KDM5C在人肝癌細胞中功能的初步研究
發(fā)布時間:2020-05-12 02:25
【摘要】:原發(fā)性肝癌位于惡性腫瘤死亡率前列,具有發(fā)病率高,不易發(fā)現(xiàn),病情發(fā)展迅速等特點,是現(xiàn)代分子細胞生物學,醫(yī)學的研究熱點。KDM5C(JARID1C or SMCX)屬于組蛋白去甲基化酶家族,位于X染色體,含有一個ARID結(jié)構(gòu)域,一個JmjC結(jié)構(gòu)域,一個JmjN結(jié)構(gòu)域和兩個PHD型鋅指的蛋白質(zhì),其中JmjC結(jié)構(gòu)域主要發(fā)揮特異性去除H3K4me3的甲基殘基的功能,而H3K4me3是一個重要的組蛋白修飾marker,可以影響其他基因的轉(zhuǎn)錄激活。本課題通過實時定量PCR檢測了KDM5C在人肝癌及癌旁組織的表達,結(jié)果顯示相對于癌旁組織,KDM5C在肝癌組織中的表達上調(diào)。蘇木精伊紅(HE)染色和免疫組化的結(jié)果顯示,KDM5C基因在肝癌組織的細胞核和細胞質(zhì)中均有表達,但主要集中于細胞核內(nèi)。為研究KDM5C在肝癌細胞中的功能,本文利用CRISPR/Cas9對KDM5C進行了敲除并建立了穩(wěn)定的細胞系。首先利用CRISPR/Cas9的靶點設計網(wǎng)站進行KDM5C敲除位點的設計選擇,隨后將構(gòu)建好的靶點連入pX458載體,轉(zhuǎn)染肝癌HepG2細胞,利用有限稀釋法建立KDM5C敲除細胞系(KDM5C-KO)并通過測序和Western Blot進行了敲除驗證。其次本論文研究了KDM5C對肝癌細胞生物學行為的影響。MTT增殖和克隆形成實驗的結(jié)果顯示,KDM5C敲除顯著抑制了肝癌細胞HepG2的增殖和克隆形成;PI染色發(fā)現(xiàn)KDM5C敲除后,細胞S期比例下降,細胞增殖受到抑制;進一步研究發(fā)現(xiàn)KDM5C敲除促進了肝癌細胞的凋亡;細胞劃痕和Transwell小室實驗結(jié)果表明KDM5C敲除顯著抑制了細胞遷移侵襲能力。綜上所述,本研究分析了KDM5C在肝癌中的表達及定位,通過CRISPR/Cas9進行KDM5C敲除并建立了穩(wěn)轉(zhuǎn)敲除細胞系。KDM5C基因敲除顯著抑制了肝癌細胞增殖,遷移,侵襲,克隆形成,以上結(jié)果表明KDM5C通過促進腫瘤的發(fā)生在肝癌細胞中發(fā)揮功能。
【圖文】:
-3-圖 1-2 不同甲基化水平的精氨酸結(jié)構(gòu) 組蛋白去甲基化酶組蛋白去甲基化酶,,顧名思義是可以脫去組蛋白甲基化的一類酶,主 類和 jumonji 類[6]。哈佛醫(yī)學院的施楊教授在 2004 年發(fā)現(xiàn)了第一個組化酶[4],賴氨酸特異性的去甲基化酶 1(LSD1)。LSD1 是一個 FAD 依酶,它能夠特異性脫去單甲基化和二甲基化的組蛋白賴氨酸殘基上的隨著表觀遺傳學的興起,發(fā)現(xiàn)了更多的組蛋白脫甲基化酶家族,從作分兩種主要的組蛋白去甲基化酶:黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD)依賴性 Fe2+與 α-酮戊二酸依賴性雙加氧酶。二者作用機理如圖 1-3 所示[8]。從我們可以看出前者只能催化一甲基或二甲基基團,而不能去掉賴氨酸
