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MDM4單核苷酸多態(tài)性與急性髓系白血病相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-30 07:59
【摘要】:目的:1.研究MDM4基因12個(gè)SNPs等位基因及基因型的分布情況。2.探討MDM4基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)與急性髓系白血病(AML)相關(guān)性。3.研究MDM4基因單體型與急性髓系白血病(AML)之間的關(guān)系。方法:1.MDM4基因12個(gè)SNPs基因型分布情況與急性髓系白血病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)關(guān)系收集192例初發(fā)AML患者骨髓或外周血及192例健康體檢者外周血樣本,分別提取全基因組DNA,將MDM4基因12個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)分別設(shè)計(jì)相應(yīng)的引物,經(jīng)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)擴(kuò)增,所擴(kuò)增的產(chǎn)物通過高分辨熔解曲線技術(shù)(HRM)對(duì)多態(tài)性位點(diǎn)分別進(jìn)行基因型分析;分型后各基因型隨機(jī)抽取3~5個(gè)樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增,所擴(kuò)增的產(chǎn)物送生工生物工程進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證HRM分型的準(zhǔn)確性,比較各個(gè)位點(diǎn)病例組與健康對(duì)照組基因型分布有無差異。2.檢測(cè)MDM4基因表達(dá)水平提取20例初發(fā)AML患者與10例正常對(duì)照組骨髓或外周血樣本的總RNA,運(yùn)用Real Time RT-PCR方法檢測(cè)MDM4基因m RNA的表達(dá)水平,并分析病例組與對(duì)照組MDM4表達(dá)水平是否具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。3.采用Haploview軟件分析MDM4基因單體型與AML之間的相關(guān)性分別統(tǒng)計(jì)192例AML患者與192例健康對(duì)照組10個(gè)SNPs的基因型,按照Haploview軟件格式要求錄入數(shù)據(jù),對(duì)MDM4基因10個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因單體型及連鎖不平衡分析。結(jié)果:1.MDM4基因12個(gè)SNPs中10個(gè)位點(diǎn)能順利進(jìn)行基因分型,HRM基因分型后各基因型與隨機(jī)送生工生物工程公司測(cè)序結(jié)果相符合。MDM4基因rs10900597-G和rs2290854-T等位基因在AML患者中高于健康對(duì)照組;與健康對(duì)照組相比rs2290854-TT基因型在AML患者中明顯升高(P0.05)。2.Real Time RT-PCR方法檢測(cè)MDM4基因m RNA的表達(dá)水平,MDM4基因的表達(dá)在各基因型中無顯著差異。3.單體型關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明,MDM4基因單體型GCTTGGCGGA在AML中的分布比健康對(duì)照組高(P0.05);單體型ACTTGGTGGA在AML中的分布比健康對(duì)照組低(P0.05),結(jié)果具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)論:1.MDM4基因rs10900597-G和rs2290854-T等位基因在AML患者中高于健康對(duì)照組;rs2290854-TT基因型在AML患者中明顯高于健康對(duì)照組。rs2290854-TT可能在AML的發(fā)生中起重要作用,可能作為AML易感性的遺傳標(biāo)記。2.MDM4基因單體型GCTTGGCGGA與AML呈正相關(guān);單體型ACTTGGTGGA與AML呈負(fù)相關(guān)。
【圖文】:

基因分型,測(cè)序,基因,基因型


山西醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文204520429*部分?jǐn)?shù)據(jù)來自 NCBI 的 SNP 數(shù)據(jù)庫(kù)2.1.2 MDM4 基因 10 個(gè) SNP 基因分型通過高分辨熔解曲線(High Resolution Melting, HRM)分析技術(shù)將 192 例 AML患者與 192 例健康對(duì)照組進(jìn)行基因分型,其中 MDM4 基因 12 個(gè) SNP 中有 10 個(gè)位點(diǎn)可以成功分型。從各基因型中隨機(jī)抽取 3 個(gè)送基因測(cè)序驗(yàn)證分型結(jié)果的準(zhǔn)確性,HRM 分型法與測(cè)序結(jié)果呈一致性。MDM4 基因 4 個(gè) SNP 基因分型及測(cè)序結(jié)果,,見下圖 1;其余 6 個(gè) SNP 基因分型結(jié)果見下圖 2(紅色曲線代表 AA 或者 TT 基因型;灰色曲線代表 AG 或者 CT 基因型;藍(lán)色曲線代表 GG 或者 CC 基因型)。

基因分型,等位基因,病例


14圖 2 6 個(gè) SNP 基因分型結(jié)果2.1.3 病例組與健康對(duì)照組 MDM4 基因 10 個(gè) SNP 等位基因及基因型頻率與健康對(duì)照組相比,rs10900597 和 rs2290854 等位基因在病例組中分布差異具有顯著性(P<0.05);rs10900597-G 等位基因和 rs2290854-T 等位基因的 OR(95%CI)分別為 1.235(1.033-1.478)和 1.246(1.029-1.509),與 AML 易感性相關(guān)。相反,rs10900596, rs1563828, rs4252725, rs4252717, rs10900595, rs4245738, rs4252686 和rs4951393 在病例組和健康對(duì)照組差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(見下表 4)。
【學(xué)位授予單位】:山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R733.71

【參考文獻(xiàn)】

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2 胡尚英;鄭榮壽;趙方輝;張思維;陳萬(wàn)青;喬友林;;1989至2008年中國(guó)女性子宮頸癌發(fā)病和死亡趨勢(shì)分析[J];中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)報(bào);2014年02期

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本文編號(hào):2687836

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