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口腔癌發(fā)病風(fēng)險預(yù)測模型構(gòu)建及相關(guān)長鏈非編碼RNA的篩選和驗證

發(fā)布時間:2020-07-15 18:51
【摘要】:目的探討口腔癌發(fā)病的環(huán)境影響因素,構(gòu)建口腔癌發(fā)病風(fēng)險預(yù)測模型;篩選口腔癌組織和癌旁組織中差異表達的長鏈非編碼RNA,擴大樣本驗證并進行體外細胞功能學(xué)實驗的機制研究。方法1.采用病例對照研究設(shè)計,面訪調(diào)查1012例口腔癌新發(fā)病例和3087例健康對照,收集研究對象的飲食和生活方式等環(huán)境暴露資料。采用非條件Logistic回歸模型方法評估環(huán)境因素對口腔癌發(fā)病風(fēng)險的調(diào)整比值比及其95%的可信區(qū)間。2.根據(jù)多因素Logistic回歸篩選出的口腔癌獨立影響因素,基于OR值、β系數(shù)及nomogram方法構(gòu)建三種口腔癌發(fā)病風(fēng)險預(yù)測模型,利用ROC曲線下面積評估預(yù)測模型的預(yù)測效能。3.利用Agilent Human lncRNA 4×180K基因芯片技術(shù)篩選3對口腔癌組織和癌旁組織中表達差異的lncRNAs,采用qRT-PCR方法在81對口腔癌和癌旁組織中驗證其中5條lncRNAs的表達水平。采用t檢驗或Wilcoxon秩和檢驗、χ~2檢驗分析兩組間的差異及與患者腫瘤病理特征的關(guān)聯(lián)。4.構(gòu)建lncRNA ENST00000470447.1過表達重組質(zhì)粒和空白對照質(zhì)粒,通過CCK-8、Transewell、細胞劃痕以及流式細胞術(shù)等實驗探討lncRNA ENST00000470447.1過表達對舌鱗癌細胞Tca-8113增殖、遷移、侵襲和調(diào)亡能力的影響。結(jié)果1.吸煙、飲酒、中重度烹飪油煙、高口腔衛(wèi)生指數(shù)(不良口腔衛(wèi)生狀況)是口腔癌發(fā)病的危險因素。飲茶、較高頻率攝入魚類、其他海鮮、新鮮蔬菜水果和蛋類可降低口腔癌的發(fā)病風(fēng)險。2.根據(jù)nomogram構(gòu)建的口腔癌發(fā)病風(fēng)險預(yù)測模型表現(xiàn)出最佳的預(yù)測效能(AUC=0.721,95%CI:0.702~0.739),且該預(yù)測模型的分值與口腔癌的關(guān)聯(lián)強度呈非線性劑量-反應(yīng)關(guān)系。Nomogram預(yù)測模型分值與腫瘤家族史之間存在相乘及相加交互作用(OR_(相乘)=2.83,95%CI:2.20~3.64)。3.通過lncRNA表達譜芯片檢測發(fā)現(xiàn)口腔癌與癌旁組織之間差異表達的lncRNAs,總共2617條,約占總lncRNA的8.97%(2617/29187):其中上調(diào)280條,下調(diào)2337條。4.ENST00000470447.1、ENST00000412353.1和ENST00000506106.1在口腔癌組織中的相對表達水平均低于配對癌旁組織,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.001),且驗證結(jié)果與芯片檢測結(jié)果的表達方向一致。5.ENST00000470447.1表達水平與口腔癌患者的病理類型和分化程度相關(guān)(P0.05),ENST00000506106.1的表達與患者的病理類型和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)(P0.05)。6.體外細胞實驗結(jié)果顯示:與空白對照質(zhì)粒相比,ENST00000470447.1過表達重組質(zhì)粒可降低舌鱗癌細胞Tca-8113的存活率、遷移率和侵襲率,且細胞早期凋亡率明顯增高。結(jié)論1.吸煙、飲酒、中重度烹飪油煙和不良口腔衛(wèi)生狀況是口腔癌發(fā)病的主要危險因素。規(guī)律飲茶、多食魚類、其他海鮮、新鮮蔬菜水果和蛋類是口腔癌的保護因素。2.根據(jù)nomogram構(gòu)建的口腔癌風(fēng)險預(yù)測模型具有最佳的預(yù)測效果和應(yīng)用價值。3.ENST00000470447.1、ENST00000412353.1和ENST00000506106.1在口腔癌中表達下調(diào)。4.ENST00000470447.1和ENST00000506106.1與口腔癌患者的病理類型、分化程度和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移存在關(guān)聯(lián)。5.ENST00000470447.1過表達可抑制Tca-8113細胞的增殖、遷移和侵襲能力,促進其凋亡,在口腔癌的發(fā)生進程中發(fā)揮重要調(diào)控作用。
【學(xué)位授予單位】:福建醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R739.8
【圖文】:

列線圖,列線圖,口腔癌,預(yù)測模型


表 1.8(續(xù))變量 變量賦值變量對應(yīng)分值預(yù)測模型 1a預(yù)測模型 2b預(yù)測模型 3c水果≥3 次/周 0 0.00 0 0.00<3 次/周 1 1.34 9 9.20口腔衛(wèi)生指數(shù)0-2 0 0.00 0 0.003-5 1 1.19 8 4.306-8 2 2.26 12 8.60注:a為變量的 OR 值-1;b為變量的β值×10 后四舍五入取整;c為變量根據(jù)列線圖讀取的對應(yīng)分值。

口腔癌,預(yù)測模型,立方樣條,非線性檢驗


22圖 1.5 Nomogram 所預(yù)測與實際觀察的口腔癌發(fā)生率的校準圖3.4.2 Nomogram 預(yù)測模型與口腔癌的關(guān)系限制性立方樣條的分析表明隨著 nomogram 預(yù)測模型的分值逐漸增加,口腔癌的發(fā)病風(fēng)險也逐漸升高,呈非線性劑量-反應(yīng)關(guān)系(非線性檢驗,P<0.05),見圖 1.6。進一步根據(jù)對照組的三分位數(shù)將 nomogram 預(yù)測模型的分值劃分為<11.1,11.1~和≥19.1 三組。經(jīng)調(diào)整后結(jié)果顯示:分值為 11.1~和≥19.1 組患口腔癌的風(fēng)險分別是分值<11.1 組的 1.98 倍(95CI:1.55~2.53)和 6.81 倍

口腔癌,關(guān)聯(lián)強度,預(yù)測模型,家族史


圖 1.6 Nomogram 預(yù)測模型的分值與口腔癌關(guān)聯(lián)強度的關(guān)系表 1.8 Nomogram 預(yù)測模型與口腔癌的關(guān)系以及分層分析變量 病例 n(%) 對照 n(%) OR(95%CI) OR(95%Comogram 分值<11.1 128(12.65) 1026(33.24) 1.00 1.0011.1~ 215(21.25) 1027(33.26) 1.68(1.33~2.12) 1.98(1.55~2≥19.1 669(66.10) 1034(33.50) 5.19(4.21~6.38) 6.81(5.42~8P trend <0.001 <0.001瘤家族史mogram 分值<11.1 35(6.08) 415(32.88) 1.00 1.0011.1~ 116(20.14) 426(33.76) 1.51(1.17~1.95) 1.81(1.39~2≥19.1 425(73.78) 421(33.36) 4.80(3.84~6.00) 6.38(4.99~8P trend <0.001 <0.001瘤家族史mogram 分值<11.1 39(12.15) 390(32.75) 1.00 1.00

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前3條

1 陳法;蔡琳;何保昌;黃江峰;劉芳萍;鄢靈君;胡志堅;林李嵩;何斐;;飲茶與非吸煙、非飲酒人群口腔癌的關(guān)系研究[J];中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2015年08期

2 Mohammadreza Hajjari;Abbas Salavaty;;HOTAIR:an oncogenic long non-coding RNA in different cancers[J];Cancer Biology & Medicine;2015年01期

3 Shao-Kai Zhang;Rongshou Zheng;Qiong Chen;Siwei Zhang;Xibin Sun;Wanqing Chen;;Oral cancer incidence and mortality in China, 2011[J];Chinese Journal of Cancer Research;2015年01期



本文編號:2756877

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