RNF43點突變在膽囊癌發(fā)生發(fā)展中的作用及分子機制
【學(xué)位授予單位】:上海交通大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R735.8
【圖文】:
上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文2.2.2.2 瓊脂糖凝膠配制及 PCR 產(chǎn)物電泳稱取 0.3 g 瓊脂糖粉末,加入 30 ml 1×TAE 緩沖液中,混勻后放入微波爐中高火加熱 30 秒,反復(fù) 3 次,確定瓊脂糖充分溶解后取出。室溫冷卻至 50℃左右,加入 3 μl GEL-RED 染液,充分混勻后倒入模具,插上合適寬度的齒梳,室溫冷卻 30 分鐘。PCR 產(chǎn)物中加入 6×DNA Loading Buffer 至 1×濃度,混勻后加入凝膠的上樣孔中。在 1×TAE 緩沖液中,120V 恒壓電泳 30 分鐘。結(jié)束電泳后在紫外切膠儀下切下目的條帶,置入 1.5ml effendorf 管中。2.2.2.3 凝膠內(nèi) DNA 回收將凝膠用槍頭搗碎后稱重,加入凝膠 3 倍體積的 buffer A(100 mg=100 μl),置于 70℃金屬浴中加熱 6-8 分鐘,直至凝膠充分溶解。每 2 分鐘顛倒震蕩一次EP 管。加入 buffer A 體積一般的 buffer B,確保溶液顏色完全由紅變黃。將溶液轉(zhuǎn)移至吸附柱中,14000 g 室溫離心 30 秒,棄去收集管內(nèi)的液體。加入 500 μlPW1,14000 g 室溫離心 30 秒。再加入 700 μl PW2,14000g 室溫離心 30 秒。重復(fù) 1 次后,吸附柱空轉(zhuǎn)離心 1 分鐘,以保證 PW2 中的乙醇徹底除去。加入 25 μlElution Buffer,室溫靜置 1 分鐘后,14000 g 離心 1 分鐘。收集洗脫液,用 NanoDrop 2000 測定 DNA 濃度及純度。2.2.2.4 質(zhì)粒載體及 PCR 產(chǎn)物雙酶切
上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文將 20 μl 裂解液加入 96 孔板中,上機檢測。螢火蟲熒光素酶底物每孔加入 50 μl,檢測后再加入反應(yīng)終止液和海腎熒光素酶底物。繼續(xù)檢測。海腎熒光值矯正各孔螢火蟲熒光值后,用同一處理的 TOPflash 組與 Fopflash 組的螢火蟲熒光的比值表示 Wnt 通路激活程度。3 實驗結(jié)果3.1 RNF43 及 Y332*突變質(zhì)粒構(gòu)建及表達效率驗證我們?yōu)檠芯?RNF43 蛋白及 Y332*突變的結(jié)構(gòu)及功能,首先構(gòu)建了相應(yīng)的過表達質(zhì)粒。并通過免疫熒光及 WB 驗證質(zhì)粒在膽囊癌細胞系 GBC-SD 中的表達情況。結(jié)果顯示,RNF43 及截短突變在細胞內(nèi)成功過表達,且均主要分布于細胞胞膜及胞漿中(圖 2)。而 WB 實驗發(fā)現(xiàn) RNF43 及突變體存在較多降解條帶,可能是在細胞中發(fā)生內(nèi)源性降解(圖 3)。考慮到負反饋調(diào)控的實時性,即 Wnt 通路激活程度較低時,體內(nèi) RNF43 本身的穩(wěn)定性可能較低,易發(fā)生 RNF43 蛋白降解所致。RNF43 Y332*由于截短突變導(dǎo)致蛋白肽鏈長度縮短,故分子量變小(圖 3)。
圖 3. GBC-SD 中過表達 RNF43 及 Y332*突變的 WB 條帶3. The WB bands of RNF43 and Y332* mutant which overexpressed in GB表達水平及突變在膽囊癌細胞系中的情況合適的實驗細胞系,我們對 5 株膽囊癌細胞系進行 RNF43 編碼果發(fā)現(xiàn),5 株膽囊癌細胞系均含有 RNF43 點突變,但并未發(fā)現(xiàn)變均屬于但單核苷酸多態(tài)性。其中細胞系 NOZ 突變較少。同量 PCR(real time qPCR)檢測了 5 株膽囊癌細胞系中 RNF4 信號通路的激活水平。結(jié)果顯示,NOZ 細胞中 RNF43 表達水平時,Wnt 通路中下游調(diào)控基因 AXIN2、MYC 在 NOZ 細胞中亦有見 Wnt 通路在 NOZ 細胞中激活水平較其它細胞株高。因此我們胞系進行進一步研究。表 1:膽囊癌細胞系 RNF43 編碼區(qū)點突變情況細胞系 突變GBC-SD c.a139g c.c1252aNOZ c.g350aSGC996 c.c1854g(雜合)OCUG c.a139g c.c1252a
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