【摘要】：目的篩選胰腺導(dǎo)管腺癌中差異表達(dá)的長(zhǎng)鏈基因間非編碼RNA,構(gòu)建胰腺導(dǎo)管腺癌的預(yù)后模型,為評(píng)估患者預(yù)后提供參考。方法從美國(guó)腫瘤基因圖譜下載146例胰腺導(dǎo)管腺癌及4例癌旁組織lincRNA的轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù),首先使用R軟件篩選出差異表達(dá)的lincRNA,然后去除臨床資料不完整和總生存期小于一個(gè)月的胰腺導(dǎo)管腺癌患者,最終納入128例胰腺導(dǎo)管腺癌患者,并通過(guò)單因素比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型篩選出與胰腺導(dǎo)管腺癌生存時(shí)間密切相關(guān)的lincRNA。然后將128例胰腺導(dǎo)管腺癌患者按照隨機(jī)分配的原則,分為訓(xùn)練組和驗(yàn)證組各64例,使用多因素Cox回歸模型在訓(xùn)練組中以前面篩選出來(lái)的與胰腺導(dǎo)管腺癌生存時(shí)間相關(guān)的lincRNA構(gòu)建預(yù)后模型,然后采用赤池信息量準(zhǔn)則篩選出胰腺導(dǎo)管腺癌的最佳預(yù)后模型,以預(yù)后模型在訓(xùn)練集的中位值作為分界值,將訓(xùn)練組和驗(yàn)證組分別分為高風(fēng)險(xiǎn)組和低風(fēng)險(xiǎn)組,當(dāng)訓(xùn)練組和驗(yàn)證組中的高風(fēng)險(xiǎn)組與其對(duì)應(yīng)的低風(fēng)險(xiǎn)組的總體生存率均有差異時(shí)意味著胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)后模型成立。然后使用在線網(wǎng)頁(yè)多試驗(yàn)矩陣對(duì)預(yù)后模型中的lincRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),并采用String在線網(wǎng)頁(yè)繪制靶基因的蛋白網(wǎng)絡(luò)互作圖以及使用David軟件分析基因本體論富集和京都基因與基因組百科全書(shū)通路。此外,收集20例胰腺導(dǎo)管腺癌患者的新鮮癌組織和癌旁組織標(biāo)本,對(duì)模型中的lincRNA的表達(dá)進(jìn)行驗(yàn)證,并驗(yàn)證胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)后模型在收集人群中的預(yù)后評(píng)估價(jià)值。結(jié)果經(jīng)過(guò)差異分析,篩出44個(gè)差異表達(dá)的lincRNA,其中表達(dá)上調(diào)的為3個(gè),表達(dá)下調(diào)的為41個(gè),其中8個(gè)lincRNA與胰腺導(dǎo)管腺癌患者生存相關(guān)。胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)后模型=-0.399⒋(RPl1-147L13.15表達(dá)量)-0.262⒋(RPll-452H21.4表達(dá)量)。該預(yù)后模型顯示高風(fēng)險(xiǎn)組在訓(xùn)練組(p=0.009)、驗(yàn)證組(p=0.035)、總?cè)巳?p=0.001)、男性組(p=0.035)、女性組(p=0.021)、年齡大于65歲組(p=0.000)、年齡小于等于65歲組(p=0.000)中的總體生存率均低于低風(fēng)險(xiǎn)組。此外預(yù)后模型胰腺導(dǎo)管腺癌的訓(xùn)練組、驗(yàn)證組、總?cè)巳�、男性組、女性組、年齡大于65歲組及年齡小于等于65歲組中的5年生存率的受試者工作特征曲線下面積分別為0.738、0.754、0.762、0.729、0.753、0.754、0.756。與 RP11-147L13.15 最相關(guān)的靶基因?yàn)?TRIM52,與RP11-452H21.4最相關(guān)的靶基因?yàn)镚AB2,此外,與靶基因密切相關(guān)的前三個(gè)基因本體論富集區(qū)域分別為過(guò)渡金屬離子結(jié)合(p=0.000)、鋅離子結(jié)合(p=0.000)和核質(zhì)(p=0.002)。而在通路方面,只有神經(jīng)鞘脂的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(p=0.031)這條通路與靶基因密切相關(guān)。20例胰腺導(dǎo)管腺癌組織中的RP11-147L13.15和RP11-452H21.4的表達(dá)均低于癌旁組織中的表達(dá)(p0.001),胰腺導(dǎo)管腺癌高風(fēng)險(xiǎn)組在總?cè)巳?p=0.013)、男性組(p=0.019)、女性組(p=0.021)、年齡大于65歲組(p=0.046)和年齡小于等于65歲組(p=0.008)中的總體生存率均明顯低于低風(fēng)險(xiǎn)組,而胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)后模型對(duì)于總?cè)巳�、男性組、女性組、年齡大于65歲組和年齡小于等于65歲組的胰腺導(dǎo)管腺癌患者5年生存率的受試者工作曲線下面積分別為0.681、0.762、0.785、0.642 和 0.966。結(jié)論1.胰腺導(dǎo)管腺癌lincRNA預(yù)后模型(RP11-147L13.15和RP11-452H21.4)對(duì)胰腺導(dǎo)管腺癌患者預(yù)后的評(píng)估具有一定的參考價(jià)值。2.胰腺導(dǎo)管腺癌lincRNA預(yù)后模型(RP11-147L13.15和RP11-452H21.4)是胰腺導(dǎo)管腺癌患者的獨(dú)立預(yù)后因子。
【圖文】：

基于ｌｉｎｃＲＮＡ構(gòu)建的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)后模型及其表達(dá)驗(yàn)證３．結(jié)果逡逑腺癌ｌｉｎｃＲＮＡ預(yù)后模型的建立逡逑腺導(dǎo)管腺癌患者的差異表達(dá)ｌｉｎｃＲＮＡ逡逑載的１４６例胰腺導(dǎo)管腺癌和４例癌旁組織的ｌｌｉｎｃＲＮＡ，經(jīng)過(guò)差異分析，篩出４４個(gè)差異上調(diào)的為３個(gè)（表１），表達(dá)下調(diào)的為４１個(gè)（

碩士學(xué)位論文如圖７所示，此外，如圖８所示，列出了與靶基因密切相關(guān)的前１０，前三條分別為過(guò)渡金屬離子結(jié)合（＞＝０．０００）、鋅離子結(jié)合（；？＝００＝０．００２）。而在ＫＥＧＧ通路方面，只有神經(jīng)鞘脂的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通３１）這條通路與靶基因密切相關(guān)，如表６所示。逡逑丨邐ｍ邋一逡逑
【學(xué)位授予單位】：湖南師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號(hào)】：R735.9

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本文編號(hào)：2638450