圖 1-3 兩種組蛋白去甲基化酶作用機理(上部為 FAD 依賴性,下部為 α-酮戊二酸依賴性)但是后者就不需要這個 N 上的質(zhì)子參與反應,因此三個甲基化修飾都可以被去掉。這第二類含有 JmjC 結(jié)構(gòu)域的去甲基化酶是由北卡羅來納大學的張毅教授于2007 年發(fā)現(xiàn)。研究表明,JmjC 結(jié)構(gòu)域在空間上形成 8 個 β 折疊,能夠結(jié)合二價亞鐵離子和 α-酮戊二酸[8]。從而滿足 Fe2+與 α-酮戊二酸依賴性雙加氧酶催化賴氨酸三甲基化的去除的條件,可以相應的影響端粒的長度,是作為表觀遺傳修飾的重要途徑,可能調(diào)控機體增殖,衰老,腫瘤發(fā)生等重要生物學過程。1.3 KDM5C 及其研究進展1.3.1 KDM5C 概述KDM5C (JARID1C),英文名 Lysine (K)-specific demethylase 5C,中文名賴氨酸特異性去甲基化酶 5C,位于 X 染色體上。 KDM5C 是蛋白質(zhì)編碼基因,編碼 1560
【學位授予單位】:哈爾濱工業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R735.7
本文編號:2659476
【圖文】:
-3-圖 1-2 不同甲基化水平的精氨酸結(jié)構(gòu) 組蛋白去甲基化酶組蛋白去甲基化酶,,顧名思義是可以脫去組蛋白甲基化的一類酶,主 類和 jumonji 類[6]。哈佛醫(yī)學院的施楊教授在 2004 年發(fā)現(xiàn)了第一個組化酶[4],賴氨酸特異性的去甲基化酶 1(LSD1)。LSD1 是一個 FAD 依酶,它能夠特異性脫去單甲基化和二甲基化的組蛋白賴氨酸殘基上的隨著表觀遺傳學的興起,發(fā)現(xiàn)了更多的組蛋白脫甲基化酶家族,從作分兩種主要的組蛋白去甲基化酶:黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD)依賴性 Fe2+與 α-酮戊二酸依賴性雙加氧酶。二者作用機理如圖 1-3 所示[8]。從我們可以看出前者只能催化一甲基或二甲基基團,而不能去掉賴氨酸
圖 1-3 兩種組蛋白去甲基化酶作用機理(上部為 FAD 依賴性,下部為 α-酮戊二酸依賴性)但是后者就不需要這個 N 上的質(zhì)子參與反應,因此三個甲基化修飾都可以被去掉。這第二類含有 JmjC 結(jié)構(gòu)域的去甲基化酶是由北卡羅來納大學的張毅教授于2007 年發(fā)現(xiàn)。研究表明,JmjC 結(jié)構(gòu)域在空間上形成 8 個 β 折疊,能夠結(jié)合二價亞鐵離子和 α-酮戊二酸[8]。從而滿足 Fe2+與 α-酮戊二酸依賴性雙加氧酶催化賴氨酸三甲基化的去除的條件,可以相應的影響端粒的長度,是作為表觀遺傳修飾的重要途徑,可能調(diào)控機體增殖,衰老,腫瘤發(fā)生等重要生物學過程。1.3 KDM5C 及其研究進展1.3.1 KDM5C 概述KDM5C (JARID1C),英文名 Lysine (K)-specific demethylase 5C,中文名賴氨酸特異性去甲基化酶 5C,位于 X 染色體上。 KDM5C 是蛋白質(zhì)編碼基因,編碼 1560
【學位授予單位】:哈爾濱工業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R735.7
【參考文獻】
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1 馬潔稚;組蛋白H3K4甲基化水平及特異性修飾酶在子宮內(nèi)膜異位癥中的表達研究[D];中南大學;2012年
本文編號:2659476
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