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金屬蛋白酶ADAMTS18與胃癌預(yù)后相關(guān)性分析及其對胃癌生物學(xué)功能的影響研究

發(fā)布時間:2020-05-22 05:58
【摘要】:研究內(nèi)容:本研究分為三個章節(jié):1、基于TCGA數(shù)據(jù)庫對金屬蛋白酶ADAMTS18與胃癌臨床預(yù)后的關(guān)系研究;2、ADAMTS18基因與胃癌臨床病理特征的關(guān)系研究;3、ADAMTS18基因沉默及過表達(dá)對胃癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響。第一章基于TCGA數(shù)據(jù)庫對金屬蛋白酶ADAMTS18與胃癌臨床預(yù)后的關(guān)系研究目的:探討金屬蛋白酶ADAMTS18在胃癌中的表達(dá)及臨床價值,預(yù)測ADAMTS18調(diào)控腫瘤發(fā)生發(fā)展可能的機(jī)制。方法:從在線分析工具GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)獲取胃癌組織與胃正常組織ADAMTS18基因表達(dá)水平差異。從癌癥基因數(shù)據(jù)庫(the cancer genome atlas,TCGA)收集胃癌患者基因表達(dá)譜和臨床病理資料數(shù)據(jù)集,分析ADAMTS18基因表達(dá)水平與患者臨床病理參數(shù)的相關(guān)性,并利用Kaplan-Meier乘積極限法和Cox比例風(fēng)險回歸模型分析其對患者臨床預(yù)后的影響。利用Gene MANIA和STRING在線數(shù)據(jù)庫構(gòu)建ADAMTS18基因、蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),并富集分析ADAMTS18基因參與腫瘤發(fā)生發(fā)展可能涉及的基因和相關(guān)信號通路。結(jié)果:ADAMTS18基因在胃癌組織中表達(dá)水平明顯高于其在正常胃組織中表達(dá)水平。ADAMTS18基因m RNA在胃癌組織中的表達(dá)水平與腫瘤分級顯著相關(guān)(P0.001),ADAMTS18基因表達(dá)量越高,腫瘤分級越高,惡性程度越高。ADAMTS18表達(dá)越高預(yù)后越差,生存期越短(P=0.002 HR=1.809,95%CI=1.236-2.649)。ADAMTS18基因富集分析涉及到細(xì)胞外基質(zhì)重塑、腫瘤壞死因子反應(yīng)、金屬肽酶活性等相關(guān)基因集。結(jié)論:ADAMTS18基因高表達(dá)是胃癌患者術(shù)后預(yù)后不良因素,可作為判斷患者不良預(yù)后的生物學(xué)標(biāo)志物。第二章ADAMTS18基因與胃癌臨床病理特征的關(guān)系研究目的:探討ADAMTS18基因在胃癌組織中的表達(dá)情況,分析其與患者臨床病理參數(shù)的相關(guān)性。方法:收集2016年10月至2017年2月廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院胃腸腺體外科胃癌患者經(jīng)手術(shù)治療和病理診斷為胃癌的癌組織和癌旁組織40對以及相應(yīng)的臨床病理資料,以免疫組化法檢測ADAMTS18蛋白在胃癌組織及癌旁組織表達(dá)水平,以Trizol法提取癌組織和癌旁組織總RNA,實(shí)時熒光定量PCR檢測ADAMTS18 m RNA表達(dá)水平,并分析癌組織中ADAMTS18mRNA表達(dá)水平與臨床病理參數(shù)相關(guān)性。結(jié)果:免疫組化法證明胃癌組織中ADAMTS18蛋白顯著高于癌旁組織(P0.001),胃癌組織中ADAMTS18基因m RNA表達(dá)水平顯著高于癌旁組織(P=0.001),ADAMTS18基因m RNA表達(dá)水平與腫瘤的分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TNM分期顯著相關(guān)(P=0.013,P=0.001,P=0.001)。結(jié)論:ADAMTS18基因m RNA和蛋白在胃癌組織中表達(dá)水平顯著升高,且胃癌組織中ADAMTS18表達(dá)水平與腫瘤的分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TNM分期顯著相關(guān)。第三章ADAMTS18基因沉默及過表達(dá)對胃癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響目的:探討ADAMTS18基因沉默及過表達(dá)對胃癌細(xì)胞系SGC-7901、MGC-803細(xì)胞增殖、遷移及侵襲力的影響。方法:利用慢病毒介導(dǎo)的基因沉默和過表達(dá)技術(shù),在胃癌細(xì)胞系SGC-7901和MGC-803中構(gòu)建ADAMTS18基因沉默和過表達(dá)的穩(wěn)轉(zhuǎn)株,實(shí)時熒光定量PCR和Western Blot檢測ADAMTS18過表達(dá)和沉默效率,MTT法實(shí)驗(yàn)檢測胃癌細(xì)胞ADAMTS18基因沉默和過表達(dá)后對細(xì)胞增殖能力的影響,劃痕實(shí)驗(yàn)、Transwell實(shí)驗(yàn)檢測ADAMTS18基因沉默和過表達(dá)后對胃癌細(xì)胞系的遷移及侵襲能力的影響。結(jié)果:成功構(gòu)建ADAMTS18基因沉默和過表達(dá)的胃癌細(xì)胞系SGC-7901和MGC-803穩(wěn)轉(zhuǎn)株,MMT法實(shí)驗(yàn)顯示ADAMTS18基因沉默后胃癌細(xì)胞SGC-7901和MGC-803增殖能下降,劃痕實(shí)驗(yàn)、Transwell實(shí)驗(yàn)表明ADAMTS18沉默后胃癌細(xì)胞SGC-7901和MGC-803遷移和侵襲能力減弱,而相反ADAMTS18基因過表則達(dá)促進(jìn)胃癌細(xì)胞系SGC-7901和MGC-803的增殖、遷移和侵襲能力。結(jié)論:慢病毒介導(dǎo)的ADAMTS18基因沉默抑制胃癌細(xì)胞系體外增殖、遷移和侵襲能力;ADAMTS18過表達(dá)促進(jìn)胃癌細(xì)胞系體外增殖、遷移和侵襲能力。
【圖文】:

