā)揮重要調(diào)控作用。RNF43在膽囊癌中存在較高的突變頻率,與膽囊癌的發(fā)生具有密切關(guān)系,值得進(jìn)一步研究。方法1.通過TOPflash/FOPflash雙熒光素酶報(bào)告基因系統(tǒng)實(shí)驗(yàn)及qPCR檢測(cè)Wnt通路下游靶基因轉(zhuǎn)錄變化,明確RNF43對(duì)Wnt通路的抑制作用,確定Y332*點(diǎn)突變對(duì)RNF43功能的影響。2.體外細(xì)胞學(xué)實(shí)驗(yàn)探究RNF43及其突變體Y332*對(duì)膽囊癌細(xì)胞增殖、侵襲能力的影響。3.結(jié)合蛋白交聯(lián)、串聯(lián)親和純化及串聯(lián)質(zhì)譜,確定RNF43的相互作用蛋白,并通過CO-IP驗(yàn)證RNF43點(diǎn)突變Y332*對(duì)蛋白互作的影響。4.通過Real-Time qPCR檢測(cè)40例膽囊癌患者癌與癌旁組織中RNF43表達(dá)情況,并與患者預(yù)后及臨床病理信息進(jìn)行綜合分析,探究RNF43的功能變化與膽囊癌發(fā)生發(fā)展及預(yù)后轉(zhuǎn)歸的關(guān)系。結(jié)果1.RNF43在膽囊癌細(xì)胞中對(duì)Wnt信號(hào)通路具有抑制作用;2.RNF43截短突變Y332*對(duì)Wnt信號(hào)通路的抑制作用部分缺失,可能和其DVL結(jié)合結(jié)構(gòu)域缺失有關(guān);3.體外細(xì)胞學(xué)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),RNF43及點(diǎn)突變Y332*對(duì)膽囊癌細(xì)胞系的增殖遷移功能沒有明顯影響;4.發(fā)現(xiàn)RNF43能與蛋白PRMT5相互作用,而Y332*突變可削弱二者的結(jié)合能力;5.通過膽囊癌mRNA差異表達(dá)檢測(cè)發(fā)現(xiàn)RNF43表達(dá)在癌與癌旁組織中差異不顯著;6.RNF43的表達(dá)水平與膽囊癌的發(fā)展及患者的預(yù)后無明顯相關(guān)性。結(jié)論雖然本研究結(jié)果未見RNF43與膽囊癌的發(fā)展具有相關(guān)性,但仍不能排除RNF43的功能缺失在膽囊上皮惡變過程中的作用。
【學(xué)位授予單位】:上海交通大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R735.8
【圖文】:

真核表達(dá)載體,圖譜


上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文2.2.2.2 瓊脂糖凝膠配制及 PCR 產(chǎn)物電泳稱取 0.3 g 瓊脂糖粉末,加入 30 ml 1×TAE 緩沖液中,混勻后放入微波爐中高火加熱 30 秒,反復(fù) 3 次,確定瓊脂糖充分溶解后取出。室溫冷卻至 50℃左右,加入 3 μl GEL-RED 染液,充分混勻后倒入模具,插上合適寬度的齒梳,室溫冷卻 30 分鐘。PCR 產(chǎn)物中加入 6×DNA Loading Buffer 至 1×濃度,混勻后加入凝膠的上樣孔中。在 1×TAE 緩沖液中,120V 恒壓電泳 30 分鐘。結(jié)束電泳后在紫外切膠儀下切下目的條帶,置入 1.5ml effendorf 管中。2.2.2.3 凝膠內(nèi) DNA 回收將凝膠用槍頭搗碎后稱重,加入凝膠 3 倍體積的 buffer A(100 mg=100 μl),置于 70℃金屬浴中加熱 6-8 分鐘,直至凝膠充分溶解。每 2 分鐘顛倒震蕩一次EP 管。加入 buffer A 體積一般的 buffer B,確保溶液顏色完全由紅變黃。將溶液轉(zhuǎn)移至吸附柱中,14000 g 室溫離心 30 秒,棄去收集管內(nèi)的液體。加入 500 μlPW1,14000 g 室溫離心 30 秒。再加入 700 μl PW2,14000g 室溫離心 30 秒。重復(fù) 1 次后,吸附柱空轉(zhuǎn)離心 1 分鐘,以保證 PW2 中的乙醇徹底除去。加入 25 μlElution Buffer,室溫靜置 1 分鐘后,14000 g 離心 1 分鐘。收集洗脫液,用 NanoDrop 2000 測(cè)定 DNA 濃度及純度。2.2.2.4 質(zhì)粒載體及 PCR 產(chǎn)物雙酶切

