【摘要】：探究功能未知基因在腫瘤中的表達(dá)和功能,有助于了解該基因?qū)δ[瘤發(fā)生發(fā)展的影響及其分子機制,對指導(dǎo)癌癥治療具有重要意義。課題組前期研究發(fā)現(xiàn)c1orf109所在染色體1p34.1區(qū)域存在基因協(xié)同共表達(dá)特性,YRDC為其中的一個在癌癥中預(yù)測高表達(dá)的基因,該基因命名為YRDC(yrd C N6-threonylcarbamoyl-transferase domain containing),但生物學(xué)功能仍不清楚。本論文在前期研究的基礎(chǔ)上,重點分析了YRDC基因在肺癌中的表達(dá)情況,檢測了YRDC基因?qū)Ψ伟┘?xì)胞生物學(xué)功能的影響,并初步探究了YRDC基因編碼蛋白可能的生物學(xué)功能。首先,利用生物信息學(xué)分析并結(jié)合TCGA數(shù)據(jù)庫,研究了YRDC基因在肺癌病例組織中的表達(dá),分析其與不同臨床分期、性別、年齡以及吸煙習(xí)慣表達(dá)關(guān)系,進而檢測YRDC基因在肺癌細(xì)胞系的表達(dá)。隨后,構(gòu)建YRDC基因低表達(dá)細(xì)胞株和YRDC過表達(dá)細(xì)胞株,觀察了YRDC基因肺癌細(xì)胞的增殖,遷移和侵襲能力的影響。最后,利用生物信息學(xué)預(yù)測YRDC相互作用蛋白及其在臨床肺癌組織中的表達(dá),并通過構(gòu)建YRDC原核表達(dá)載體,表達(dá)純化YRDC蛋白,進一步確定YRDC蛋白的生物學(xué)活性。結(jié)果表明,YRDC基因非小細(xì)胞肺癌中高表達(dá),但與臨床分期、性別、年齡和吸煙習(xí)慣無顯著差異;YRDC基因在表達(dá)下調(diào)時,細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲受到了抑制,而過表達(dá)YRDC能促進腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。YRDC同源結(jié)構(gòu)分析顯示,人源YRDC與大腸桿菌的YRDC蛋白結(jié)構(gòu)相似度較低,提示它們的生物學(xué)特性可能不同。相互作用蛋白預(yù)測分析結(jié)果提示,YRDC存在多個相互作用分子,相互作用蛋白預(yù)測分析結(jié)果提示,YRDC存在多個相互作用分子,其中UPP1、VPS29、TMSB10以及OSGEPL1等蛋白分子在肺癌組織樣本中與YRDC存在共表達(dá),由此為進一步的深入研究奠定了基礎(chǔ)。蛋白活性檢測發(fā)現(xiàn),YRDC具有t RNA修飾所必需的ATP酶活性,并且顯著高于大腸桿菌的YRDC蛋白。綜上所述,本研究結(jié)果證實YRDC基因在肺癌中高水平表達(dá),并且YRDC基因的表達(dá)變化能夠影響腫瘤細(xì)胞的生物學(xué)特性,人類的YRDC基因編碼蛋白具有t RNA修飾的活性,其分子機制可能和蛋白質(zhì)的翻譯相關(guān)。
【圖文】：

淋巴轉(zhuǎn)移則發(fā)生較晚。肺腺癌是肺癌研究中的癌中 YRDC 的整體表達(dá)情況A 數(shù)據(jù)庫中的肺腺癌病例數(shù)據(jù)部分，共有 570 個病例樣為 59 個，原發(fā)癌類型樣本為 515 個，，樣本數(shù)量足夠提供分析。分析每百萬個轉(zhuǎn)錄本中 YRDC 的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量（圖C 基因分布在 13-18 之間，中位數(shù) 15 左右，而原發(fā)癌樣布在 15-25 之間，中位數(shù)在 20 左右，統(tǒng)計學(xué)上顯著高于C 表達(dá)量（p<0.01）。基因在肺腺癌病例中的表達(dá)明顯高于正常樣本，癌癥中癌癥發(fā)展變化中具有一定的影響和作用，因此檢測癌癥映出某個基因?qū)Π┌Y的重要性。YRDC 可能在肺腺癌的，影響到肺腺癌整體的發(fā)展過程，在全部的癌癥病例中正常樣本，體現(xiàn)出 YRDC 在肺腺癌中過量表達(dá)的穩(wěn)定性影響不是隨機現(xiàn)象，其背后可能具有某種機制，使得 Y展進程當(dāng)中。

肺腺癌中 YRDC 癌癥分期表達(dá)情況RDC 的整體表達(dá)的統(tǒng)計差異性，顯示了 YRDC 基因確實在肺腺癌作用�；蛟诎┌Y的表達(dá)同時可能和癌癥病例的癌癥分期具有相 數(shù)據(jù)庫對癌癥病例進行了詳細(xì)的分期分組，用于分析癌癥基因同系。在肺腺癌的不同分期階段中，基因可能表現(xiàn)出不同的表達(dá)趨在不同階段的表達(dá)差異，能夠具有針對性的研究該階段的表達(dá)特腺癌病例中 YRDC 在不同癌癥分期顯示（圖 3-2），肺腺癌全部的為 4 個分期，其中病例數(shù)量從分期 1 到分期 4 逐漸減少，意味著維持在肺腺癌的第一和第二分期之內(nèi)。在四個分期中，YRDC 基均高于正常樣本，與前文整體表達(dá)一致，各分期之間 YRDC 表達(dá)沒有顯著差異。RDC 基因在肺腺癌的分期之間沒有表達(dá)差異性，提示 YRDC 可能段性表達(dá)升高促進癌癥的發(fā)生發(fā)展，或者是 YRDC 基因在整個肺一直發(fā)揮某種功能，因此表達(dá)量是相對穩(wěn)定的（圖 3-2）。
【學(xué)位授予單位】：哈爾濱工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：R734.2

【參考文獻】

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本文編號：2682742