散點(diǎn)圖,正常組織,人體,基因


SPSS22.0 統(tǒng)計學(xué)軟件被用來統(tǒng)計學(xué)分析。GraphPad Prism v.5.0 用來作基因表達(dá)散點(diǎn)圖,臨床病理相關(guān)性分析采用χ2檢驗(yàn)及 Fisher 確切概率Kaplan-Meier 乘積極限法和 log-rank 檢驗(yàn)法來進(jìn)行生存分析,COX 比例險回歸模型進(jìn)行多因素分析,P< 0.05 認(rèn)為有統(tǒng)計顯著性。2 結(jié)果2.1 胃癌組織與胃正常組織中 ADAMTS18 基因表達(dá)差異從在線分析工具 GEPIA 獲得胃癌組織與胃正常組織表達(dá)差異分析果,納入分析胃癌組織 408 例,正常胃組織 211 例。結(jié)果顯示 ADAMT基因在胃癌組織中明顯高表達(dá),但結(jié)果卻顯示與正常胃組織中 ADAMT基因表達(dá)水平比較,差異無統(tǒng)計學(xué)顯著性(圖 1-1)。

散點(diǎn)圖,散點(diǎn)圖,數(shù)據(jù)庫,臨床病理學(xué)


圖 1-2 TCGA 數(shù)據(jù)庫中基因 ADAMTS18 表達(dá)散點(diǎn)圖Figure1-2 Scatter plots ofADAMTS18 expression level in TCGA18 基因表達(dá)與臨床病理學(xué)參數(shù)相關(guān)性 數(shù)據(jù)庫總共納入 300 例各項(xiàng)臨床病理資料都完整 例,女性 109 例,,年齡 30-90 歲,中位年齡為 67 歲與胃癌患者臨床病理特征的關(guān)系見表 1-1。分析
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R735.2

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2675547

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