免疫熒光,標(biāo)尺


上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文將 20 μl 裂解液加入 96 孔板中,上機(jī)檢測(cè)。螢火蟲熒光素酶底物每孔加入 50 μl,檢測(cè)后再加入反應(yīng)終止液和海腎熒光素酶底物。繼續(xù)檢測(cè)。海腎熒光值矯正各孔螢火蟲熒光值后,用同一處理的 TOPflash 組與 Fopflash 組的螢火蟲熒光的比值表示 Wnt 通路激活程度。3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果3.1 RNF43 及 Y332*突變質(zhì)粒構(gòu)建及表達(dá)效率驗(yàn)證我們?yōu)檠芯?RNF43 蛋白及 Y332*突變的結(jié)構(gòu)及功能,首先構(gòu)建了相應(yīng)的過表達(dá)質(zhì)粒。并通過免疫熒光及 WB 驗(yàn)證質(zhì)粒在膽囊癌細(xì)胞系 GBC-SD 中的表達(dá)情況。結(jié)果顯示,RNF43 及截短突變?cè)诩?xì)胞內(nèi)成功過表達(dá),且均主要分布于細(xì)胞胞膜及胞漿中(圖 2)。而 WB 實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn) RNF43 及突變體存在較多降解條帶,可能是在細(xì)胞中發(fā)生內(nèi)源性降解(圖 3)。考慮到負(fù)反饋調(diào)控的實(shí)時(shí)性,即 Wnt 通路激活程度較低時(shí),體內(nèi) RNF43 本身的穩(wěn)定性可能較低,易發(fā)生 RNF43 蛋白降解所致。RNF43 Y332*由于截短突變導(dǎo)致蛋白肽鏈長度縮短,故分子量變小(圖 3)。

過表達(dá),條帶,細(xì)胞系,激活水平


圖 3. GBC-SD 中過表達(dá) RNF43 及 Y332*突變的 WB 條帶3. The WB bands of RNF43 and Y332* mutant which overexpressed in GB表達(dá)水平及突變?cè)谀懩野┘?xì)胞系中的情況合適的實(shí)驗(yàn)細(xì)胞系,我們對(duì) 5 株膽囊癌細(xì)胞系進(jìn)行 RNF43 編碼果發(fā)現(xiàn),5 株膽囊癌細(xì)胞系均含有 RNF43 點(diǎn)突變,但并未發(fā)現(xiàn)變均屬于但單核苷酸多態(tài)性。其中細(xì)胞系 NOZ 突變較少。同量 PCR(real time qPCR)檢測(cè)了 5 株膽囊癌細(xì)胞系中 RNF4 信號(hào)通路的激活水平。結(jié)果顯示,NOZ 細(xì)胞中 RNF43 表達(dá)水平時(shí),Wnt 通路中下游調(diào)控基因 AXIN2、MYC 在 NOZ 細(xì)胞中亦有見 Wnt 通路在 NOZ 細(xì)胞中激活水平較其它細(xì)胞株高。因此我們胞系進(jìn)行進(jìn)一步研究。表 1:膽囊癌細(xì)胞系 RNF43 編碼區(qū)點(diǎn)突變情況細(xì)胞系 突變GBC-SD c.a139g c.c1252aNOZ c.g350aSGC996 c.c1854g(雜合)OCUG c.a139g c.c1252a

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